| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,524,413 | A→G | 100% | I515V (ATT→GTT) | mrcA → | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,524,413 | 0 | A | G | 97.1% | 330.4 / ‑0.8 | 102 | I515V (ATT→GTT) | mrcA | penicillin‑binding protein 1a, murein transglycosylase and transpeptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (3/0); new base G (55/44); total (58/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.90e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GGCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCAAC > NC_000913/3524316‑3524509 | ggCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTCCTGACTGGCGGCCGAGGAACTCACGACCGCAGTATGCTGGTCCAGtt > 2:1727542/1‑100 (MQ=255) aaGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGc < 2:126855/100‑1 (MQ=255) aGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCt < 2:1318526/100‑1 (MQ=255) aGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCt < 1:2450374/100‑1 (MQ=255) gTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCtt > 1:479183/1‑100 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACg > 1:362989/1‑100 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACg > 1:1650467/1‑100 (MQ=255) tGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACg > 1:339768/1‑100 (MQ=255) gTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGt > 2:167947/1‑100 (MQ=255) gTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGt > 1:2155413/1‑100 (MQ=255) ttGAACGGTGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACTACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTc > 2:2198314/1‑100 (MQ=255) ttGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGCTGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCATTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTc > 2:1671452/1‑100 (MQ=255) tGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCa > 1:438134/1‑100 (MQ=255) tGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCa > 1:751899/1‑100 (MQ=255) tGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCa < 1:2348804/100‑1 (MQ=255) tGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCa > 2:84368/1‑100 (MQ=255) gAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAg > 1:2190930/1‑100 (MQ=255) gAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAg > 2:1840009/1‑100 (MQ=255) aaCGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAgg > 2:2096368/1‑100 (MQ=255) aCGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAggg < 1:1974849/100‑1 (MQ=255) aCGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAggg < 1:134980/100‑1 (MQ=255) cGATGTGCCAATTTCTCGCTGTGATGCAAGCGCCGGCTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAggg < 2:1727570/99‑1 (MQ=255) tgtgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTg < 1:1017665/100‑1 (MQ=255) gtgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTgg > 2:897468/1‑100 (MQ=255) tgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGc > 2:401175/1‑96 (MQ=255) tgCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGCTCGCTTACGCCCGGGGCTgg > 2:108928/1‑99 (MQ=255) atctaaTTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTggg < 2:2049764/96‑1 (MQ=255) gCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGt > 2:1268508/1‑100 (MQ=255) gCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGt < 1:144438/100‑1 (MQ=255) ccAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc < 2:154314/100‑1 (MQ=255) ccAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc < 1:360790/100‑1 (MQ=255) ccAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc > 1:1961424/1‑100 (MQ=255) ccAATTTCGCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTTTGACTGGCGGCCGAAGAACTCACCACTGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc < 2:1397421/100‑1 (MQ=255) cAATTTCTCTCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTc < 2:1239461/99‑1 (MQ=255) cAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCa > 1:2234647/1‑100 (MQ=255) aaTTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTgggagat > 1:2049778/1‑96 (MQ=255) ctcGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGaa > 1:969817/1‑100 (MQ=255) tcGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGaaa < 2:54947/100‑1 (MQ=255) tcGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGaaa < 1:2554226/100‑1 (MQ=255) tcGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGaaa < 2:2146692/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGaaaa < 2:324323/100‑1 (MQ=255) cGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGaaaa < 2:333773/100‑1 (MQ=255) gggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgt < 1:801167/100‑1 (MQ=255) gggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgt > 2:2512088/1‑100 (MQ=255) gggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGAAGCGGAAGAACTCACTAGAGGAGTATGCTGGTCCAGTTGGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgt > 2:2130969/1‑100 (MQ=255) ggATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtg > 2:1999741/1‑100 (MQ=255) gATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtgg > 1:2288425/1‑100 (MQ=255) aTGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtggt < 1:696881/100‑1 (MQ=255) tGCAAGTGCGGGTGCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGATAAGAAAGAAAAAAAACgtggtg < 2:769521/100‑1 (MQ=255) tGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtggtg < 1:2308043/100‑1 (MQ=255) gCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGa > 1:211625/1‑100 (MQ=255) cAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtggtg > 1:2063740/1‑98 (MQ=255) aaGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATg < 1:2000988/100‑1 (MQ=255) aaGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATg < 1:1998270/100‑1 (MQ=255) aaGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGGCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACgtgg < 2:1201562/95‑1 (MQ=255) gTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGt > 1:579517/1‑100 (MQ=255) tGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTa < 1:2533172/100‑1 (MQ=255) gCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGt < 2:1732134/98‑1 (MQ=255) ggtCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGATCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACgcgc > 1:1734386/3‑100 (MQ=255) gTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACgcgc > 2:906046/1‑100 (MQ=255) tCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCaa > 1:1606592/1‑100 (MQ=255) tGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATg > 2:468177/1‑100 (MQ=255) tGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATg > 2:351727/1‑100 (MQ=255) gACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGc > 2:723025/1‑100 (MQ=255) gACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGc > 1:580825/1‑100 (MQ=255) gACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGc > 2:2104732/1‑100 (MQ=255) aCTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCg < 2:2234633/100‑1 (MQ=255) cTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCgg < 1:474983/100‑1 (MQ=255) cTGGCAGCCGAAGAACTCACCACAGTAGCATGCTGGTCCAGTTCGCTTCCCTCAGGGGCCGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTCCgcgc > 2:1618942/1‑93 (MQ=255) ggCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGc < 1:1819452/100‑1 (MQ=255) gCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCg < 1:1176817/100‑1 (MQ=255) cAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCg > 1:2329089/1‑99 (MQ=255) cAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGa > 1:861111/1‑100 (MQ=255) cGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATggg > 2:1023788/1‑100 (MQ=255) gaagaaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGc > 2:751864/1‑100 (MQ=255) gaaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTc > 1:784836/1‑100 (MQ=255) aaCTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGTAATGCGGGCGATGGGCGTCg < 2:1630021/100‑1 (MQ=255) cTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGAc > 1:35405/1‑100 (MQ=255) tCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGCCATGGTACGCCCAACGCGGGCgc > 2:2341858/1‑87 (MQ=255) accaccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTAc < 2:235919/100‑1 (MQ=255) ccaccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTAca > 1:737802/1‑99 (MQ=255) ccaccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACg > 2:696523/1‑100 (MQ=255) caccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGc < 1:1465308/100‑1 (MQ=255) caccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCGGGGTCAGGCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGGCGACTACGc > 2:1014154/1‑100 (MQ=255) accGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCt < 1:1410876/100‑1 (MQ=255) ccGCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTg > 2:672707/1‑100 (MQ=255) gCAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCa < 1:751871/100‑1 (MQ=255) cAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAg < 1:2337723/100‑1 (MQ=255) cAGTATGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGCGGCTGCGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGTCGATGGGCGTCGACGACGCTGc < 2:850440/98‑1 (MQ=255) aTGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAata < 2:1919106/100‑1 (MQ=255) aTGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAata > 2:179266/1‑100 (MQ=255) tGCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAatat > 2:624592/1‑100 (MQ=255) gCTGGTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATc > 2:150070/1‑100 (MQ=255) ggTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGc < 1:2441744/100‑1 (MQ=255) gTCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGCCTACGCTGCAGAATATCTGCa > 2:1945162/1‑100 (MQ=255) tCCAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGcga > 2:609782/1‑98 (MQ=255) ccAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCAAc > 2:1967161/1‑100 (MQ=255) ccAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCAAc < 1:624664/100‑1 (MQ=255) ccAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCAAc < 1:334621/100‑1 (MQ=255) ccAGTTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCCTCGGCTACGCTGCAGAATATCTGCAAc > 2:2293492/1‑100 (MQ=255) | GGCAAGTATGTTGAACGATGTGCCAATTTCTCGCTGGGATGCAAGTGCCGGTTCTGACTGGCAGCCGAAGAACTCACCACCGCAGTATGCTGGTCCAATTCGCTTACGTCAGGGGCTGGGTCAGTCGAAAAACGTGGTGATGGTACGCGCAATGCGGGCGATGGGCGTCGACTACGCTGCAGAATATCTGCAAC > NC_000913/3524316‑3524509 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |