| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,071,321 | A→G | 100% | intergenic (+110/‑218) | yeeP → / → flu | pseudogene, CP4‑44 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family;Phage or Prophage Related; putative histone/CP4‑44 prophage; antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,071,321 | 0 | A | G | 98.7% | 514.8 / ‑3.1 | 146 | intergenic (+110/‑218) | yeeP/flu | pseudogene, CP4‑44 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family;Phage or Prophage Related; putative histone/CP4‑44 prophage; antigen 43 (Ag43) phase‑variable biofilm formation autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (78/66); total (79/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.33e-01 | |||||||||||
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAA > NC_000913/2071225‑2071416 | gATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGata < 1:1293058/100‑1 (MQ=255) tGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATc < 2:2996665/100‑1 (MQ=255) gCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCt > 1:1031453/1‑100 (MQ=255) ccctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTa > 2:2547119/1‑100 (MQ=255) ccctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTa > 1:582849/1‑100 (MQ=255) cctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTAt > 2:2152222/1‑100 (MQ=255) tccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTAttt < 2:2500153/100‑1 (MQ=255) ccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTAtttt > 1:255501/1‑100 (MQ=255) tGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTatc < 1:2662844/100‑1 (MQ=255) tGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTatc < 2:2748730/100‑1 (MQ=255) tGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTatc < 2:438041/100‑1 (MQ=255) tGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTatc < 1:1156208/100‑1 (MQ=255) tGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTatc < 2:2855791/100‑1 (MQ=255) gACTCTGAGTCTGGTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTatcg > 2:2277409/1‑100 (MQ=255) ctctGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTTTTGTCCGTGCAATAGCTCATTAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTatcgat > 2:2377441/1‑100 (MQ=255) aGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGttt < 2:2826279/100‑1 (MQ=255) gTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTta < 1:3201832/100‑1 (MQ=255) tccgatctcaAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTtat < 1:1516011/92‑1 (MQ=255) tCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTtat < 1:2731989/100‑1 (MQ=255) cTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATTATAGAATAAAACTATCGATATCTATTTTATCGATCGttt > 1:110636/1‑97 (MQ=255) cTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTtat‑a > 2:2894050/1‑100 (MQ=255) cTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTtat‑a > 1:914682/1‑100 (MQ=255) tGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTat‑at > 1:1210891/1‑100 (MQ=255) tGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTat‑at < 2:38230/100‑1 (MQ=255) gccTCACAAAAGCACTGTTTTCATTACTGTCCCTCTAGTCCGTGCATTAGCTTAATAATAGAATAAAACGATCGATACCTATTTTatcgatccgtta < 1:2024720/95‑6 (MQ=255) gCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atc > 1:1671681/1‑100 (MQ=255) cTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atcg > 1:1061872/1‑100 (MQ=255) cTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atcg > 2:3336077/1‑100 (MQ=255) cTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atcg < 1:2431729/100‑1 (MQ=255) cacaAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atcgat > 1:695013/1‑100 (MQ=255) cacaAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atcgat > 1:1428402/1‑100 (MQ=255) acaAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atcgatc < 2:1794594/100‑1 (MQ=255) acaAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atcgatc < 1:2982580/100‑1 (MQ=255) caAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATTGATCGTTTAT‑atcgatcg > 1:2541265/1‑100 (MQ=255) caAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTtat‑agatcgga > 2:1516018/1‑93 (MQ=255) aaaGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATcgatcgat < 2:1123564/100‑1 (MQ=255) aGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTAAATAATAAAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑atcaatc > 1:630245/1‑95 (MQ=255) gCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAg > 2:2909459/1‑100 (MQ=255) aCTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCt < 1:3206269/100‑1 (MQ=255) cTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCta > 2:3364664/1‑100 (MQ=255) tGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCtaa < 1:1521381/100‑1 (MQ=255) tGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCG‑ATATAAACGATCGATaaaatag < 2:1471963/100‑6 (MQ=25) tttCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCtaataa < 1:2985092/100‑1 (MQ=255) tttCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCtaataa > 2:2533379/1‑100 (MQ=255) tCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCtaataata < 1:1648290/100‑1 (MQ=255) tCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCtaataata > 1:580734/1‑100 (MQ=255) tCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCtaataata > 1:2679868/1‑100 (MQ=255) gTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCtaataataa > 2:3057389/1‑99 (MQ=255) gTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAAc > 1:3357151/1‑100 (MQ=255) ttACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAAcc < 1:2268176/100‑1 (MQ=255) ccgatctctctcTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAAcc < 1:2957592/94‑1 (MQ=255) aCTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCtt > 2:2122534/1‑100 (MQ=255) tctctcTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTc < 1:2932521/100‑1 (MQ=255) tctctcTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTc < 2:2993650/100‑1 (MQ=255) tctctcGTGTCCGTGCTATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTc < 1:2833550/100‑1 (MQ=255) ctctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCa > 2:1468756/1‑100 (MQ=255) ctctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCa > 1:2437945/1‑100 (MQ=255) ctctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCa > 2:1880743/1‑100 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAg < 1:495447/100‑1 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAg < 2:263178/100‑1 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAg < 1:2911147/100‑1 (MQ=255) ctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGt > 2:1269048/1‑100 (MQ=255) tctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTa > 2:2915050/1‑100 (MQ=255) tctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTa < 2:3080867/100‑1 (MQ=255) tctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTa < 2:1753256/100‑1 (MQ=255) tGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATGAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTACCa < 1:1918166/100‑1 (MQ=255) tGTCCGTGCAATAGCTAAATAATAGAATAAAACGATTGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACa < 1:373529/100‑1 (MQ=255) gTCCGTGCAATAGCTCAATAGTAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTGAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGt < 1:1006892/95‑1 (MQ=255) tCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATg < 1:1746265/100‑1 (MQ=255) tCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTATCAGTAACATg > 2:759348/1‑100 (MQ=255) ccGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGc < 2:772997/100‑1 (MQ=255) ccGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGc < 1:1438259/100‑1 (MQ=255) cGTGCAATAGCTCAATACTAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAAACTTTGTCAGTAACATg > 1:2852672/1‑98 (MQ=255) cGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATTGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCCATAAGCTAATAATAACCTTCGTCAGTAACATGc < 1:257363/99‑1 (MQ=255) gCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg > 2:1982803/1‑100 (MQ=255) gCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg > 1:2126286/1‑100 (MQ=255) tAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATAc > 2:1726745/1‑100 (MQ=255) aGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACg < 2:582852/100‑1 (MQ=255) aGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACg > 2:132904/1‑100 (MQ=255) aGCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACg < 1:740242/100‑1 (MQ=255) gCTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATATGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGCTACGt > 2:1997540/1‑100 (MQ=255) cTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAAGTTTTGTCAGTAACATGCACAGATAc > 1:1994206/1‑97 (MQ=255) cTCAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTa > 1:2712376/1‑100 (MQ=255) cAATAATAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACa > 1:2180492/1‑100 (MQ=255) aataatAGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACa < 1:50012/99‑1 (MQ=255) ataGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAg > 2:1489731/1‑100 (MQ=255) taGAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGa > 2:1904017/1‑100 (MQ=255) gAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACa > 2:1144083/1‑100 (MQ=255) gAATAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACa > 2:1806768/1‑100 (MQ=255) aaTAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACAt > 2:2627608/1‑100 (MQ=255) aaTAAAACGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACAt < 2:466424/100‑1 (MQ=255) aaaCGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑AACGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCa > 1:922991/1‑99 (MQ=255) aaCGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAgg < 1:673055/100‑1 (MQ=255) aCGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAggg > 1:2949077/1‑100 (MQ=255) aCGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAggg < 1:2531733/100‑1 (MQ=255) aCGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAggg < 2:2109808/100‑1 (MQ=255) aCGATCGATATCTATTTTATCGATCGTTGAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAggg < 1:760221/100‑1 (MQ=255) cgatcgatATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAggg > 1:2260383/1‑99 (MQ=255) cgatcgatATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGa < 1:1904004/100‑1 (MQ=255) gATCGATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGaa > 1:1734964/1‑100 (MQ=255) | GATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTAT‑ATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAA > NC_000913/2071225‑2071416 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |