| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 931,952 | C→T | 100% | V33V (GTG→GTA) | trxB ← | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 931,952 | 0 | C | T | 97.0% | 313.9 / ‑0.2 | 98 | V33V (GTG→GTA) | trxB | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/2); new base T (46/49); total (47/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
TAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCC > NC_000913/931856‑932047 | taataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGtaca > 2:372806/1‑100 (MQ=255) aataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcag > 2:391089/1‑100 (MQ=255) aataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcag > 1:1475646/1‑100 (MQ=255) aataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCAcag < 2:1977189/100‑1 (MQ=255) aataaCGGACCGGCCAGATCGTTTGGAACGCCAGGCCAGTATCACACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGtaca > 2:1049855/1‑99 (MQ=255) ataaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcagg > 1:1512934/1‑100 (MQ=255) taaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggt < 2:952378/100‑1 (MQ=255) taaCGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggt > 2:2556470/1‑100 (MQ=255) cGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgc > 2:208161/1‑100 (MQ=255) cGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgc > 1:1519269/1‑100 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgca < 2:1667602/100‑1 (MQ=255) ggACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGCGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCCTGCCGGTAATCAGTAcaggttgca > 2:894925/1‑100 (MQ=255) aCCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcagg < 1:25755/100‑1 (MQ=255) ctggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggt < 1:1231321/98‑1 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggt > 1:1752117/1‑100 (MQ=255) ccGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggt > 1:2173751/1‑100 (MQ=255) ggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTGCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggtt > 2:1573305/1‑99 (MQ=255) ggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggttg > 2:2255779/1‑100 (MQ=255) ggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggttg > 1:425426/1‑100 (MQ=255) ggTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTAcaggttgcaggtag > 2:1231313/1‑98 (MQ=255) gTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTgg < 1:1583623/100‑1 (MQ=255) gTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTgg < 1:268376/100‑1 (MQ=255) cAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTACATGCCGGTAATCAGTACAGGTCGCAGGTTGgcg > 1:211364/1‑100 (MQ=255) aGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgcgc < 2:1545937/100‑1 (MQ=255) gATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgcgcg < 2:2479415/100‑1 (MQ=255) gATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgcgcg > 1:1771379/1‑100 (MQ=255) gATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgcgcg > 1:880570/1‑100 (MQ=255) tCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCTACTTCCGGGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgcgcgcg < 2:1860472/100‑1 (MQ=255) tCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgcgcgcg > 1:569294/1‑100 (MQ=255) tCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGgcgcgcg < 1:768074/100‑1 (MQ=255) cGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGgcgcgcgc < 2:2024723/100‑1 (MQ=255) gTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGcgcc > 2:1916110/1‑100 (MQ=255) ttGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGGCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGcgccgc < 2:1373032/100‑1 (MQ=255) tGGATCGCCGGGCCAGTTTTACACTTCCGTGGTAGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCACGACGGTAATCAGTACAGGCTGCAGGTTGGCGCGCGCcgcg < 2:1260052/100‑1 (MQ=255) tGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCcgcg < 1:1117410/100‑1 (MQ=255) tGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGACGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCcgcg < 1:1019177/100‑1 (MQ=255) ggATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGt < 1:2556486/100‑1 (MQ=255) gATCGCCAGGGCAGTTTTCCGCTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCAGGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa < 2:726959/100‑1 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa > 1:1167390/1‑100 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa < 2:1593798/100‑1 (MQ=255) gATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTa < 2:1033954/100‑1 (MQ=255) aTCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAg < 1:363526/100‑1 (MQ=255) tCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGa > 1:78065/1‑100 (MQ=255) ccaggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcag < 2:493800/100‑1 (MQ=255) ccaggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcag > 1:86346/1‑100 (MQ=255) caggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagc < 1:1204378/100‑1 (MQ=255) caggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATAAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCTCCGCGTAGAcagc < 2:1585166/100‑1 (MQ=255) tctccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagca < 1:1761332/97‑1 (MQ=255) ggccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCC‑TTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACagcagc > 1:2386294/1‑100 (MQ=255) gccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACagcagc > 1:1702450/1‑100 (MQ=255) ccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGAcagcaaga > 2:1761319/1‑97 (MQ=255) ccagTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCg > 2:1674436/1‑100 (MQ=255) atttttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCg < 2:567954/96‑1 (MQ=255) agTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgt > 1:2024266/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTTTTTTTTTTTATTCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg > 2:2247680/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 1:2437692/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 1:18108/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 2:809256/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGgtg < 1:2520409/100‑1 (MQ=255) ttCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTAt > 2:447375/1‑100 (MQ=255) tCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATc < 2:982529/100‑1 (MQ=255) cACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATccc > 1:2014098/1‑100 (MQ=255) cTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCccgc > 1:855698/1‑100 (MQ=255) ttCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCccgcc > 1:2292979/1‑100 (MQ=255) tCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCccgccg > 1:2500028/1‑100 (MQ=255) ccGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCgg < 2:969670/100‑1 (MQ=255) cGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCggg < 2:1521675/100‑1 (MQ=255) cGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCggg < 1:223144/100‑1 (MQ=255) cGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGAGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCggg < 1:2503302/100‑1 (MQ=255) gtggtggtgGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGc < 2:2497620/100‑1 (MQ=255) tggtggtggTCAGTTGGCTGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCTCGCCGGGcc < 2:850718/100‑1 (MQ=255) tggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGa > 1:830946/1‑100 (MQ=255) ggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGaa > 2:1459805/1‑100 (MQ=255) ggtggtCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGaa > 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aGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGa > 1:1260770/1‑100 (MQ=255) gTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGAt > 1:1321470/1‑100 (MQ=255) ttGGCTGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATa < 1:890748/100‑1 (MQ=255) ttGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATa < 2:1990048/100‑1 (MQ=255) gccgccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCAGTCTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGc < 2:1679939/100‑1 (MQ=255) gccTTTTTCCATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGt < 2:222139/100‑1 (MQ=255) tttttCGCTGCTGGTAATCAGTACGGGTTGCAGGTTGGCGCGTGCCGCGTACACCGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGttt < 2:211362/99‑1 (MQ=255) ccATGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACtgtg > 2:252977/1‑100 (MQ=255) cATGCCGCTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTgtgt > 2:428810/1‑100 (MQ=255) tGCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGttt < 1:509839/100‑1 (MQ=255) gCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTg > 1:76509/1‑100 (MQ=255) gCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTg < 2:1300454/100‑1 (MQ=255) gCCGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTg > 1:2112117/1‑100 (MQ=255) cGGTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGt > 1:1524005/1‑100 (MQ=255) ggTAATCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTc > 1:245241/1‑100 (MQ=255) tCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc < 2:76508/100‑1 (MQ=255) tCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc < 2:1089022/100‑1 (MQ=255) tCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc > 2:847425/1‑100 (MQ=255) tCAGTACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGcc < 1:2351453/100‑1 (MQ=255) | TAATAACGGACCGGTCAGATCGTTTGGATCGCCAGGCCAGTTTTCCACTTCCGTGGTGGTGGTCAGTTGGCCGCCTTTTTCCATGCCGGTAATCAGCACAGGTTGCAGGTTGGCGCGCGCCGCGTAGACAGCAGCGGTGTATCCCGCCGGGCCTGAACCCAGGATAAGCAGTTTACTGTGTTTGGTCGTGCC > NC_000913/931856‑932047 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |