| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,852,356 | T→A | 100% | L74Q (CTG→CAG) | hypD → | hydrogenase maturation protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,852,356 | 0 | T | A | 98.6% | 481.4 / ‑2.4 | 140 | L74Q (CTG→CAG) | hypD | hydrogenase maturation protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/2); new base A (80/58); total (80/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.82e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.13e-01 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
GGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACTGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGAAAC > NC_000913/2852259‑2852451 | ggCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGc > 1:1283097/1‑100 (MQ=255)ggCGGGCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCTGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGc < 2:3031501/100‑1 (MQ=255) cGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCg > 1:49848/1‑100 (MQ=255) cGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCg > 2:1834104/1‑100 (MQ=255) gTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGAt < 2:1531276/100‑1 (MQ=255) tCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATg < 1:1606557/100‑1 (MQ=255) aTACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATggg < 2:3108929/100‑1 (MQ=255) aTACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATggg < 2:334485/100‑1 (MQ=255) aTACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATggg < 2:390765/100‑1 (MQ=255) aTACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATggg < 2:1357354/100‑1 (MQ=255) aTACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATggg < 1:1275370/100‑1 (MQ=255) tACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGt > 1:2214627/1‑100 (MQ=255) aCCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTa < 1:2969249/100‑1 (MQ=255) cccACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACTGCCGATGGGTAg < 1:2358987/100‑1 (MQ=255) cccACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAg > 2:2632604/1‑100 (MQ=255) cccACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAg > 2:303794/1‑100 (MQ=255) cccACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAg > 1:88361/1‑100 (MQ=255) cccACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAg > 1:2151152/1‑100 (MQ=255) cACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGaa > 1:1042210/1‑100 (MQ=255) cACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGaa > 1:3107323/1‑100 (MQ=255) aCGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGa > 2:455797/1‑98 (MQ=255) tATCTTTAAATTCGGTCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACTGCCGATGGGTAGAATCGac < 2:3335117/100‑1 (MQ=255) cTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACAcc > 2:1391607/1‑100 (MQ=255) aaTTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCg > 1:3036754/1‑99 (MQ=255) aaTTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGt > 2:1279436/1‑100 (MQ=255) aTTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTg > 2:1088482/1‑100 (MQ=255) ttCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTgg > 1:2646801/1‑100 (MQ=255) ttCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTgg < 1:2303481/100‑1 (MQ=255) ttCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTgg < 2:560584/100‑1 (MQ=255) cGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGgag > 2:2784001/1‑100 (MQ=255) ggCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGgaga > 2:1048744/1‑100 (MQ=255) ggCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGgaga > 1:1105521/1‑100 (MQ=255) gCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGAt > 2:627429/1‑100 (MQ=255) ccTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGAtt > 1:275677/1‑100 (MQ=255) ccTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGAtt > 1:2931567/1‑100 (MQ=255) cTCGACCAGTTACGGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTg < 1:136205/100‑1 (MQ=255) tCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgc < 2:316551/100‑1 (MQ=255) cGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgcc > 1:1282898/1‑100 (MQ=255) taCCAGTCACTGCAGTAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGCTGTGCCCAGTGTGCGTACAGCCGCTGGGCAGAATCGACACCTGCGTGGAGTTTgac > 1:337424/2‑97 (MQ=255) gACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgcca < 2:683786/100‑1 (MQ=255) aCCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccag < 2:2127694/100‑1 (MQ=255) aCCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccag < 2:2646823/100‑1 (MQ=255) ccAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccagc < 2:2004701/100‑1 (MQ=255) ccAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccag < 2:47404/99‑1 (MQ=255) cAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccagc < 1:901774/99‑1 (MQ=255) aGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccagcca > 2:1502852/1‑100 (MQ=255) aGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccagcca > 1:576604/1‑100 (MQ=255) aGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTgccagcc > 2:2027718/1‑99 (MQ=255) gTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCAt > 1:2330257/1‑100 (MQ=255) cGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGt > 2:2753679/1‑100 (MQ=255) ggAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTc > 1:2245851/1‑100 (MQ=255) ggAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTc > 1:1182820/1‑100 (MQ=255) gAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCa < 2:1839440/100‑1 (MQ=255) gAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCa < 2:635844/100‑1 (MQ=255) aaaaCGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAt < 2:1886880/100‑1 (MQ=255) aaaCGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtc < 2:488966/100‑1 (MQ=255) aCGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtctt < 1:1088479/100‑1 (MQ=255) cGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtcttc < 1:3146571/100‑1 (MQ=255) cGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtcttc < 1:1751662/100‑1 (MQ=255) gTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTCGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtcttct > 1:793392/1‑100 (MQ=255) gTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAtcttct > 1:1684537/1‑100 (MQ=255) ttGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTg < 1:1353739/100‑1 (MQ=255) tGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGt < 1:1639233/100‑1 (MQ=255) aGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTAc > 2:3120488/1‑100 (MQ=255) aGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTAc > 2:2428626/1‑100 (MQ=255) aGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATAGACACCTGCCTGGAGCTTGCCAGCTATCCGGAAGTCATCTTCTGTAc > 1:2291036/1‑100 (MQ=255) gTTTATCCATGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTAcc > 2:2597843/1‑100 (MQ=255) gTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTAcc < 2:338587/100‑1 (MQ=255) gTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGCCATCTTCTGTAcc < 2:2303119/100‑1 (MQ=255) tttATCCACGGTCCGGGGTGACCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCt > 1:2072440/1‑100 (MQ=255) tATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCttt > 2:1035705/1‑100 (MQ=255) tATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCttt > 2:1182228/1‑100 (MQ=255) aTCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTg < 1:2526814/100‑1 (MQ=255) tCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTgg < 2:83917/100‑1 (MQ=255) tCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTgg > 1:1382289/1‑100 (MQ=255) tCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTgg < 2:3107350/100‑1 (MQ=255) ccACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGc < 2:1780724/100‑1 (MQ=255) ccACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGc < 2:2781884/100‑1 (MQ=255) ccACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGc > 1:2909016/1‑100 (MQ=255) cACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCg > 1:1375926/1‑100 (MQ=255) cACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCg > 1:2199195/1‑100 (MQ=255) aCGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGc < 1:2006912/98‑1 (MQ=255) cGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGAc > 2:582163/1‑100 (MQ=255) ggTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACg < 1:1592669/100‑1 (MQ=255) gcccgaggcacccGGTATGCGTACAGCCGATTGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCAGCTTGGGGACCGTTGGCGACGc > 1:1125141/11‑100 (MQ=255) tCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGcc < 2:2040261/100‑1 (MQ=255) tCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGcc < 2:862243/100‑1 (MQ=255) ccGGGGTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCa > 2:2052512/1‑100 (MQ=255) ggggTGCCCGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATg < 1:2022545/100‑1 (MQ=255) cccGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACNTTTGGCGACGCCATGCGCGTg > 1:2162698/1‑100 (MQ=255) ccGGTGTGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGc > 1:327711/1‑100 (MQ=255) gtgtGCGTAGAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCgg < 1:287074/100‑1 (MQ=255) gtgtGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGcc < 1:1412379/98‑1 (MQ=255) gtgtGCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCgg < 1:312257/100‑1 (MQ=255) tgtgCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCggg < 2:2157040/100‑1 (MQ=255) gtgCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCgggg < 2:1037058/100‑1 (MQ=255) gtgCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTCGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCgggg < 2:3228647/100‑1 (MQ=255) gCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGaa > 2:3309556/1‑100 (MQ=255) gCGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGaa > 1:704424/1‑100 (MQ=255) cGTACAGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGaaa > 1:3150650/1‑100 (MQ=255) | GGCGGTCATACCCACGCTATCTTTAAATTCGGCCTCGACCAGTTACTGCCGGAAAACGTTGAGTTTATCCACGGTCCGGGGTGCCCGGTGTGCGTACTGCCGATGGGTAGAATCGACACCTGCGTGGAGATTGCCAGCCATCCGGAAGTCATCTTCTGTACCTTTGGCGACGCCATGCGCGTGCCGGGGAAAC > NC_000913/2852259‑2852451 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |