Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,971,690 | A→C | Q144P (CAG→CCG) | wecC → | UDP‑N‑acetyl‑D‑mannosaminuronic acid dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,971,690 | 0 | A | C | 99.1% | 375.6 / NA | 113 | Q144P (CAG→CCG) | wecC | UDP‑N‑acetyl‑D‑mannosaminuronic acid dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (64/48); minor base G (1/0); total (65/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GCGCGCTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCAGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATCGCG > NC_000913/3971594‑3971785 | gcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTg < 1:1654533/100‑1 (MQ=255) ngTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGc > 2:1866638/2‑100 (MQ=255) ggTGATCCTTCAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGCATGGGTAGCAGAGATGCGCCCGGCTCTCACTTACCCGCCGCAGATgcac > 1:3398255/1‑97 (MQ=255) gTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCg < 2:3167900/100‑1 (MQ=255) tGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGa > 1:3259824/1‑100 (MQ=255) gATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAg < 2:1669558/100‑1 (MQ=255) aTCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGc > 1:2823855/1‑100 (MQ=255) aTCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGc > 1:1542207/1‑100 (MQ=255) tCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCa > 2:494925/1‑100 (MQ=255) cTTGAAGCCACCTGGCCGGTGGGGTCAACCGAGGAGATGGCAGAATGGTTGGCAGGGATGCGTCCGGATCTCACTTTCACGCCGCAGGTGGGCGAGCAgg < 1:2744782/100‑1 (MQ=255) gAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCgg < 2:1990807/100‑1 (MQ=255) aaTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGa < 2:3313557/100‑1 (MQ=255) aaTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGa < 1:904506/100‑1 (MQ=255) tCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACg < 1:172608/100‑1 (MQ=255) cACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTCGCAGGGATGCGTCCGGGTCTGACTTTCCCGCCGCAGGCGGGCGAGCAGGCGGAc > 1:3095980/1‑97 (MQ=255) cACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTc > 1:1753890/1‑100 (MQ=255) cACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAACGGCTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAgg > 1:742239/1‑92 (MQ=255) ccTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCaa < 2:2312033/100‑1 (MQ=255) cttccgatctgggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAc < 2:3324211/90‑1 (MQ=255) cTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAc > 2:430029/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAc < 2:201237/100‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGTCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAc < 1:1574718/99‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACa < 1:2395954/100‑1 (MQ=255) cGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCCGCGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGCCGTCAAc > 1:989249/1‑98 (MQ=255) ccGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTg < 2:3311025/100‑1 (MQ=255) cGGTGGGGTCTACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGc < 1:2290008/100‑1 (MQ=255) cGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGc > 2:2639787/1‑100 (MQ=255) ggTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCt < 2:867575/100‑1 (MQ=255) ggTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCt < 1:2903963/100‑1 (MQ=255) ggggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGCTGCGTCGGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCACCATTGCTTAc > 1:1176641/1‑100 (MQ=255) ggggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTAc < 2:3335134/100‑1 (MQ=255) ggggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTAc < 2:1338607/100‑1 (MQ=255) gggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGTGATGCGTCCGGATCTCACTTTTCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACt > 1:333694/1‑100 (MQ=255) gggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACagatcggaag > 1:3324160/1‑91 (MQ=255) gggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACt > 1:2428394/1‑100 (MQ=255) ggTCAACCGAGAAGATGGCAGACTGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTACCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGGCAACATTGCTTACTg > 1:776776/1‑100 (MQ=255) tCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGcc < 2:2428427/100‑1 (MQ=255) cAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc > 2:1885424/1‑100 (MQ=255) cAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc > 2:1937014/1‑100 (MQ=255) cAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc > 2:2937611/1‑100 (MQ=255) aaCCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCg < 2:333698/100‑1 (MQ=255) aCCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGTAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCgg > 1:706331/1‑100 (MQ=255) aCCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCgg > 1:364330/1‑100 (MQ=255) ccGAGAAGATGGGAGAATGGTTAGCAGCGCTGCGTCCGGATCTCCCTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGGGGACCTCAACATTGCTTACGGCCCg > 1:2781667/1‑98 (MQ=255) cGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccatctt > 1:104215/1‑95 (MQ=255) cGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGaa > 2:829537/1‑100 (MQ=255) gagaAGATGGGAGAATGGTTAGCAGAGATGAGTCCGGATCTCACTGTCCCGGGGAAGGTGGACGCGAAGGCGAACCTCACTATTGGTTCGTTCACGGAAc > 1:2959917/1‑100 (MQ=255) gagaAGATGGCAGAGTGGTTAGCAGGGAGGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAc < 1:1007449/100‑1 (MQ=255) gagaAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAc < 2:1753915/100‑1 (MQ=255) agaagaTGGCAGGATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGAACTCACTTTTCGGCCGCTGGTGGGCGAGCCGGCGGACGTTAACATTGCTTACTGCGCGGacag > 1:3199554/1‑97 (MQ=255) aagaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAcgcg < 2:2886223/100‑1 (MQ=255) agaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgt > 2:2206762/1‑100 (MQ=255) agaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgt < 2:1714005/100‑1 (MQ=255) gaTGGCAGGATGGTTAGCAGAGATGCGTCGGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtg < 1:755210/100‑1 (MQ=255) gaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtg < 2:2403784/100‑1 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGtt > 1:948126/1‑100 (MQ=255) gCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTAc > 2:3195947/1‑100 (MQ=255) gCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTAc > 2:1184184/1‑100 (MQ=255) cAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGATTAATGCCCGGAACGCGTGTTAcc > 2:2105394/1‑100 (MQ=255) aGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCa < 1:1141817/100‑1 (MQ=255) gAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAg < 1:2605754/100‑1 (MQ=255) gAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAg > 1:707753/1‑100 (MQ=255) aTGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCCCTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGa > 2:2573173/1‑100 (MQ=255) aTGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGa > 1:167223/1‑100 (MQ=255) ggTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACa > 2:2806773/1‑100 (MQ=255) ggTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACa > 1:685737/1‑100 (MQ=255) ggTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGAGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACa > 1:3305019/1‑100 (MQ=255) tAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGt < 1:3135057/100‑1 (MQ=255) tAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGt < 2:2011386/100‑1 (MQ=255) tAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGt > 2:834846/1‑100 (MQ=255) gCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTaa > 2:2959937/1‑100 (MQ=255) gagaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATgg > 1:2495048/1‑100 (MQ=255) gagaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATgg < 1:1293812/100‑1 (MQ=255) gagaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATgg < 1:2681037/100‑1 (MQ=255) aTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCg < 1:139537/100‑1 (MQ=255) tccttCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCATGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTTCTTACTGCCCTGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATTGTCg < 1:669066/95‑1 (MQ=255) tGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGa > 2:489963/1‑100 (MQ=255) tGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGa > 1:2537449/1‑100 (MQ=255) tGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGa > 2:3325586/1‑100 (MQ=255) gCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAg < 1:2203407/100‑1 (MQ=255) gCGTCCGGAGCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAg < 1:1309138/100‑1 (MQ=255) gTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTTCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCt < 1:1935557/100‑1 (MQ=255) gTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCt < 2:2872645/100‑1 (MQ=255) gTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCt > 1:1185550/1‑100 (MQ=255) gTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCt > 2:1839994/1‑100 (MQ=255) cGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAt < 2:2537483/100‑1 (MQ=255) gATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTa > 1:2895442/1‑100 (MQ=255) ntctcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGTACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGATCGAGCTGATTaa > 1:3215822/2‑100 (MQ=255) aTCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGGGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCGGGGACGCGTGTTACGAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGGTTaa > 1:2609751/1‑100 (MQ=255) ctcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaaaa < 2:1117586/100‑1 (MQ=255) ctcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGATGATTaaa > 1:2468356/1‑99 (MQ=255) tcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaaaaa > 1:2548556/1‑100 (MQ=255) cACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAAc > 1:3320637/1‑100 (MQ=255) cACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAAc > 2:2042372/1‑100 (MQ=255) aCTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACg > 1:1671095/1‑100 (MQ=255) ttCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATc > 2:2815109/1‑100 (MQ=255) tCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcg > 1:1557609/1‑100 (MQ=255) cccGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcgc > 1:3400612/1‑100 (MQ=255) cccGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcgc < 2:1617471/100‑1 (MQ=255) ccgccgCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcgcg > 1:1794061/1‑100 (MQ=255) | GCGCGCTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCAGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATCGCG > NC_000913/3971594‑3971785 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |