| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,292,944 | T→C | 100% | intergenic (‑22/‑583) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,292,944 | 0 | T | C | 99.2% | 335.2 / ‑6.0 | 98 | intergenic (‑22/‑583) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (41/56); total (42/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
CGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCC > NC_000913/1292848‑1293038 | cGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTgg < 1:1959349/100‑1 (MQ=255) ttCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTgggg > 2:483771/1‑99 (MQ=255) tCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCACTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGggtg > 2:1538647/1‑100 (MQ=255) cAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGggtgg > 2:1240130/1‑100 (MQ=255) cAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGggtg > 2:963468/1‑99 (MQ=255) aaGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGggtggt < 2:2285522/100‑1 (MQ=255) aaGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGggtggt > 1:311368/1‑100 (MQ=255) aGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGtt > 1:1089575/1‑100 (MQ=255) gtgtACATTCTCTTGCCTGCGCACGACGAGTACGGCTGTTGTTCAGACTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAGTCTCAAACATATACTGGggt > 2:1710736/1‑95 (MQ=255) gtgtACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGttt > 2:2448276/1‑100 (MQ=255) gtACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTttgt < 2:2180749/100‑1 (MQ=255) gtACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTttgt < 1:299240/100‑1 (MQ=255) gtACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTttgt < 1:1465111/100‑1 (MQ=255) aCATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTttgttg < 2:376725/100‑1 (MQ=255) aTTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAg < 2:2465468/100‑1 (MQ=255) ttCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAgg < 2:1889463/100‑1 (MQ=255) ttCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAgg < 1:1933474/100‑1 (MQ=255) ttCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATATTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTGATTGTAGTAATCTCAACCTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAgg < 2:2342331/100‑1 (MQ=255) tctcTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGt < 2:527319/100‑1 (MQ=255) tctTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGtaa > 2:1319617/1‑100 (MQ=255) tctTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGtaa > 2:823901/1‑100 (MQ=255) gCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTaataat < 2:1286322/100‑1 (MQ=255) gCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTaataat > 1:1531995/1‑100 (MQ=255) ccTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAataata < 2:1877729/100‑1 (MQ=255) ccTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAataata < 2:1815306/100‑1 (MQ=255) tGCGCACGAAGATTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCGTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTaataat < 2:1519190/97‑1 (MQ=255) tGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATaga > 1:956733/1‑100 (MQ=255) gcgcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATagtg < 1:1727539/100‑3 (MQ=255) gtaCGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGc < 2:1759591/97‑1 (MQ=255) gcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAGACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGcc > 2:1802660/1‑100 (MQ=255) gcACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGcc < 1:247431/100‑1 (MQ=255) cACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCt > 2:840473/1‑100 (MQ=255) cGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCtt > 1:2541098/1‑99 (MQ=255) cGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTa < 2:1434782/100‑1 (MQ=255) agagTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAAt < 1:2204642/100‑1 (MQ=255) agTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTc < 1:910334/100‑1 (MQ=255) agTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTc > 1:1621083/1‑100 (MQ=255) gTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCa < 1:1685451/100‑1 (MQ=255) gTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCa < 1:1784612/100‑1 (MQ=255) aCGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAg < 1:1383470/99‑1 (MQ=255) aCGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGt < 1:482020/100‑1 (MQ=255) aCGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGt > 2:338794/1‑100 (MQ=255) cGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGtt > 1:82835/1‑100 (MQ=255) cGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGtt > 1:985652/1‑100 (MQ=255) cGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGtt < 2:1041536/100‑1 (MQ=255) ggATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTtg < 2:1737507/100‑1 (MQ=255) tgttgtTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGc < 2:984098/100‑1 (MQ=255) tgttgtTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGc < 2:780562/100‑1 (MQ=255) tgttgtTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGc < 1:2448290/100‑1 (MQ=255) tgttgtTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGc < 1:2224392/100‑1 (MQ=255) gttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCa < 2:600397/100‑1 (MQ=255) gttgtgGAGGATGTTAAGTGGTTGGCTAATTGTAGTAATTTCAAACTTATCCTGGGGTGGTTTGTTGTGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGc < 2:2127069/99‑1 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTTATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAAGAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATa > 2:1539535/1‑100 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCa > 2:2473865/1‑97 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATa < 2:1073071/100‑1 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATa > 2:774546/1‑100 (MQ=255) tCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGc > 1:510067/1‑100 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGcc > 2:2069345/1‑100 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGcc < 1:1702900/100‑1 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGc > 2:1044742/1‑99 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCa > 2:2414303/1‑100 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCa > 1:776707/1‑100 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAg > 1:77798/1‑100 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAg > 1:696368/1‑100 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAgg < 2:1601645/100‑1 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGa < 2:600705/100‑1 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGa > 1:1576366/1‑100 (MQ=255) ttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATg < 1:1639975/100‑1 (MQ=255) aaGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTa < 1:2325331/100‑1 (MQ=255) aGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTaa < 1:1048472/100‑1 (MQ=255) gTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGCGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg > 2:59338/1‑100 (MQ=255) gTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGAGTGGTTTGTTGAGGAAATAATATAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAg < 2:1531683/100‑1 (MQ=255) tGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAgn < 2:2277719/100‑2 (MQ=255) tGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAgg < 2:2093799/100‑1 (MQ=255) cTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGaa < 2:393517/100‑1 (MQ=255) ttCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAAt > 1:2497032/1‑100 (MQ=255) tggCTTATTGTAGTAATTTAAAACTTATACTTGGTTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAgg < 2:1413401/94‑1 (MQ=255) cGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTc > 2:995804/1‑100 (MQ=255) gCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCa > 1:2350960/1‑100 (MQ=255) cTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaa < 2:804817/100‑1 (MQ=255) cTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTGGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaa > 2:1367065/1‑100 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAACAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaaa < 1:266625/100‑1 (MQ=255) cATTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCaaaa > 2:1776410/1‑100 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAAt < 1:557972/100‑1 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTc > 2:1936871/1‑100 (MQ=255) agtaATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTc < 2:1767775/100‑1 (MQ=255) taATCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGTAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCtt < 1:1802674/100‑1 (MQ=255) aaTCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCttt < 2:836970/100‑1 (MQ=255) aaTCTCAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCttt > 2:149870/1‑100 (MQ=255) ctcAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtt > 1:1418266/1‑100 (MQ=255) tcAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGGAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt > 2:2413375/1‑100 (MQ=255) cAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtttt > 2:832976/1‑100 (MQ=255) cAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtttt > 2:1724549/1‑100 (MQ=255) cAAACTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAtttt < 1:230344/100‑1 (MQ=255) aaaCTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGATTTCAAAATTGTTCTTTATTTtg < 2:1485323/100‑1 (MQ=255) aaaCTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtg < 2:209377/100‑1 (MQ=255) cTTATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgc < 2:1267943/100‑1 (MQ=255) ttATACTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgcc < 1:1493968/100‑1 (MQ=255) | CGTTTCAAGTGTACATTCTCTTGCCTGCGCACGAAGAGTACGGATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCC > NC_000913/1292848‑1293038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |