Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,161,946 | A→G | 58.8% | A161A (GCA→GCG) | iceT → | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,161,946 | 0 | A | G | 58.8% | 83.5 / 117.9 | 116 | A161A (GCA→GCG) | iceT | putative citrate/iron‑citrate/zinc‑citrate efflux transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (24/24); new base G (38/30); total (62/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GCGCGAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGC > NC_000913/2161847‑2162045 | cgcgAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCAt > 1:1071356/1‑100 (MQ=255) gAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGcgtcgt < 1:1066422/100‑1 (MQ=255) aGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTg > 1:3334166/1‑100 (MQ=255) cAATGTATGGCGGCGATGACCTTTGGCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGc < 1:1109204/100‑1 (MQ=255) cAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGc > 1:81935/1‑100 (MQ=255) aaTATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCa < 1:952826/100‑1 (MQ=255) tatatGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGATCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACt < 2:2904874/100‑1 (MQ=255) atGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCTGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTCCGCATCGTGGCACTGGa < 1:2314101/100‑1 (MQ=255) ggcggcGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATc < 2:2422568/100‑1 (MQ=255) ggcggcGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATc > 2:3235792/1‑100 (MQ=255) gcggctATGACCGGTGTGACGGTACCGGGTCAGGTCGGTCCGCTGCGCGGTCCGGCGCACAGCGGTCTGCTGGTGGATTACGCATCGTGGCACTGGATc < 1:1578256/99‑1 (MQ=255) gcggcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGATCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCt > 1:656931/1‑100 (MQ=255) cggcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGTTCtt > 2:250318/1‑100 (MQ=255) gcgATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCtttt > 1:1522954/1‑100 (MQ=255) aTGACCATTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCttttt < 1:2853627/98‑1 (MQ=255) tGACCTTTGTCACGTGACCCGGTCAGGTCGGTCGGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGAt < 1:130233/100‑1 (MQ=255) gACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATc > 1:2215992/1‑100 (MQ=255) aCCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCa > 2:476418/1‑100 (MQ=255) aCCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCa > 1:1167033/1‑100 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa > 1:215957/1‑100 (MQ=255) ccTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCaa > 2:540803/1‑100 (MQ=255) ttGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACAt > 1:1064833/1‑100 (MQ=255) tCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTcc > 2:16312/1‑100 (MQ=255) tCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTcc > 2:1886697/1‑100 (MQ=255) naCGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCg > 1:3075329/2‑100 (MQ=255) aCGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCgg < 2:411982/100‑1 (MQ=255) aCGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCgg < 2:2574600/100‑1 (MQ=255) cGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGt > 2:2993565/1‑100 (MQ=255) cGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGt < 1:576499/100‑1 (MQ=255) gTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGTTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTg > 2:811315/1‑100 (MQ=255) ttACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTgg < 2:3231618/100‑1 (MQ=255) tACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTggg > 2:2157505/1‑100 (MQ=255) tACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTggg < 2:1095788/100‑1 (MQ=255) tACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTggg < 2:1844282/100‑1 (MQ=255) aCCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTgggg > 1:3377526/1‑100 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGaat > 2:1749610/1‑98 (MQ=255) cGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGCTCCGGCGGTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGCCGTGGCACGGGCCCTGTTTGAACAACATTCCGGtcg > 1:1538661/1‑93 (MQ=255) tCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATc < 1:1800555/100‑1 (MQ=255) tCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATc > 1:283476/1‑100 (MQ=255) cAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCg > 2:1795092/1‑100 (MQ=255) aGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCgg > 2:3158579/1‑100 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGt > 2:1292750/1‑100 (MQ=255) ggtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGt > 2:1804003/1‑100 (MQ=255) gtcggtgCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg < 1:3035463/100‑1 (MQ=255) gtcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg < 1:1965448/100‑1 (MQ=255) tcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGc < 2:2139960/100‑1 (MQ=255) tcggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGGCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTg < 1:161710/99‑1 (MQ=255) cggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCg < 2:1284338/100‑1 (MQ=255) ggtcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGa > 2:1317987/1‑100 (MQ=255) tcCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATc < 1:776805/100‑1 (MQ=255) gatctgctCGGTCTGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCg < 1:816140/97‑1 (MQ=255) cGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGc > 2:519040/1‑100 (MQ=255) gctgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGcc < 1:2617801/100‑1 (MQ=255) gctgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGcc < 2:1340779/100‑1 (MQ=255) gctgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGcc < 2:3268364/100‑1 (MQ=255) ctgcgCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGcc < 1:704841/99‑1 (MQ=255) tgctCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCcac > 2:2022369/1‑100 (MQ=255) gctCGGTCTGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCgagatc > 2:816143/1‑95 (MQ=255) tCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACAtt > 1:2121362/1‑100 (MQ=255) cGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTg > 2:1075787/1‑100 (MQ=255) cGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTg > 2:2429187/1‑100 (MQ=255) ggTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGc < 2:1770812/100‑1 (MQ=255) gTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt > 2:2595858/1‑100 (MQ=255) gTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCt > 2:2338064/1‑100 (MQ=255) tCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTg < 2:2625182/100‑1 (MQ=255) tCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGGACGCGTCGTGGCACTGGAGCTTTTTGCTCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTg < 1:3010633/100‑1 (MQ=255) cGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGtt < 2:1148150/100‑1 (MQ=255) gcTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATg < 2:1277251/100‑1 (MQ=255) cggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCg > 2:2697564/1‑100 (MQ=255) cggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCg < 2:2436174/100‑1 (MQ=255) cggcggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGAACTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGCTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGcc > 1:1301284/1‑99 (MQ=255) cggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAAc > 2:512372/1‑100 (MQ=255) cggTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTAATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAAc < 1:3252963/100‑1 (MQ=255) ggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACt > 1:1885182/1‑100 (MQ=255) ggTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACt < 2:1167037/100‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTa < 1:2993539/100‑1 (MQ=255) gTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTa > 2:1572948/1‑100 (MQ=255) tatgctgGTGGAGTAGGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTac < 1:2825248/98‑1 (MQ=255) ctgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTaca < 2:3057915/100‑1 (MQ=255) tgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTacac > 2:1860239/1‑100 (MQ=255) tgctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTacac < 2:3156401/100‑1 (MQ=255) gctgGTGGAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACAcc > 1:3335957/1‑100 (MQ=255) gctgGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACAcc < 2:3377555/100‑1 (MQ=255) ctgGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCa < 2:1697738/100‑1 (MQ=255) tggtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCTACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCAt > 1:2079908/1‑100 (MQ=255) tggtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCAt > 2:3259925/1‑100 (MQ=255) ggtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATg > 1:225431/1‑100 (MQ=255) gtggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCTAACTACACCATGc < 2:2276479/100‑1 (MQ=255) tggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCa > 2:434391/1‑100 (MQ=255) ggAGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAg > 2:2090482/1‑100 (MQ=255) gAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGa < 1:2628630/100‑1 (MQ=255) aGTACGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAc > 1:2027093/1‑100 (MQ=255) aGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAc > 1:1503478/1‑100 (MQ=255) aCGCGTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGAcgcg < 2:518324/100‑1 (MQ=255) cgcgTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACgcgg > 1:2406693/1‑100 (MQ=255) cGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACCCCATGCAGACgcgg > 2:400225/1‑100 (MQ=255) gCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACgcggc < 2:1186660/100‑1 (MQ=255) cATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACgcggcg > 1:2382558/1‑100 (MQ=255) cATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACgcggcg > 2:2210197/1‑100 (MQ=255) aTCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGgcgc > 1:231966/1‑100 (MQ=255) | GCGCGAGCAATATATGGCGGCGATGACCTTTGTCACGTTACCCGGTCAGGTCGGTCCGCTGCTCGGTCCGGCGCTCGGCGGTCTGCTGGTGGAGTACGCATCGTGGCACTGGATCTTTTTGATCAACATTCCGGTGGGGATTATCGGTGCGATCGCCACATTGCTGTTAATGCCGAACTACACCATGCAGACGCGGCGC > NC_000913/2161847‑2162045 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |