| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,111,377 | A→G | D172G (GAT→GGT) | opgH → | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,111,377 | 0 | A | G | 99.1% | 392.7 / ‑5.0 | 114 | D172G (GAT→GGT) | opgH | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (49/64); total (50/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGT > NC_000913/1111280‑1111471 | aTTCTGTTGATCCTGACGCTGGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGgta < 2:1587564/100‑1 (MQ=255)aTTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGgta < 2:1587554/100‑1 (MQ=255) tCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtg > 2:784577/1‑100 (MQ=255) tCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtg < 1:2625111/100‑1 (MQ=255) cTGTTGATCCTGTCGCTCGCGCAAACTGTCGTCCCGACCTGGTATATGAAGTCCATTCTTCCTTAACAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGgtat < 1:2415196/98‑1 (MQ=255) cTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtgg > 1:2529743/1‑100 (MQ=255) tGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggt > 1:2267857/1‑100 (MQ=255) tGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggt > 2:1860413/1‑100 (MQ=255) gTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggtt > 2:175613/1‑100 (MQ=255) gTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggtt < 1:688413/100‑1 (MQ=255) gTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggtt > 2:2401373/1‑100 (MQ=255) gTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCATTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggt < 1:3123294/99‑1 (MQ=255) ttGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttg > 1:1936364/1‑100 (MQ=255) tGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttgg > 1:1502506/1‑100 (MQ=255) gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt > 2:2371002/1‑100 (MQ=255) aTCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTc > 1:2429135/1‑100 (MQ=255) ccTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAg < 2:1248457/100‑1 (MQ=255) ccTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAg < 2:779378/100‑1 (MQ=255) cTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAgg < 2:330776/100‑1 (MQ=255) tGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGa < 1:2734774/100‑1 (MQ=255) tGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGa > 2:343869/1‑100 (MQ=255) gACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGAt < 1:159378/100‑1 (MQ=255) cGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGAttt > 2:189517/1‑100 (MQ=255) tCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtgtg < 1:3202583/100‑1 (MQ=255) tCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtgtg < 1:2786430/100‑1 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTggg > 2:924106/1‑100 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTggg > 1:340205/1‑100 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTggg < 2:2092376/100‑1 (MQ=255) aaCTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTcc < 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gtcgtcGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCtaga > 1:1612043/1‑97 (MQ=255) gtcgtcGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTa > 1:471580/1‑100 (MQ=255) gtcgtcGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTa < 2:401981/100‑1 (MQ=255) tcgtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTAt < 1:2431241/100‑1 (MQ=255) tcgtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTAt < 1:545839/100‑1 (MQ=255) cgtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATg < 2:1103727/100‑1 (MQ=255) cgtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATg < 1:467416/100‑1 (MQ=255) gtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGc > 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aTTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAc < 2:2723350/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGGGATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTCctgtt > 1:780470/1‑99 (MQ=255) ccTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATACTGATCCTCTTTGCGGTActgttc > 2:2664321/1‑99 (MQ=255) cTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctg > 1:2194211/1‑100 (MQ=255) | ATTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGT > NC_000913/1111280‑1111471 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |