| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 750,896 | Δ1 bp | 100% | coding (1274/2448 nt) | ybgQ ← | putative outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 750,893 | 0 | C | . | 67.2% | 179.0 / 212.2 | 131 | coding (1277/2448 nt) | ybgQ | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/16); new base . (45/43); total (72/59) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.31e-01 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
TAGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCATTGCGG > NC_000913/750794‑750992 | tAGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGc > 2:2268164/1‑100 (MQ=255)tAGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGc > 2:2266131/1‑100 (MQ=255)tAGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGc < 2:1733481/100‑1 (MQ=255) aGCTGTGAAAATGGCGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcc < 1:3097362/100‑1 (MQ=255) aGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGcc < 2:683000/100‑1 (MQ=255) gCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAGATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGccc < 2:413072/100‑1 (MQ=255) aTGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCct > 1:2604792/1‑100 (MQ=255) tGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTCAGCCCCGCTCGTCct > 2:3345008/1‑100 (MQ=255) tGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCct > 1:3110751/1‑100 (MQ=255) tGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCctg < 2:3293250/100‑1 (MQ=255) gACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCctg > 2:1109949/1‑100 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAg < 1:1650284/100‑1 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAg < 2:951399/100‑1 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAg < 1:377492/100‑1 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAg < 2:2461326/100‑1 (MQ=255) aTCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAg < 2:1519882/100‑1 (MQ=255) tCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAg < 1:194472/100‑1 (MQ=255) tCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGt < 2:1687497/100‑1 (MQ=255) tCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGt < 2:447834/100‑1 (MQ=255) tGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTAt > 2:3127757/1‑100 (MQ=255) gagaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTAt > 1:1258705/1‑100 (MQ=255) gagaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATc < 1:1218431/100‑1 (MQ=255) agaagaGATAAGCCGCGAGCTAAACCGTGTTGTTCGTGGCATCCACATGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTAGCa < 1:1003433/100‑1 (MQ=255) agaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATc > 1:2474386/1‑100 (MQ=255) agaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCa > 1:1448187/1‑100 (MQ=255) agaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGACATCCACGTGTTTGCTATAATTCAAACGGTAGCCTAAGCCCCGCCCGTCCTGCTGAGTATc > 1:901155/1‑100 (MQ=255) gaAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCaa > 2:1529217/1‑100 (MQ=255) gCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCaaaa < 2:2932005/100‑1 (MQ=255) cGATAAGCGGCGGGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATg < 1:2700063/100‑1 (MQ=255) cGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATg < 1:3008406/100‑1 (MQ=255) aTAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGc > 1:2194483/1‑100 (MQ=255) tAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGc > 2:3258731/1‑100 (MQ=255) gcggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTAc > 2:981034/1‑100 (MQ=255) cggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACt > 1:1509099/1‑100 (MQ=255) cggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTAc > 1:2135635/1‑98 (MQ=255) ggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTgg < 1:374894/100‑1 (MQ=255) ggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTgg > 1:2668052/1‑100 (MQ=255) ggcgAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTgg < 1:1038576/100‑1 (MQ=255) cgagcgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGcc < 1:1721721/100‑1 (MQ=255) cgagcgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGcc > 2:436867/1‑100 (MQ=255) gagcgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGccc > 2:1582522/1‑100 (MQ=255) gcgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCa > 2:1089250/1‑100 (MQ=255) gcgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAg > 2:748456/1‑100 (MQ=255) gcgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAg > 1:2401572/1‑100 (MQ=255) cgaAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAgg < 2:507168/100‑1 (MQ=255) aaaTCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAgg > 1:2686320/1‑99 (MQ=255) aaTCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTACGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAg < 1:1654102/97‑1 (MQ=255) aaTCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTg < 2:267014/100‑1 (MQ=255) aaTCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCCACTGGCCCAggag < 2:2294843/100‑3 (MQ=255) aTCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGa < 1:222939/100‑1 (MQ=255) aTCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGAc < 2:2959582/100‑1 (MQ=255) cGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACa < 2:1554824/100‑1 (MQ=255) gTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATc > 2:1859951/1‑100 (MQ=255) tGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCa > 2:2652307/1‑100 (MQ=255) tGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCa < 2:437617/100‑1 (MQ=255) gCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCaa > 2:1717873/1‑100 (MQ=255) tGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAg < 2:2753727/100‑1 (MQ=255) tGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAg > 1:174972/1‑100 (MQ=255) tGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAg < 2:1552198/100‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAg < 2:559342/100‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAgg < 2:111551/100‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAgg < 1:995009/100‑1 (MQ=255) tggtggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGa > 1:450796/1‑100 (MQ=255) tggtggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGAc > 2:1419497/1‑100 (MQ=255) ggtggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGCCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGAc > 1:1723060/1‑100 (MQ=255) gtggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAg > 1:1139832/1‑100 (MQ=255) ggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGt > 2:2067216/1‑100 (MQ=255) ggCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTg < 2:2550767/100‑1 (MQ=255) gCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTgc < 1:3141771/100‑1 (MQ=255) ccACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGcc < 1:3166046/100‑1 (MQ=255) ttGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGc < 1:229802/100‑1 (MQ=255) cTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCat > 1:278709/1‑100 (MQ=255) cTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCat > 2:2026330/1‑100 (MQ=255) cTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCat > 1:3240243/1‑100 (MQ=255) cTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCat > 2:247746/1‑100 (MQ=255) tGTAATTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCACAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCata > 2:644316/1‑100 (MQ=255) aaTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAttt < 1:2797377/100‑1 (MQ=255) aaTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAttt > 2:2604114/1‑100 (MQ=255) aTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCATGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAtttt < 2:1612583/100‑1 (MQ=255) aTTAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATAtttt > 2:3304077/1‑100 (MQ=255) ttAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTg > 2:2647018/1‑100 (MQ=255) ttAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTg > 2:2519468/1‑100 (MQ=255) tAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGc < 2:237149/100‑1 (MQ=255) tAAAACGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGc < 1:208487/100‑1 (MQ=255) aaaaCGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCGTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGc < 1:406435/99‑1 (MQ=255) aaaaCGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGcc > 1:962865/1‑100 (MQ=255) aaaCGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGccc > 1:2491174/1‑100 (MQ=255) aaCGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCg < 1:2592548/100‑1 (MQ=255) aaCGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCg > 2:1408062/1‑100 (MQ=255) aCGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCg > 1:2034248/1‑100 (MQ=255) cGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGAt < 2:2744856/100‑1 (MQ=255) cGGTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGAt < 2:1242020/100‑1 (MQ=255) ggTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGAt < 1:908217/100‑1 (MQ=255) gTAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATAc < 1:102465/100‑1 (MQ=255) tAGCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATAcc > 2:2963913/1‑100 (MQ=255) gCTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCa > 2:2723666/1‑100 (MQ=255) cTTAAG‑CCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATACTTTGCCCGATACCCAt > 2:3099941/1‑100 (MQ=255) ttAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCAt > 1:440300/1‑100 (MQ=255) aaGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCATTg < 2:1371978/100‑1 (MQ=255) ccccGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCATTGCgg < 2:1275425/100‑1 (MQ=255) | TAGCTGTGAAAATGACGATCTGAGAAGCGATAAGCGGCGAGCGAAATCGTGCTGTTGGTGGCATCCACTTGTTTGCTGTAATTAAAACGGTAGCTTAAGCCCCGCTCGTCCTGCTGAGTATCAAAATGGCTACTGGCCCAGGTGACATCAAAGGACAGTGCGCCAAGCCACAGCATATTTTGCCCGATACCCATTGCGG > NC_000913/750794‑750992 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |