| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,712,306:1 | (T)7→8 | 100% | intergenic (+148/‑463) | nth → / → dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,712,299 | 1 | . | T | 96.3% | 268.0 / 3.0 | 80 | intergenic (+141/‑470) | nth/dtpA | DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)/dipeptide and tripeptide permease A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/3); new base T (47/30); total (47/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393 | ttATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAGTGATGCGATGGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTg < 1:2374203/100‑1 (MQ=255)ttATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTg > 1:2795366/1‑100 (MQ=255) aTCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt > 2:1737999/1‑100 (MQ=255) tCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑t > 1:2311410/1‑100 (MQ=255) ccTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tt > 2:1845031/1‑100 (MQ=255) ctctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑ttt > 1:1693428/1‑100 (MQ=255) ctTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑ttttt > 2:2923689/1‑100 (MQ=255) ttttAAACCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttt < 2:1906699/100‑2 (MQ=255) ttttAAAACATTTTTTTAACGTCAATGATGTCATTGCTTAGTGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttt < 1:1024041/100‑2 (MQ=255) ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttt < 1:2855046/100‑2 (MQ=255) ttttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttt < 2:2017164/100‑2 (MQ=255) tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttta < 2:273990/100‑3 (MQ=255) tttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑tttttta < 2:85061/100‑3 (MQ=255) ttAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑ttttttaa < 2:2777282/100‑4 (MQ=255) tAAAACATCGTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTAAGCGTTATCATCAGTTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑tt‑ttttttaat < 1:1532382/100‑5 (MQ=255) aaCATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGc < 2:717209/100‑1 (MQ=255) cATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGa > 2:195505/1‑100 (MQ=255) tttttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAAtt > 2:139123/1‑100 (MQ=255) tttttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAAtt > 2:2604990/1‑100 (MQ=255) ttttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAAttt > 1:3294623/1‑100 (MQ=255) ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTc < 2:1807041/100‑1 (MQ=255) ttAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATATTc > 1:1945028/1‑100 (MQ=255) tAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCt < 2:1707490/100‑1 (MQ=255) aaCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTa < 2:1645794/100‑1 (MQ=255) aaCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTa < 2:1358707/100‑1 (MQ=255) aCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTat > 1:3268980/1‑100 (MQ=255) aCGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATACTCAGGTAATCCGTTTGCTGATAACCAAAAATGCATGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTa < 1:2207066/99‑1 (MQ=255) cgatgatgatgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCGAAAATGCAGGTGAATTG‑‑TTGTTTTTAATAGCGAACTTTTCt < 1:2028889/92‑1 (MQ=255) cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTATTATCGAAATTTTCTat > 1:1267295/1‑99 (MQ=255) cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTatt > 1:251750/1‑100 (MQ=255) cGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTatt > 2:225983/1‑100 (MQ=255) tCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattca > 2:2664617/1‑100 (MQ=255) tCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattca < 2:2794787/100‑1 (MQ=255) tCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattca > 1:485578/1‑100 (MQ=255) cAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTcagctgtt < 2:191815/100‑8 (MQ=255) cAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTattcat > 2:1419223/1‑100 (MQ=255) atgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGt < 2:1873033/99‑1 (MQ=255) tgCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGa > 1:2105337/1‑100 (MQ=255) gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt < 2:379380/100‑1 (MQ=255) gCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAt < 2:942627/100‑1 (MQ=255) ccATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATc > 2:816385/1‑100 (MQ=255) cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATTCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa < 1:1626439/100‑1 (MQ=255) cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 2:1131323/1‑100 (MQ=255) cATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCa > 2:2814898/1‑100 (MQ=255) ttGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAg < 1:2820609/100‑1 (MQ=255) ttGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAg > 1:3214714/1‑100 (MQ=255) gCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGAt > 2:2398984/1‑100 (MQ=255) cTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATGCGTGATCAAGATc > 2:1969883/1‑100 (MQ=255) ttAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 1:2461492/100‑1 (MQ=255) tctgCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTACAAAAAACAAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCa < 1:813429/97‑1 (MQ=255) tAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAc < 2:655168/100‑1 (MQ=255) gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAtcaagatcaaga > 2:813432/1‑100 (MQ=255) gCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGa > 1:2266029/1‑100 (MQ=255) cGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCAcca < 2:2297746/99‑3 (MQ=255) cGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATg < 1:91422/100‑1 (MQ=255) gTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATg > 1:238306/1‑100 (MQ=255) ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 2:708009/100‑1 (MQ=255) ttATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGc < 2:822335/100‑1 (MQ=255) catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATATAGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCt > 1:800373/1‑97 (MQ=255) catcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATTCTGTc > 1:2996580/1‑100 (MQ=255) atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg < 1:195505/100‑1 (MQ=255) atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 2:3234016/1‑100 (MQ=255) atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg > 2:2131221/1‑100 (MQ=255) atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCg < 2:2203668/100‑1 (MQ=255) atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGAAGCTGTc > 1:1442342/1‑99 (MQ=255) atcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGAAGGATAATTGTTTT‑TTTTTAATAGCGCAATTTTATAATAATACGTGTTCCAGATCACGATACTGt > 1:2606059/1‑99 (MQ=255) tcaGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTCTTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGc < 2:3214742/100‑1 (MQ=255) aGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCaa > 2:3086448/1‑100 (MQ=255) ggTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAAt > 2:1454136/1‑100 (MQ=255) gTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATg > 1:553466/1‑100 (MQ=255) tAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGt > 1:470037/1‑100 (MQ=255) naTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTa > 1:1562068/2‑100 (MQ=255) aTCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTaa < 2:1578249/100‑1 (MQ=255) ttGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACAt < 1:2610249/100‑1 (MQ=255) cGGATAATCCAAAATCCAGGTTAATTG‑‑TTAATTCTACTATACAAATTCTTTATTCATTCTAAATCAAGATCACGAGGCTGTCGCAATGTAAAAACATTg < 1:2826090/99‑1 (MQ=255) cGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATATCTAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGc > 2:311289/1‑100 (MQ=255) ggATAACCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCa > 1:405024/1‑100 (MQ=255) aaCCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTTTTTTTTTAATCTTCTATTCAGTAGTGATCAAGAGCACGATTATGTTGCAATTTAAAAACAtttaaatat > 1:1524902/1‑93 (MQ=255) aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGaa > 2:3341152/1‑100 (MQ=255) aCCAAAAATGCAGGTTAATTGTTTT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGaa > 2:1312451/1‑100 (MQ=255) aCCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:105915/1‑100 (MQ=255) aCCAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAAt > 2:2440932/1‑100 (MQ=255) ccAAAAATGCGGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 1:3112690/1‑100 (MQ=255) ccAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGAACAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATc > 2:1048437/1‑100 (MQ=255) cAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:2097045/1‑100 (MQ=255) cAAAAATGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 2:17071/1‑100 (MQ=255) aaaaaTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAg > 2:1393818/1‑100 (MQ=255) aaaaTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATATTGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCa > 1:1119235/1‑98 (MQ=255) aaaTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 1:242895/100‑1 (MQ=255) aaaTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGt < 1:2796454/100‑1 (MQ=255) aTGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTa < 2:1231890/100‑1 (MQ=255) tGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaa < 2:453269/100‑1 (MQ=255) tGCAGGTTAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTaa > 1:431868/1‑100 (MQ=255) tAATTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTGTATATTCATTCGTTATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAtt < 1:1083474/100‑1 (MQ=255) aaTTGT‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCAttt < 2:271664/100‑1 (MQ=255) | TTATCCTCTTTTAAAACATCTTTTTAACGTCAATGATGCCATTGCTTAGCGTTATCATCAGGTAATCCGTTTGCGGATAACCAAAAATGCAGGTTAATTG‑‑TT‑TTTTTAATAGCGAAATTTTCTATTCATTCGTGATCAAGATCACGATGCTGTCGCAATGTAAAAACATTGCAAGAATCAGGTTAAAATCATTT > NC_000913/1712200‑1712393 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |