Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,434,437 | T→A | 23.8% | W109R (TGG→AGG) | ytfH → | DUF24 family HxlR‑type putative transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,434,437 | 0 | T | A | 23.8% | 297.0 / 97.6 | 155 | W109R (TGG→AGG) | ytfH | DUF24 family HxlR‑type putative transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/62); new base A (20/17); total (75/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.94e-01 |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
CTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTT > NC_000913/4434338‑4434536 | cTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACAGGCGGACt > 1:3021680/1‑100 (MQ=255) ttAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTg < 2:1721803/100‑1 (MQ=255) aaCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAgg > 1:410954/1‑99 (MQ=255) gatctATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGAt < 2:3134297/96‑1 (MQ=255) aCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAt < 1:603917/100‑1 (MQ=255) aCCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAt > 2:1779002/1‑100 (MQ=255) ccGTATCGCGTATCCGGTGGTGCGGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAtt < 1:186489/100‑1 (MQ=255) ccGTAGCGTGTATCCGGTGGGGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGAt < 1:1002930/99‑1 (MQ=255) cGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTg < 2:236820/100‑1 (MQ=255) gTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGa < 2:37609/100‑1 (MQ=255) aTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGt > 2:549582/1‑100 (MQ=255) aTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGt < 1:3161481/100‑1 (MQ=255) aTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGt < 2:2441828/100‑1 (MQ=255) aTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGAtagatc > 1:3134270/1‑95 (MQ=255) aTCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGt < 2:2483489/100‑1 (MQ=255) ncgcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGtt > 2:3268169/2‑100 (MQ=255) cgcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTg < 1:1508028/100‑1 (MQ=255) cgcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTg < 2:3195045/100‑1 (MQ=255) gcgTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGa > 1:3331123/1‑100 (MQ=255) gTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAt > 2:2813803/1‑100 (MQ=255) tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAtt < 1:926607/100‑1 (MQ=255) tATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAAtt < 1:2249518/100‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATGGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTg < 2:1188608/100‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCGCACGCCGCGGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTg < 1:594532/100‑1 (MQ=255) ccGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGc < 1:48439/100‑1 (MQ=255) cGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGcc < 1:1936420/100‑1 (MQ=255) ggtgCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCTGAg > 2:1623221/1‑100 (MQ=255) ggtgCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCG‑AAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAgg > 1:2178613/1‑100 (MQ=255) gtgCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAgg < 1:3083425/100‑1 (MQ=255) ngccgccGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCTAGCAGGTTAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGgt > 1:155927/2‑100 (MQ=255) gccgccGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTAGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGgtg > 1:2042327/1‑100 (MQ=255) cgccgcATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGtt > 1:994596/1‑100 (MQ=255) aTGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGt < 1:224821/100‑1 (MQ=255) tgtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTg > 1:2008165/1‑100 (MQ=255) tgtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTg < 1:2508893/100‑1 (MQ=255) tgtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTg < 1:1162907/100‑1 (MQ=255) gtgGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCgg < 2:2359585/97‑1 (MQ=255) ggAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGTTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCgg < 2:886911/100‑1 (MQ=255) aaTATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGa < 2:2646921/100‑1 (MQ=255) aaTATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGa < 2:972110/100‑1 (MQ=255) atatAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGAt < 2:2143980/100‑1 (MQ=255) tataGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATg > 2:1879906/1‑100 (MQ=255) ataGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGa > 2:2022913/1‑100 (MQ=255) taGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGaa < 2:1060168/100‑1 (MQ=255) atccTCACGCCGCAGGGCGAGCAGGTGAGCGGAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAAc > 2:2280422/3‑100 (MQ=255) aGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAAc > 1:709753/1‑100 (MQ=255) gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg > 2:1578211/1‑100 (MQ=255) gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg > 2:1337374/1‑100 (MQ=255) gCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACg < 2:2650728/100‑1 (MQ=255) ccTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGAGTTGGCGGTGCGGGATGAACGt > 2:1418125/1‑100 (MQ=255) cTCACGCCGCTGGGCGCGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGt > 1:3124876/1‑99 (MQ=255) cTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTg < 2:560269/100‑1 (MQ=255) tCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGc < 1:1060092/100‑1 (MQ=255) aCGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCgg < 2:466291/100‑1 (MQ=255) cgccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACTTGCGGc < 1:75309/100‑1 (MQ=255) cgccgcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGc < 2:620498/100‑1 (MQ=255) gcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATaa > 2:1147132/1‑100 (MQ=255) gcTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATaa > 2:2614696/1‑100 (MQ=255) cTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAAc < 2:527525/100‑1 (MQ=255) ggCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGc > 2:1275499/1‑100 (MQ=255) cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGGGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg < 1:277308/100‑1 (MQ=255) cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg > 1:2915108/1‑100 (MQ=255) cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg < 1:277202/100‑1 (MQ=255) cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCg < 1:3291778/100‑1 (MQ=255) cGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGAATGGATTGAGTTGTATTTGCCCGAGGTGTTGGGGGTGCGGGCTGAACGTGCGGCATAACTGcc > 2:828894/1‑99 (MQ=255) aGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGa < 1:385674/100‑1 (MQ=255) aGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGACCGTGCGGAATAACTGCCGGa < 1:2197046/100‑1 (MQ=255) gCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGAt > 1:3244375/1‑100 (MQ=255) cAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATg > 1:441957/1‑100 (MQ=255) aGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgc < 2:2309430/100‑1 (MQ=255) ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 2:40716/1‑100 (MQ=255) ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 1:1389559/1‑100 (MQ=255) ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg > 1:2666674/1‑100 (MQ=255) ggTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCACGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcg < 1:1674177/100‑1 (MQ=255) gTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcgc < 1:2489826/100‑1 (MQ=255) gTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcgc > 1:427998/1‑100 (MQ=255) gTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATgcgc < 2:2075596/100‑1 (MQ=255) cGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGc < 2:1914828/100‑1 (MQ=255) cGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACGGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGc < 1:3160688/100‑1 (MQ=255) gAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCt < 2:387400/100‑1 (MQ=255) ggTTGCTGCACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCt < 2:205856/100‑1 (MQ=255) ttGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTACCTgg > 1:3349007/1‑100 (MQ=255) gctgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTc > 1:2769968/1‑100 (MQ=255) gctgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTc > 2:709881/1‑100 (MQ=255) ctgcACTGGCGGACTGGGTTGAGTTGAAGTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCt < 1:1875669/100‑1 (MQ=255) ctgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCt > 1:488864/1‑100 (MQ=255) ctgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCt > 2:617179/1‑100 (MQ=255) ctgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCt > 1:2472556/1‑100 (MQ=255) ctgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCt > 2:2199067/1‑100 (MQ=255) tgcACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTa > 2:854905/1‑100 (MQ=255) gcACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTAc > 2:837520/1‑100 (MQ=255) gcACTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTAc > 2:2248705/1‑100 (MQ=255) tcTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACgg < 2:1355793/99‑1 (MQ=255) aCTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACgg < 1:1114325/100‑1 (MQ=255) cTGGCGGACAGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGt > 1:77437/1‑100 (MQ=255) ggCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGc > 2:317603/1‑100 (MQ=255) ggCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGc > 2:163439/1‑100 (MQ=255) gCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCa < 2:2808452/100‑1 (MQ=255) aCTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGc < 1:1701428/100‑1 (MQ=255) aCTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGAGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATTTGGTCTACGGTGCATGGc > 2:3329953/1‑100 (MQ=255) | CTTAACCGTATCGCGTATCCGGTGGTGCCGCCGCATGTGGAATATAGCCTCACGCCGCTGGGCGAGCAGGTGAGCGAAAAGGTTGCTGCACTGGCGGACTGGATTGAGTTGAATTTGCCCGAGGTGTTGGCGGTGCGGGATGAACGTGCGGCATAACTGCCGGATGCGCTGAGCTTATCTGGTCTACGGTGCATGGCTT > NC_000913/4434338‑4434536 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |