Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,520,080 | 0 | G | T | 28.4% | 300.3 / 141.7 | 177 | intergenic (+16/‑182) | curA/mcbR | curcumin/dihydrocurcumin reductase, NADPH‑dependent/colanic acid and biofilm gene transcriptional regulator, MqsR‑controlled |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (62/64); new base T (23/27); total (85/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.04e-01 |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTT > NC_000913/1519981‑1520179 | gagaATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGgcggcg < 1:2061064/100‑1 (MQ=255) gagaATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGgcggcg > 1:1973574/1‑100 (MQ=255) gagaATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGgcggcg > 2:111364/1‑100 (MQ=255) gaATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTa > 2:3232191/1‑100 (MQ=255) aTGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAg < 2:3161332/100‑1 (MQ=255) aTGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATACGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAg > 1:1388366/1‑100 (MQ=255) gcgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgcc > 2:631325/1‑100 (MQ=255) gcgcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgcc < 2:1631645/100‑1 (MQ=255) gcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAATGGCGGCGTAAgccgc > 1:2113846/1‑100 (MQ=255) gcCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgc > 1:1098761/1‑100 (MQ=255) ccACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAATACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGCGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgcc < 1:222088/100‑1 (MQ=255) ccACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAgccgcc < 1:604005/100‑1 (MQ=255) acaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgt < 2:377652/100‑3 (MQ=255) acaGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgt < 1:447030/100‑3 (MQ=255) caGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 1:3451388/100‑4 (MQ=255) caGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 1:226495/100‑4 (MQ=255) caGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATa > 1:1514358/1‑100 (MQ=255) agtggTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTGCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttg < 1:1696430/96‑5 (MQ=255) aGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttg < 2:1258482/100‑5 (MQ=255) aGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttg < 1:1883402/100‑5 (MQ=255) aGACGTTGATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAACCTTCGGCAAAGTGGTGATCTGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgtt < 1:1203727/99‑4 (MQ=255) gACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttga < 2:51587/100‑6 (MQ=255) gACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttga < 1:2515748/100‑6 (MQ=255) gACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttga < 2:1342906/100‑6 (MQ=255) gACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATaaa < 1:937954/100‑1 (MQ=255) aCGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttgaa < 1:3206407/100‑7 (MQ=255) aCGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCTTACgccgccgttg < 2:1222534/98‑5 (MQ=255) gTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAAt > 2:252297/1‑100 (MQ=255) ttATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATcc < 1:762528/100‑1 (MQ=255) ttATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCCGGTGATGCTTAAAGTTCCAACGGCGGCGTACGCCGCCCTAAAAATc > 1:1475727/1‑99 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAg < 2:797407/100‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAg < 2:2321225/100‑1 (MQ=255) aTCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAg > 1:1083770/1‑100 (MQ=255) cGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGc > 1:203381/1‑100 (MQ=255) ggCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCa > 2:173194/1‑100 (MQ=255) ggCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCa < 1:2428600/100‑1 (MQ=255) ccTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCaaa > 2:2759434/1‑100 (MQ=255) ctgctgAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGCGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCaaaa < 1:2208599/100‑1 (MQ=255) tgctgAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCaaaaa > 2:1850977/1‑100 (MQ=255) gAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCtt < 2:608502/100‑1 (MQ=255) aGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTan < 2:3151510/100‑2 (MQ=255) aGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAt < 2:2678017/100‑1 (MQ=255) gTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAtttt < 2:679261/100‑1 (MQ=255) gTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTAtttt > 2:1030766/1‑100 (MQ=255) tAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTc < 1:2842180/100‑1 (MQ=255) aataagttCGACAAGGTGGGGATATGCGTGGTGGGTGATTATTAGAGTTTGAACGACTGCGTAAGCCGACATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCa < 1:2530509/94‑1 (MQ=255) aaaCTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGc < 2:2241914/100‑1 (MQ=255) cTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCttt > 1:472085/1‑100 (MQ=255) cTTCGGAAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATACAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCtat > 1:2895759/1‑98 (MQ=255) cagCAAAGTCGTGAGCCGCGTGGCGTTTGATGAAAAAAGTTTCAACGGCGGCTTAAGCCGCCATAAAAAAACAGACAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaa < 1:2759390/97‑1 (MQ=255) gCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta > 1:676020/1‑100 (MQ=255) gCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta < 2:2755876/100‑1 (MQ=255) cAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaattaa > 1:2640510/1‑100 (MQ=255) cAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAAGCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTttaatta < 2:3094634/99‑1 (MQ=255) aaaGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaac < 2:890068/100‑1 (MQ=255) aaGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATtaact < 2:2116479/100‑1 (MQ=255) ggtgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAAcc < 2:831566/100‑1 (MQ=255) tgATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCCACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCCGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACcac > 1:2814981/1‑100 (MQ=255) gATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAATTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACcaca > 1:3139677/1‑100 (MQ=255) tCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatc > 2:1077081/1‑100 (MQ=255) ccGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatca < 1:2202969/100‑1 (MQ=255) ccGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatca > 2:1676692/1‑100 (MQ=255) cgcgTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCAcatcat > 2:903383/1‑100 (MQ=255) gTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGt < 1:631318/100‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCCTAAAAATAAATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGtt < 1:2443828/100‑1 (MQ=255) ggCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTc < 1:784420/100‑1 (MQ=255) ggCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTc < 1:818279/100‑1 (MQ=255) gggTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgc < 2:17650/100‑1 (MQ=255) gggTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgc < 2:203384/100‑1 (MQ=255) gTGATGATTAAAGTGTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTctgctg < 1:2369101/100‑1 (MQ=255) gatgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTgctgct > 2:3209941/1‑100 (MQ=255) gatgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTgctgct < 1:2856229/100‑1 (MQ=255) atgatTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCta < 1:1030753/100‑1 (MQ=255) atTAAAGTGTCAACGGCGCCGTAGGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGATTTAATTATCTAACCACATTATTGTTCTGCTGCtaat < 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cAACGGCGGTGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAg < 2:2369967/99‑1 (MQ=255) cAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAgg < 2:2578556/100‑1 (MQ=255) tatggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGt > 2:443319/4‑100 (MQ=255) tatggcggcTTACGCAGCCATAACCATACAGGCAAAAAGCCTATATTACGCTTTAATTAACTAACCCCATCCTTGTTCTGCCGCCAATAAaaccaacg > 1:2816168/4‑96 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 2:3171067/3‑100 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 2:2877362/3‑100 (MQ=255) atggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 1:1014623/3‑100 (MQ=255) aCGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg < 1:3062314/100‑1 (MQ=255) aCGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg < 2:1692918/100‑1 (MQ=255) tggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTg > 2:3130275/2‑99 (MQ=255) tggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa > 2:175036/2‑100 (MQ=255) tggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa > 2:1948030/2‑100 (MQ=255) cggcggCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGa < 2:1320339/100‑1 (MQ=255) ggcggcTTACGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAg > 1:2996267/1‑100 (MQ=255) gcggcgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGt < 1:2302630/100‑1 (MQ=255) cggcgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTg > 1:1598078/1‑100 (MQ=255) gcgTAAGCTGCCATAAAAACGCATGCAAAAAGCTTGTTTTCAGCTTTAATTAACTACCAACAGCAGTGTTCTGCTGCCAATACCAGCAAAGGTg < 1:1750828/94‑1 (MQ=255) gcgTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGt < 2:955072/100‑1 (MQ=255) gTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGttt > 1:3422076/1‑100 (MQ=255) | GAGAATGCGCCACAGACGTTTATCGGCCTGCTGAAGGGTAAAAACTTCGGCAAAGTGGTGATCCGCGTGGCGGGTGATGATTAAAGTTTCAACGGCGGCGTAAGCCGCCATAAAAATCCAGGCAAAAAGCTTATTTTCAGCTTTAATTAACTAACCACATCATTGTTCTGCTGCTAATAACAACAAAGGTGAGTGGTTT > NC_000913/1519981‑1520179 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |