| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,469,656:1 | (T)7→8 | 100% | coding (526/1332 nt) | gtrS → | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,469,649 | 1 | . | T | 94.9% | 511.3 / 19.1 | 157 | coding (519/1332 nt) | gtrS | serotype‑specific glucosyl transferase, CPS‑53 (KpLE1) prophage |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/5); new base T (71/78); total (74/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 | |||||||||||
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
AATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑T‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACA > NC_000913/2469550‑2469743 | aaTGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTa > 2:1868350/1‑100 (MQ=255) aTGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t > 2:551298/1‑100 (MQ=255) gCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tt < 2:869120/100‑1 (MQ=255) atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttc < 2:2559328/100‑3 (MQ=255) atcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttc < 2:2823042/100‑3 (MQ=255) tcatTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttcg < 2:1513377/100‑4 (MQ=255) catTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttcgt < 2:567989/100‑5 (MQ=255) catTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttcgt < 1:2026535/100‑5 (MQ=255) catTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttcgt < 2:2664679/100‑5 (MQ=255) catTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCAATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttcgt > 1:2485855/1‑96 (MQ=255) atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttcgtt > 2:1207985/1‑95 (MQ=255) atTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑t‑tttt‑tttcgtt < 2:774056/100‑6 (MQ=255) tCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTTGTGTATTAAAAAAAATAAAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGc < 1:1020407/100‑1 (MQ=255) tCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGc < 2:394851/100‑1 (MQ=255) cTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCt > 2:2927501/1‑100 (MQ=255) cTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCt < 1:2385821/100‑1 (MQ=255) tATCAAGGGCAAAGATTTATAATGTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCta < 1:3355462/100‑1 (MQ=255) tATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCta > 2:1827805/1‑100 (MQ=255) aaGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCtaataa > 1:1760359/1‑100 (MQ=255) aaGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑T‑TTTTCTTCGTTGCtaataa > 1:2238033/1‑100 (MQ=255) agagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTactaat > 1:919051/1‑100 (MQ=255) agagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTaataat > 2:525543/1‑100 (MQ=255) agagCAAATAGTTACAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTaataat < 1:961243/100‑1 (MQ=255) aaaacAAATAGTTATAATTTTCCTTCCAATTTTTGTGTATTCATAAAAAAACAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCtaataa < 1:492593/95‑1 (MQ=255) gagCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAataata < 2:3308381/100‑1 (MQ=255) agCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTTTTTTTTTTTTTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTTCTAATTatat > 1:3222676/1‑100 (MQ=255) gCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATc < 1:3120793/100‑1 (MQ=255) gCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATc > 1:1355795/1‑100 (MQ=255) gCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑T‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCt < 2:1267523/100‑1 (MQ=255) naaaTAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTTTTTTCTAATATTATCt > 1:371737/2‑100 (MQ=255) cAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCt > 1:1288605/1‑100 (MQ=255) tAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTg < 2:2658001/100‑1 (MQ=255) aGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGc > 2:2216480/1‑100 (MQ=255) ttATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTa < 1:3019608/100‑1 (MQ=255) tataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaa > 2:3206160/1‑100 (MQ=255) ataATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaaa < 1:2706284/100‑1 (MQ=255) taATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTaa > 1:3191669/1‑98 (MQ=255) aTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAAt < 2:885877/100‑1 (MQ=255) aTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAAt < 1:1940252/100‑1 (MQ=255) aTTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTAGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAAt < 1:1855265/100‑1 (MQ=255) aTTTTACTCCCATTTTTTGTTTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAAt < 1:1555273/100‑1 (MQ=255) ttttCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATc < 1:702464/100‑1 (MQ=255) tttCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCa > 2:3138095/1‑100 (MQ=255) cttccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTGGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCa > 1:1482445/2‑100 (MQ=255) tccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAAt < 2:3108658/100‑1 (MQ=255) tccttccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTACTAATAATATCTACTGCTAAAAATCatt > 1:3128278/1‑98 (MQ=255) tccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtaa > 2:2724454/1‑99 (MQ=255) ccATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTtata < 1:2053297/100‑1 (MQ=255) aTTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATAtt > 2:23285/1‑100 (MQ=255) tGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAAccc > 2:1783522/1‑100 (MQ=255) gtgtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCa < 1:2824083/100‑1 (MQ=255) gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATTCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACt < 1:1131491/100‑1 (MQ=255) gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTTTTTTTTATTAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACTCCACt > 1:2903261/1‑100 (MQ=255) gtATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACt < 2:756620/100‑1 (MQ=255) tATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTTCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCTCACTa > 1:2568825/1‑100 (MQ=255) tCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATa < 1:166621/100‑1 (MQ=255) cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATa > 2:1036260/1‑99 (MQ=255) cATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg > 1:3291775/1‑100 (MQ=255) aTTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg < 2:396978/99‑1 (MQ=255) aTTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAg > 2:2418505/1‑99 (MQ=255) ttAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg < 2:2768873/100‑1 (MQ=255) ttAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAgtg < 2:346673/100‑1 (MQ=255) ataTGCAAAATTAATTAATCTATTCTATTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTAACACTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTa < 1:2320728/97‑1 (MQ=255) aCATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAt > 2:146801/1‑100 (MQ=255) cATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTTTTTTTTTTTAATATCTAATGCTAAAAATCAATTTTTATTAACCCCACTAATAGTGTAtt > 1:210747/1‑100 (MQ=255) cATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAtt > 2:16433/1‑100 (MQ=255) cATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAtt < 2:14186/100‑1 (MQ=255) tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTAtt > 1:54683/1‑98 (MQ=255) tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa > 2:2995570/1‑100 (MQ=255) tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa < 1:2985809/100‑1 (MQ=255) tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa < 1:1317174/100‑1 (MQ=255) tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa < 2:789415/100‑1 (MQ=255) tGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa > 2:1706789/1‑100 (MQ=255) gCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCat > 2:1943848/1‑100 (MQ=255) gCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCa < 2:2840793/99‑1 (MQ=255) cAAAAACAATAAGTCTATGCTTTTGCTA‑TATGTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTAATGCTGAAAATCAATTTATAGGAACCCAACAATGAGTGTGTTCa < 1:2092216/98‑1 (MQ=255) cAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCata > 2:1576905/1‑100 (MQ=255) 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aaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatt < 1:3048732/100‑1 (MQ=255) aaaaCAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑T‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCatatta < 1:1607748/100‑1 (MQ=255) tAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTCTTCATATTATAtttt > 2:3343411/1‑100 (MQ=255) tAAATCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttt > 1:150080/1‑100 (MQ=255) aaTCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttt > 1:1678160/1‑100 (MQ=255) aaTCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttt < 1:2216465/100‑1 (MQ=255) tCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt < 2:3014144/100‑1 (MQ=255) tCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt < 2:1887348/100‑1 (MQ=255) tCTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATAtttttttt < 2:1094145/100‑1 (MQ=255) cTATGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTg < 2:2813686/100‑1 (MQ=255) tGCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATa < 1:2821805/100‑1 (MQ=255) gCTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAg > 2:472484/1‑100 (MQ=255) cTTTTGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGa < 1:385351/100‑1 (MQ=255) ttttGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGa < 1:1416857/99‑1 (MQ=255) tGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCGTATTATATTTTTTTTGATAGAcaca < 1:1946772/100‑1 (MQ=255) tGCTATT‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGAcaca < 2:1760370/100‑1 (MQ=255) | AATGTTTGCATCATTCTATCAAGAGCAAATAGTTATAATTTTCCTTCCATTTTTGGTGTATTCATTAACATGCAAAAACAATAAATCTATGCTTTTGCTA‑T‑TTTT‑TTCGTTGCTAATAATATCTACTGCTAAAAATCAATTTATATTAACCCCACTAATAGTGTATTCATATTATATTTTTTTTGATAGACACA > NC_000913/2469550‑2469743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |