Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,161,946 | A→G | A161A (GCA→GCG) | iceT → | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,161,946 | 0 | A | G | 98.4% | 426.6 / ‑6.6 | 123 | A161A (GCA→GCG) | iceT | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (58/63); total (59/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GCGAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCG > NC_000913/2161849‑2162041 | gcgAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTc < 1:3079165/100‑1 (MQ=255) gggCAATATATGGCGGCGAGGACCGTTGTCACGTGCGCCGGTCAGGTCGGGCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTTCGcgtcgt < 1:498540/98‑1 (MQ=255) gAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGcgtcgt > 1:3281915/1‑100 (MQ=255) aGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTg > 2:718354/1‑100 (MQ=255) aGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTg < 1:3207536/100‑1 (MQ=255) cAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGc < 2:3028983/100‑1 (MQ=255) cAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGc > 1:1669021/1‑100 (MQ=255) cAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGc < 1:1301096/100‑1 (MQ=255) tagatGGCGGCGATGCCCTTTGTCACGTTGCCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACt < 2:3119411/97‑1 (MQ=255) tatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTgg < 2:1814549/100‑1 (MQ=255) atGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGa > 1:843801/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGAt < 1:2694990/100‑1 (MQ=255) ggcggcGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATc > 2:2747682/1‑100 (MQ=255) gATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTg < 1:2928391/100‑1 (MQ=255) gATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTg < 1:2415899/100‑1 (MQ=255) gATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTg < 2:27463/100‑1 (MQ=255) gATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTg < 2:843812/100‑1 (MQ=255) aTGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGa < 1:2005971/100‑1 (MQ=255) gACCCTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATc < 2:1408670/100‑1 (MQ=255) aCCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCa < 1:1767584/100‑1 (MQ=255) aCCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCa < 1:3328386/100‑1 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa > 2:2813647/1‑100 (MQ=255) cTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTTATCAAc < 1:708537/100‑1 (MQ=255) cTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAAc > 2:869000/1‑100 (MQ=255) cTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAAc > 2:1099198/1‑100 (MQ=255) tttGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACa > 1:1519958/1‑100 (MQ=255) ttGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACAt < 1:3154669/100‑1 (MQ=255) ttGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACAt > 2:1221064/1‑100 (MQ=255) tGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACAtt > 2:735472/1‑100 (MQ=255) tCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTcc > 2:2944464/1‑100 (MQ=255) cACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCg > 2:1968742/1‑100 (MQ=255) cACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTGTTGAGCAACATTCCg > 1:3396829/1‑100 (MQ=255) tcGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCgg < 1:354528/99‑1 (MQ=255) aCGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCgg > 1:1026194/1‑100 (MQ=255) cGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGt > 1:1486441/1‑100 (MQ=255) gTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTg < 2:2307202/100‑1 (MQ=255) tACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTggg < 2:48478/100‑1 (MQ=255) aCCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTgggg > 1:1835091/1‑100 (MQ=255) cccGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGa > 2:2582097/1‑100 (MQ=255) ccGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGAt < 1:2637237/100‑1 (MQ=255) ccGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGAt < 2:2484991/100‑1 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTggg < 1:1365852/96‑1 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTGTTTGATCAACATTCCGGTGGGGAtt > 1:2217801/1‑100 (MQ=255) ggTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTa < 2:483364/100‑1 (MQ=255) ggTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTa > 2:2270229/1‑100 (MQ=255) tCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTTGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATc < 1:1481131/100‑1 (MQ=255) cAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCg < 1:2813603/100‑1 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGTTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGt > 2:2518725/1‑100 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGt > 1:1665710/1‑100 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGt > 1:749844/1‑100 (MQ=255) gtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg < 2:1843803/100‑1 (MQ=255) gtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGAt > 2:2562777/1‑100 (MQ=255) gtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGAt > 1:452344/1‑100 (MQ=255) tcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATc > 1:801323/1‑100 (MQ=255) cGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTTGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCg < 2:946212/99‑1 (MQ=255) gctgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTTCGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGcc < 1:1897037/100‑1 (MQ=255) gctgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGcc < 2:2571003/100‑1 (MQ=255) gctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCcaca < 1:732883/100‑1 (MQ=255) gctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCcaca > 1:2814370/1‑100 (MQ=255) gctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCcaca > 2:169029/1‑100 (MQ=255) cGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACAt > 1:684247/1‑98 (MQ=255) ggTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGc < 1:1666785/100‑1 (MQ=255) tCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTg < 2:1026207/100‑1 (MQ=255) tCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTg < 2:248364/100‑1 (MQ=255) ccGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTg < 1:1367827/99‑1 (MQ=255) ccGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGt > 2:1241644/1‑100 (MQ=255) ccGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGt > 1:1876132/1‑100 (MQ=255) cGGCGCTCGGCGGTCTGTTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTTCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGtt < 1:1495984/100‑1 (MQ=255) cGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGtt < 2:1650724/100‑1 (MQ=255) gcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATg < 1:1259005/100‑1 (MQ=255) gcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGAGCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAAt < 1:48467/99‑1 (MQ=255) cggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGTTCGCCACATTGCTGTTAATGcc < 1:2017734/99‑1 (MQ=255) cggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCg < 1:1974460/100‑1 (MQ=255) ggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGa < 2:1427428/100‑1 (MQ=255) ggggTCTGCTGGTAGAGTACGCGTCGTGGCAGTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGaa > 2:2339483/3‑100 (MQ=255) gcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGaa < 1:1349406/100‑1 (MQ=255) cggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAAc > 1:1810112/1‑100 (MQ=255) cggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAAc < 2:2293291/100‑1 (MQ=255) ggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACt > 2:899138/1‑100 (MQ=255) gTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTa > 2:935927/1‑100 (MQ=255) tCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCCCTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAAGTac > 1:2648450/1‑100 (MQ=255) ctgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTaca < 2:2814414/100‑1 (MQ=255) ctgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTaca < 2:362410/100‑1 (MQ=255) ctgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTaca > 2:2291463/1‑100 (MQ=255) tgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTacac > 1:3370615/1‑100 (MQ=255) tgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTATTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTacac > 1:2261946/1‑100 (MQ=255) ctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACAcc > 1:3128334/1‑99 (MQ=255) ctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCa < 2:3246202/100‑1 (MQ=255) ctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCa > 2:2626393/1‑100 (MQ=255) ctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCa > 1:1623797/1‑100 (MQ=255) ctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCa > 1:470227/1‑100 (MQ=255) tggtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCAt < 1:2265247/100‑1 (MQ=255) ggtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATg > 2:15333/1‑100 (MQ=255) ggtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATg > 1:2718320/1‑100 (MQ=255) gtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGc < 1:1222077/100‑1 (MQ=255) gtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGc < 1:455095/100‑1 (MQ=255) gtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGc < 1:1132879/100‑1 (MQ=255) ggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTTTTTTTTATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCAttc > 1:2772993/1‑96 (MQ=255) gAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGa < 2:484603/100‑1 (MQ=255) gAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGa < 2:753735/100‑1 (MQ=255) | GCGAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCG > NC_000913/2161849‑2162041 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |