| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,358,482 | T→A | I46F (ATC→TTC) | cadA ← | lysine decarboxylase, acid‑inducible |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,358,482 | 0 | T | A | 96.1% | 420.8 / 2.2 | 129 | I46F (ATC→TTC) | cadA | lysine decarboxylase, acid‑inducible |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (4/1); new base A (64/59); total (68/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTAAA > NC_000913/4358386‑4358578 | gCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAg < 2:1197858/100‑1 (MQ=255)gCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAg < 2:85004/100‑1 (MQ=255) ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAGATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGttt > 1:1891540/1‑100 (MQ=255) ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGttt < 1:337469/100‑1 (MQ=255) ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGttt > 1:2656759/1‑100 (MQ=255) ggTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGttt > 2:1143981/1‑100 (MQ=255) gTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGtttt < 2:1488894/100‑1 (MQ=255) gTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGtttt < 2:2097170/100‑1 (MQ=255) ttCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGAGTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTta > 2:1739754/1‑100 (MQ=255) tctcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaa > 2:1312571/1‑100 (MQ=255) ctcGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaat < 1:818923/100‑1 (MQ=255) cGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTtaataa > 1:1349805/1‑100 (MQ=255) cGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaataa > 1:1564686/1‑100 (MQ=255) cGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTtaataa > 1:2041575/1‑100 (MQ=255) gTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAg > 1:84515/1‑100 (MQ=255) gTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAg > 2:3100161/1‑100 (MQ=255) tCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATGATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAgtc > 1:2097103/1‑100 (MQ=255) aTTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAgtcgt > 2:2993308/1‑100 (MQ=255) tttGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCa > 2:2847155/1‑100 (MQ=255) gCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACgg < 2:1973654/100‑1 (MQ=255) cTAATTTCTTCTCACAGCTCTATATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTTTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGt < 1:1227949/100‑1 (MQ=255) cTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTTAAAAATAACGCCACACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGATATAATAAGTCGACACGGt > 1:2423925/1‑100 (MQ=255) cTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGt > 1:3143354/1‑100 (MQ=255) tAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTc > 2:441524/1‑100 (MQ=255) tAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTc < 2:2837727/100‑1 (MQ=255) ccgatctttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTc < 2:2655908/93‑1 (MQ=255) tttATTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGtt > 1:2746758/1‑100 (MQ=255) ttcttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTc > 1:1242430/1‑100 (MQ=255) tcttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCg < 1:748665/100‑1 (MQ=255) cttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCgg > 1:3421594/1‑100 (MQ=255) cttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCgg > 1:3275101/1‑100 (MQ=255) ttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTcagatcgg > 1:2655870/1‑93 (MQ=255) ttcGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCggg < 2:1294733/100‑1 (MQ=255) cGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTa < 2:359107/100‑1 (MQ=255) gCACAGCTCGATATTATATTTATCCCAGTCAAAGATAATGACGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTTACGGTCGTTCGGGt < 1:801265/98‑1 (MQ=255) gCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaa > 2:2152895/1‑100 (MQ=255) gCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaa > 2:1839240/1‑100 (MQ=255) cacaGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTaaa > 1:478361/1‑100 (MQ=255) acaGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAAc < 2:524460/100‑1 (MQ=255) aGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACaa > 1:136277/1‑100 (MQ=255) gCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAAt > 1:723596/1‑100 (MQ=255) cTCGAGATTATATTTATCCCTGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATc > 1:2129434/1‑100 (MQ=255) cTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATc < 1:617965/100‑1 (MQ=255) tCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCt < 2:1803413/100‑1 (MQ=255) tCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCt > 1:469890/1‑100 (MQ=255) cGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTg < 2:1598749/100‑1 (MQ=255) cGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTg > 2:3457873/1‑100 (MQ=255) agaTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGa < 2:1619814/100‑1 (MQ=255) agaTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGa > 2:1226528/1‑100 (MQ=255) aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg < 2:525790/100‑1 (MQ=255) aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg < 2:1938932/100‑1 (MQ=255) aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg < 2:2436624/100‑1 (MQ=255) aTTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAg < 2:3231179/100‑1 (MQ=255) ttATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGAGGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACagatcggaaga > 2:2444832/1‑90 (MQ=255) atatTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTc < 2:1930157/100‑1 (MQ=255) atTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAg > 1:829680/1‑100 (MQ=255) tttATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGa > 2:769047/1‑100 (MQ=255) tATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACg > 2:863112/1‑100 (MQ=255) aTCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGt > 1:942528/1‑100 (MQ=255) cccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTc > 1:440781/1‑100 (MQ=255) cccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTc > 2:1427761/1‑100 (MQ=255) cccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTc > 1:1194637/1‑100 (MQ=255) ccAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCa < 1:2465408/100‑1 (MQ=255) aGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAg < 1:1086663/100‑1 (MQ=255) aGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAg < 1:2880410/100‑1 (MQ=255) gTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgc > 2:1841338/1‑100 (MQ=255) gTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgc > 2:329144/1‑100 (MQ=255) tCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcg < 1:1143966/100‑1 (MQ=255) cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcgc > 1:2243661/1‑100 (MQ=255) cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcgc > 2:2715361/1‑100 (MQ=255) cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcgc > 2:3041842/1‑100 (MQ=255) cAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAgcgc > 2:2572780/1‑100 (MQ=255) aaaaaTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACCTTCAAgcgcg > 2:3099850/1‑100 (MQ=255) aaaTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGACCAGTTTTACTAAGTCGACACAGTCGTTCCGGTAAACAATCTTGAAGTTCAGACGTTCatacccgcg < 1:2598454/100‑9 (MQ=255) aTAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGAt < 1:1275756/100‑1 (MQ=255) cgccgcACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAg > 2:3360491/1‑100 (MQ=255) cgccgcACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAg < 2:136279/100‑1 (MQ=255) cgccgcACAGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAg > 2:2533064/1‑100 (MQ=255) acaGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACg < 1:1739729/100‑1 (MQ=255) caGACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACgg < 1:3065127/100‑1 (MQ=255) gtggcgcATTGGTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCTTCACGGTCGGTAGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGAGCGCGATGAAGTTCACGGAt < 1:1561158/97‑1 (MQ=255) gACGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGAt > 1:1085113/1‑100 (MQ=255) aCGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATg < 2:354320/100‑1 (MQ=255) aCGCGCATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATg < 1:2459562/100‑1 (MQ=255) cgcATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGt > 2:2473506/1‑100 (MQ=255) gcATTGTTTTCTAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGTAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATggg < 1:3470664/98‑1 (MQ=255) gcATTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGtt > 2:2171126/1‑100 (MQ=255) aTTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttct > 2:2331495/1‑100 (MQ=255) aTTGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttct < 2:3246832/100‑1 (MQ=255) ttGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttctt < 1:2418095/100‑1 (MQ=255) tGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttcttc < 2:3001975/100‑1 (MQ=255) tGTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGttcttc < 1:2355074/100‑1 (MQ=255) gTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct > 1:1028118/1‑100 (MQ=255) gTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct < 2:1564708/100‑1 (MQ=255) gTTTTCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTtcttct > 1:3050041/1‑100 (MQ=255) ttttCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTcttctt > 1:996538/1‑100 (MQ=255) ttttCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTcttctt > 1:291848/1‑100 (MQ=255) ttCGAACAGTTTTTTTAAGTCGTTACGGTGGTGTGGGTAAACAATCTGGAAGGTCAGACGTTTAAGCGCGTGATGAAGTGAACGGATGGGTACTTCTTTa < 1:1019299/100‑1 (MQ=255) tCGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTaa < 1:2871453/100‑1 (MQ=255) cGAACAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTaaa > 1:2273480/1‑100 (MQ=255) | GCAGGTTCTCGTTCATTTTGCTAATTTCTTCGCACAGCTCGAGATTATATTTATCCCAGTCAAAAATAACGCCGCACAGACGCGCATTGTTTTCGATCAGTTTTAATAAGTCGTCACGGTCGTTCGGGTAAACAATCTGGAAGTTCAGACGTTCAAGCGCGCGATGAAGTTCACGGATGGGTTCTTCTTTAAA > NC_000913/4358386‑4358578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |