| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 720,946 | C→T | 100% | intergenic (+106/+110) | ybfK → / ← kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 720,946 | 0 | C | T | 98.9% | 301.7 / ‑4.4 | 94 | intergenic (+106/+110) | ybfK/kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (48/45); total (49/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.36e-01 | |||||||||||
AAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTA > NC_000913/720849‑721042 | aaGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAg < 1:2225517/100‑1 (MQ=255) aGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGt > 1:556113/1‑100 (MQ=255) aGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGt > 2:1750145/1‑100 (MQ=255) ggTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTa > 1:2141095/1‑100 (MQ=255) gTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTaa < 2:1257091/100‑1 (MQ=255) gTGAAGATATTCTATCCAAGAAATACTGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTaa < 2:1843633/100‑1 (MQ=255) tGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAat > 1:73650/1‑100 (MQ=255) tGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAat > 1:2019329/1‑100 (MQ=255) gAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAata > 2:1043421/1‑100 (MQ=255) gAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAAGTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAata < 1:2426384/100‑1 (MQ=255) atTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAat < 1:750143/100‑1 (MQ=255) tCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAatat > 2:541832/1‑100 (MQ=255) cTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTGATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATAtt > 1:1245415/1‑100 (MQ=255) tATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTg > 2:1334299/1‑100 (MQ=255) tATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTg > 1:335599/1‑100 (MQ=255) nccAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGaa > 1:847869/2‑100 (MQ=255) ccAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGaa < 1:1456810/99‑1 (MQ=255) aagAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTg < 2:1872188/98‑1 (MQ=255) gAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTg < 2:1482981/98‑1 (MQ=255) aaTACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTAt > 2:586503/1‑100 (MQ=255) tACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTAttt > 2:850034/1‑100 (MQ=255) cGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTAttttt > 1:2260905/1‑100 (MQ=255) ggTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtg > 2:2319122/1‑100 (MQ=255) ggTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtg > 1:659794/1‑100 (MQ=255) ggTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtg < 1:2187905/100‑1 (MQ=255) ggTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtg < 2:1122014/100‑1 (MQ=255) ggTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtg < 1:1289949/100‑1 (MQ=255) ttGAACTGTGAATGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtgtg < 2:179415/100‑1 (MQ=255) ttGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtgtg < 2:186877/100‑1 (MQ=255) gAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtgtgtg > 1:2129645/1‑100 (MQ=255) gAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTtgtgtg > 2:891496/1‑100 (MQ=255) aaCTGTGAAGGTTATCAATAAAAAATTATCAATCTAAATTTATTTAATGATGATCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTAtttt < 2:516421/93‑1 (MQ=255) aaCTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTgtgtgt > 2:953810/1‑100 (MQ=255) aCTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGtgtt > 1:248086/1‑100 (MQ=255) tgtgAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGtgttgt > 2:1288219/1‑100 (MQ=255) tgtgAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGtgttgt < 1:2036568/100‑1 (MQ=255) ctgAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTgttgtt < 1:2071778/99‑1 (MQ=255) gAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTgttgtta > 2:2071764/1‑98 (MQ=255) gAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTa > 1:505224/1‑100 (MQ=255) aGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAg > 2:802469/1‑100 (MQ=255) gTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATTAAATATTGAATTGTTAGTTTTGTGTGTTGTTTAAGa < 1:1804097/99‑1 (MQ=255) gTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGAt < 2:324999/100‑1 (MQ=255) tGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATa > 1:1014530/1‑100 (MQ=255) tGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATa > 1:186874/1‑100 (MQ=255) tGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATa < 1:1144516/100‑1 (MQ=255) aaaaaaaaaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATACAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATa < 2:1363352/92‑1 (MQ=255) aTCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATaaa > 1:1534039/1‑100 (MQ=255) tCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATaaaa > 1:2531430/1‑100 (MQ=255) cAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATaaaaa > 1:2341510/1‑100 (MQ=255) aTAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGc < 1:2107307/100‑1 (MQ=255) aaaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCg < 1:1144260/100‑1 (MQ=255) aaaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCg < 1:400898/100‑1 (MQ=255) aaaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGt < 1:1150493/100‑1 (MQ=255) aaaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGta > 2:1313475/1‑100 (MQ=255) aaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtat > 1:2482116/1‑100 (MQ=255) aaaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtat > 1:2482350/1‑100 (MQ=255) aaTGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatt < 1:210975/100‑1 (MQ=255) tGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtattta < 2:2111325/100‑1 (MQ=255) gATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTTTTTTTTTTTTAAGATAAAAAGCCGtatttgt > 2:1555654/1‑98 (MQ=255) gATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAAATATAAAGCTGtatttat > 2:2482552/1‑100 (MQ=255) aTCACTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTATTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTAAAGATAAAAAGTCGtatttatt > 2:725571/1‑100 (MQ=255) cAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat > 1:1527365/1‑100 (MQ=255) aTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAATATATTGAATTGTTATTTTTTTGTGTTTATTATGATAAAAAGTCGTATttattatt > 2:347108/1‑99 (MQ=255) aTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattatta < 1:1832904/100‑1 (MQ=255) tCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTATTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTAc < 2:2486479/100‑1 (MQ=255) cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACg < 2:2260891/100‑1 (MQ=255) cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGGTTAAGATAAAAAGCCGTATTTAGTATTACg > 1:378159/1‑100 (MQ=255) ttAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTTTTTTTTGTTTAAGATAAAAAGCTGTATTTATTATTActt > 2:442800/1‑98 (MQ=255) aaTTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCt > 1:369598/1‑100 (MQ=255) aaTTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCt > 1:367681/1‑100 (MQ=255) aaTTTATTTAATGATGAGATTTTTACTTCGTAATATAAAATATTAAATTGTTATTATTGTGTGTTGTTTAATATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCt < 2:2545556/100‑1 (MQ=255) atttatttAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGTATTGTTATTTTTGTGTTTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTGCGGc < 2:210192/98‑1 (MQ=255) atttatttAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTTTGTATTATTTAAGATAAAAAGCTGTATTTTTTGTTATGGttt > 2:2308609/1‑100 (MQ=255) atttatttAATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt < 2:2477691/100‑1 (MQ=255) tttatttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCttt > 1:2052928/1‑100 (MQ=255) ttatttaATGATTAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTtta < 2:2162130/100‑1 (MQ=255) ttatttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAACCGTATTTATTATTACTGCTtta > 2:1144196/1‑100 (MQ=255) atttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCttttta < 1:1673178/100‑4 (MQ=37) ttaATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatta < 1:850041/100‑1 (MQ=255) taATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaattaa < 1:1293389/100‑1 (MQ=255) taATGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaattaa > 1:1507718/1‑100 (MQ=255) aaTGATGAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTtaattaat > 1:477628/1‑100 (MQ=255) atgatgAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGATTTGTTATTTTTGTGTGATGTTTAAGATAAAAAAACGTATTTATTATTATGGCTttaatta > 2:2446885/1‑97 (MQ=255) atgatgAGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata < 1:1178817/100‑1 (MQ=255) tgatgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCAGTATTTATTATTACGGTTTTAATtaataa > 2:2151592/1‑100 (MQ=255) gatgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATCTTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAACGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaa < 2:1537998/100‑1 (MQ=255) gatgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaa < 1:1163941/100‑1 (MQ=255) gatgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaa < 1:442573/100‑1 (MQ=255) gatgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatcttaaa < 2:2141081/100‑11 (MQ=21) tgaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAag < 1:1043429/100‑1 (MQ=255) gaGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAagg < 2:2052914/100‑1 (MQ=255) aGCTTTTTACTTAGTAATATAAAATCTTGAATTCTTATTTTTTTGTCTTTTTTAAAATAACAAGCCGTATTTATTATTCCGGCTTTAATTAATAAAag > 2:2023758/1‑98 (MQ=255) gCTTTTTACTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggca < 2:967485/100‑1 (MQ=255) aCTTAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGAAAAAAAAAAAAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTa < 2:1995850/100‑1 (MQ=255) | AAGGTGAAGATATTCTATCCAGGAAATACGGTTGAACTGTGAAGGTGATCAATAAAAAATGATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTA > NC_000913/720849‑721042 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |