| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2077186 | 101 (0.820) | 17 (0.150) | 11/162 | NT | 15.5% | coding (75/369 nt) | cbeA | CP4‑44 prophage; cytoskeleton bundling‑enhancing factor A; CbtA antitoxin |
| ? | NC_000913 | = 2077212 | 94 (0.840) | coding (101/369 nt) | cbeA | CP4‑44 prophage; cytoskeleton bundling‑enhancing factor A; CbtA antitoxin | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCC > NC_000913/2077114‑2077311 | gtCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCtn < 1:1031802/100‑2 (MQ=255) cAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggt < 2:1491434‑M2/100‑4 (MQ=255) cAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggt < 2:2931371‑M2/100‑4 (MQ=255) aGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtg > 2:3043949‑M2/1‑96 (MQ=255) gACAGACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgc < 1:680908‑M2/100‑6 (MQ=255) gACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgc > 1:1130447‑M2/1‑95 (MQ=255) acacacTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgca > 1:516189‑M2/1‑94 (MQ=255) acacTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagg < 1:633405‑M2/100‑9 (MQ=255) cacTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCagga > 2:2652368/1‑100 (MQ=255) cacTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCagga > 2:3102128/1‑100 (MQ=255) acTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCaggag < 2:1132776/100‑1 (MQ=255) cTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCaggagg > 2:3310522/1‑100 (MQ=255) cTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCaggagg > 1:1999139/1‑100 (MQ=255) cTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCaggagg > 1:3181483/1‑100 (MQ=255) ccccGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAggga > 2:3292481/1‑99 (MQ=255) ccGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTaa > 2:853390/1‑100 (MQ=255) ccGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTaa > 1:2109129/1‑100 (MQ=255) gACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCgg < 2:1247226/100‑1 (MQ=255) caacaCTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGtt > 1:1892900/1‑100 (MQ=255) caacaCTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCATGGTGGGGGCTGCCCTGGACAGTGACGACCTGTTTCGGGGAACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGt > 1:866288/1‑99 (MQ=255) acgcTTCCCGACGACAACAAAGACCTCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCCTGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGCTGc < 2:1408260/97‑1 (MQ=255) cacTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTgag > 2:668232/1‑98 (MQ=255) cacTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCa < 1:1003274/100‑1 (MQ=255) cTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCAtt < 2:2590695/100‑1 (MQ=255) tCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTAc > 1:1533258/1‑100 (MQ=255) ccGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCt > 2:31863/1‑100 (MQ=255) cgacAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGcc < 1:592629/100‑1 (MQ=255) aTCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACcg > 2:1572521/1‑100 (MQ=255) tCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACcgc < 1:187881/100‑1 (MQ=255) cACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACcgcg > 2:590595/1‑100 (MQ=255) gACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCg < 2:1830530/100‑1 (MQ=255) aCCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCgg < 1:1306344/100‑1 (MQ=255) aCCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCgg < 2:1889109/100‑1 (MQ=255) aCCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCgg < 2:643642/100‑1 (MQ=255) ccGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCTTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGt < 2:3229536/100‑1 (MQ=255) cGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTa < 1:3102102/100‑1 (MQ=255) cGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTa > 2:2643858/1‑100 (MQ=255) ccccTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATc > 2:1574347/1‑100 (MQ=255) cccTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCa < 1:2901187/100‑1 (MQ=255) cccTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCa < 1:2430862/100‑1 (MQ=255) cccTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCa > 1:1951365/1‑100 (MQ=255) cgtggtggGTGCTGCCCTTCACCGTGGCGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGGCCGCGCCGGTATCag < 1:3116019/98‑1 (MQ=38) tggtggGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCagag < 2:1533265/100‑1 (MQ=255) tggtggGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCagag < 2:3091226/100‑1 (MQ=255) ggtggGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAgg > 2:2959310/1‑100 (MQ=255) ggtggGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAgg > 2:216071/1‑100 (MQ=255) gtggGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGc > 1:1126812/1‑100 (MQ=255) gtggGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGc < 1:681048/100‑1 (MQ=255) ggCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTTTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCCACCGCGCCGGTAACAGAgg > 1:3149977/1‑94 (MQ=255) ggCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGtt < 2:1765306/100‑1 (MQ=255) gCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTc > 2:1894559/1‑100 (MQ=255) cTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccgggga < 2:1391011‑M2/100‑63 (MQ=255) cTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCa < 2:1502345/100‑1 (MQ=255) gCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGc < 2:1332382/100‑1 (MQ=255) gCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGc < 2:2935187/100‑1 (MQ=255) gCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGc < 2:2259468/100‑1 (MQ=255) gCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGc > 2:1876179/1‑100 (MQ=255) cccTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtg < 1:3389431‑M2/100‑66 (MQ=255) cccTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtg < 1:2995344‑M2/100‑66 (MQ=255) cccTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCg < 2:680911/100‑1 (MQ=255) ccTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGTGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTGGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGa < 2:886634/100‑1 (MQ=255) ccTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgt < 2:712411‑M2/100‑67 (MQ=255) ccTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcaggacagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgt < 1:2277508‑M2/100‑67 (MQ=255) cTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgtg < 2:755122‑M2/100‑68 (MQ=255) cTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgtg < 2:3086036‑M2/100‑68 (MQ=255) cTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgtg < 2:213179‑M2/100‑68 (MQ=255) tGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATg < 2:2627619/100‑1 (MQ=255) gCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgtgtc < 2:1665211‑M2/100‑70 (MQ=255) gCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgtgtc < 2:1443479‑M2/100‑70 (MQ=255) cACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGc < 1:383706/99‑1 (MQ=255) cACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCa < 2:1076355/100‑1 (MQ=255) cACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCa < 1:2866362/100‑1 (MQ=255) cGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGAt > 1:919563/1‑100 (MQ=255) gACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCg < 1:1910918/100‑1 (MQ=255) cGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTa < 1:1057179/100‑1 (MQ=255) cGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTa < 1:523250/100‑1 (MQ=255) cTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATACAGATGCGTacc > 1:3156085/1‑98 (MQ=255) tGTTTCGGGGCACGTCAcggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgtgtctgacacgataaaa < 1:2501101‑M2/100‑84 (MQ=255) ttCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCTGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTgg < 1:1562182/100‑1 (MQ=255) ttCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTgg < 2:2787410/100‑1 (MQ=255) ttCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTgg < 2:751812/100‑1 (MQ=255) tCGGGGCACGTCTggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgtgtctgacacgataaaatcctt > 2:2197764‑M2/1‑13 (MQ=255) cGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGAc < 2:3323276/100‑1 (MQ=255) ggggCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCGGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGAcc > 1:943420/1‑100 (MQ=255) ggggCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTCCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTTGAcc < 1:2984351/100‑1 (MQ=255) ggggCACGTCTAGAGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTAACTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGCTGCGTACCACCTGGAcc > 1:2091667/1‑100 (MQ=255) gggCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCa > 2:239180/1‑100 (MQ=255) gCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAgg < 2:431236/100‑1 (MQ=255) aCGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGcc < 1:2865645/100‑1 (MQ=255) aCGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGcc < 2:1875742/100‑1 (MQ=255) cGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTCCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGACCt > 1:1324055/1‑100 (MQ=255) cGTCTGGTGCAAGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGcc < 1:618366/99‑1 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCtt > 2:464949/1‑100 (MQ=255) gTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCt > 1:2600676/1‑99 (MQ=255) tCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCttt > 2:3027420/1‑100 (MQ=255) cTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTc < 1:1246749/100‑1 (MQ=255) cTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTc < 1:2503063/100‑1 (MQ=255) tggtgcagggcagcccccaccaggggcggtcgtgattgtcgtcgggaagtgttgtcccggggagtgtgtctgacacgataaaatccttacagaaaatcgg > 1:712408‑M2/1‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTcc < 2:56704/100‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTcc < 1:2012619/100‑1 (MQ=255) | GTCAGACACACTCCCCGGGACAACACTTCCCGACGACAATCACGACCGCCCCTGGTGGGGGCTGCCCTGCACCGTGACGCCCTGTTTCGGGGCACGTCTGGTGCAGGAGGGTAACCGGTTGCATTACCTTGCCGACCGCGCCGGTATCAGAGGCCTGTTCAGCGATGCAGATGCGTACCACCTGGACCAGGCCTTTCC > NC_000913/2077114‑2077311 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |