| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,278,298 | C→T | 100% | intergenic (‑61/+272) | yejG ← / ← bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,278,298 | 0 | C | T | 98.4% | 425.1 / ‑2.5 | 127 | intergenic (‑61/+272) | yejG/bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (64/60); total (65/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
GCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCACGTTTG > NC_000913/2278201‑2278396 | gCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaa < 1:3310355/100‑1 (MQ=255) cAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaac < 1:3197770/100‑1 (MQ=255) cAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaac < 2:107609/100‑1 (MQ=255) cAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATtaac > 1:369513/1‑100 (MQ=255) tCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACGCATCATTAACAAt < 1:3318757/100‑1 (MQ=255) cGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATc > 2:2311666/1‑100 (MQ=255) gATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATcc > 2:1739488/1‑100 (MQ=255) aTGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATccn < 2:1910566/100‑2 (MQ=255) aTGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCg > 1:416453/1‑100 (MQ=255) tGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGt > 2:1170267/1‑100 (MQ=255) ggACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTc < 2:264365/100‑1 (MQ=255) ggACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTc > 2:1203050/1‑100 (MQ=255) ggACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTc > 1:668201/1‑100 (MQ=255) aCGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTACTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACACCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTc < 2:2080970/98‑1 (MQ=255) aCGATATAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTGTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTcgt < 1:3078548/100‑3 (MQ=255) cGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCttt < 1:757467/100‑1 (MQ=255) cGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCttt < 1:1076154/100‑1 (MQ=255) cGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCttt > 2:3157061/1‑100 (MQ=255) gATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTta < 1:1016405/100‑1 (MQ=255) aTTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTtat < 1:2477431/100‑1 (MQ=255) aTTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTtat > 2:1235395/1‑100 (MQ=255) tGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATAc < 1:2787796/100‑1 (MQ=255) tGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATAc < 1:1143589/100‑1 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa < 2:668204/100‑1 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa > 1:1951738/1‑100 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa > 1:1011200/1‑100 (MQ=255) gatttGTAATGAAGTCACTTAGTTTCCCCGGAAGCACATTCACATCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGa < 1:2333082/97‑1 (MQ=255) gagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGa < 1:309998/100‑1 (MQ=255) gagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGa > 2:1670033/1‑100 (MQ=255) agTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGAt > 1:1295239/1‑100 (MQ=255) ttGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCg < 1:2599342/100‑1 (MQ=255) ttGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCg < 1:1937786/100‑1 (MQ=255) ttGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCg < 2:2228952/100‑1 (MQ=255) ttGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCg < 2:1549851/100‑1 (MQ=255) tGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGt > 2:3282412/1‑100 (MQ=255) tGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGt < 2:1520079/100‑1 (MQ=255) tAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTaa < 1:1546631/100‑1 (MQ=255) tAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTaa > 1:3171437/1‑100 (MQ=255) aaTGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTaaa > 2:1141151/1‑100 (MQ=255) tGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGa > 1:2237886/1‑100 (MQ=255) gAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAt < 2:509085/100‑1 (MQ=255) aaGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAtt < 1:2986421/100‑1 (MQ=255) aaGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAtt < 2:3248140/100‑1 (MQ=255) gTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGa > 2:3325822/1‑100 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg < 1:148760/100‑1 (MQ=255) aCTTATTTTCCCTGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTATATCAATATTAACACATCATTAACAATCCGTTTTTATACAGATCGTACAGAtt < 1:1573772/95‑1 (MQ=255) aCTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGc > 1:1182951/1‑100 (MQ=255) tATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTc > 2:2536424/1‑100 (MQ=255) ttttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGc > 2:175023/1‑100 (MQ=255) tttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGcc < 2:1079651/100‑1 (MQ=255) ttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGcc < 2:3171464/99‑1 (MQ=255) tCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTg < 2:35613/100‑1 (MQ=255) tCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTg < 2:604466/100‑1 (MQ=255) cccGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCg > 2:1070402/1‑100 (MQ=255) cccGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCg < 2:2477227/100‑1 (MQ=255) cccGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCg > 2:269916/1‑100 (MQ=255) ggAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTgg < 2:1486934/100‑1 (MQ=255) gAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGc < 2:734147/100‑1 (MQ=255) gAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGc < 1:1541687/100‑1 (MQ=255) aaGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGcc < 1:3157034/100‑1 (MQ=255) aaGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGcc < 1:2213247/100‑1 (MQ=255) aaGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGcc < 2:488108/100‑1 (MQ=255) aGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGcc < 1:2357244/99‑1 (MQ=255) gCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctc < 2:1503642/100‑1 (MQ=255) cacaTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctct > 2:2810765/1‑100 (MQ=255) aTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATg < 2:241312/100‑1 (MQ=255) aTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATg < 2:3196112/100‑1 (MQ=255) ttcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATgg > 2:2758103/1‑100 (MQ=255) ttcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATgg > 1:2662803/1‑100 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 2:2049636/100‑1 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 1:3095425/100‑1 (MQ=255) acttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGctc > 1:3169667/1‑100 (MQ=255) acttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGctc > 2:1154705/1‑100 (MQ=255) cttcccAATTTGTTTACATCAATTTTAACCCATCATTAACAATCCGTCTCTATACAGTTCCTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGctct < 1:2023187/100‑1 (MQ=255) cttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGctct > 2:423108/1‑100 (MQ=255) ttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTg < 2:1676031/100‑1 (MQ=255) tcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGa > 1:2215213/1‑100 (MQ=255) caATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGAttt > 2:486639/1‑100 (MQ=255) caATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGAttt > 1:2999475/1‑100 (MQ=255) caATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGAt > 1:766689/1‑98 (MQ=255) aaTTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTa < 1:2810742/100‑1 (MQ=255) aTTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTaa > 1:3361052/1‑100 (MQ=255) tttGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAg < 2:1442013/100‑1 (MQ=255) tttGTCTACATCAATTTTAACATGTCGTGAACAATCCGTCTTTATACAGACGGTAATGATGGAGGCCTTGCCTGCGGTACCTCGGTGAGTCTGATTAAAg < 1:3206203/100‑1 (MQ=255) ttGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGt < 1:1030571/100‑1 (MQ=255) ttGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGt > 1:1580776/1‑100 (MQ=255) tGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTa < 2:220192/100‑1 (MQ=255) ttACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAata > 2:2497986/1‑100 (MQ=255) aTCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGCTCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTCATATCTg > 1:319577/1‑100 (MQ=255) aTCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTg > 2:3109216/1‑100 (MQ=255) aTCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTg > 2:2687430/1‑100 (MQ=255) cAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCg > 2:2688817/1‑100 (MQ=255) aaTTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCgg > 2:2497484/1‑100 (MQ=255) aaTTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCgg < 1:3282384/100‑1 (MQ=255) ttccgatctcatcatTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCggg < 2:2278779/91‑1 (MQ=255) acacATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGt > 1:1743795/1‑100 (MQ=255) cacaTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTc > 1:2993111/1‑100 (MQ=255) catcatTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCgggagatcggaa > 1:2278763/1‑91 (MQ=255) catcatTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCAc > 1:2543555/1‑100 (MQ=255) tcaACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCACGTTTg < 2:2413942/100‑1 (MQ=255) | GCAGTCGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCACGTTTG > NC_000913/2278201‑2278396 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |