| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,111,377 | A→G | 57.6% | D172G (GAT→GGT) | opgH → | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,111,377 | 0 | A | G | 57.6% | 75.5 / 129.6 | 120 | D172G (GAT→GGT) | opgH | OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (16/35); new base G (23/46); total (39/81) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ACATTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGG > NC_000913/1111278‑1111474 | aCATTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGa < 1:3313873/100‑1 (MQ=255) aTTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTGTATGAAGACCCTTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGata > 1:2373827/1‑100 (MQ=255) ttCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTTGTCGCGAGCTGGTATATGAAGCCCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGatat > 1:2354976/1‑100 (MQ=255) ttCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGgtat < 2:3110766/100‑1 (MQ=255) gTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATAtggtt < 1:3249808/100‑1 (MQ=255) gTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCACGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggtt < 1:2030258/100‑1 (MQ=255) ngATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttgg > 2:2089229/2‑100 (MQ=255) gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt < 2:2901272/100‑1 (MQ=255) gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATAtggttggt < 1:2960591/100‑1 (MQ=255) tCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCa > 2:2443357/1‑100 (MQ=255) tCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCa > 1:1674921/1‑100 (MQ=255) ccTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAg < 2:836219/100‑1 (MQ=255) ccTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAg < 1:2001096/100‑1 (MQ=255) cTGACGCTCGCGCAATCTGTCGTCGCGGCCAGGTATATGAAGACCATGCTTCGTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAg < 1:121681/99‑1 (MQ=255) cTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAgg < 2:2442336/100‑1 (MQ=255) cTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAg < 2:510814/99‑1 (MQ=255) tGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGa < 1:1177272/100‑1 (MQ=255) cGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGAttt > 2:2675576/1‑100 (MQ=255) gCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTtg < 2:2584593/100‑1 (MQ=255) cTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTtgt > 2:2748928/1‑100 (MQ=255) cgcgCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAAGCCTATGGGTATGGTTGGTAAGGATTTGTgg > 1:1849920/1‑100 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTgg > 1:665298/1‑99 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTggg < 1:661336/100‑1 (MQ=255) gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTAGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTggg < 2:2373844/100‑1 (MQ=255) gcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGGCCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTggg < 1:1977143/98‑1 (MQ=255) aaCTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTcc < 2:2512925/100‑1 (MQ=255) cTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCtt < 2:1221298/100‑1 (MQ=255) cTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCtt < 2:622198/100‑1 (MQ=255) cTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCtt > 2:517808/1‑100 (MQ=255) tGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGTGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCttt < 1:3377594/100‑1 (MQ=255) gtcgtcGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTa > 1:2299202/1‑100 (MQ=255) gtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGc < 1:2399063/100‑1 (MQ=255) gtcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGc > 2:563454/1‑100 (MQ=255) tcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCa < 2:2527223/100‑1 (MQ=255) tcgCGACCTGGTATATGAAGACCATTCCTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCa < 2:2457399/100‑1 (MQ=255) cgACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCt < 2:3121009/100‑1 (MQ=255) gACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCtt < 2:1673145/100‑1 (MQ=255) cTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTg < 2:1841616/100‑1 (MQ=255) cTGGGATATGAAGACCATTCTTCCTTATCGGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCt < 1:2655588/99‑1 (MQ=255) tGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGc > 1:1185682/1‑100 (MQ=255) tGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGc < 1:1019282/100‑1 (MQ=255) ggTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCGTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGTTTTTCTTTATGCAGCTTCTGcg < 1:730186/100‑2 (MQ=255) ggTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGcc < 2:552483/100‑1 (MQ=255) ggTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGcc < 1:1165355/100‑1 (MQ=255) gTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCt > 2:3057611/1‑100 (MQ=255) tataTGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCtt < 2:197475/100‑1 (MQ=255) tataTGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCtt > 2:2564602/1‑100 (MQ=255) tataTGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCtt < 2:980189/100‑1 (MQ=255) atatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTta < 2:482430/100‑1 (MQ=255) atatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTta > 2:2452666/1‑100 (MQ=255) tatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTtat < 2:754282/100‑1 (MQ=255) tatGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTta < 1:3099778/99‑1 (MQ=255) atGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTtata > 2:2003768/1‑100 (MQ=255) atGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTtata < 2:849929/100‑1 (MQ=255) tGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTatat < 1:1703581/100‑1 (MQ=255) tGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTatat > 1:1631165/1‑100 (MQ=255) tGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTatat > 2:100143/1‑100 (MQ=255) gAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtg > 2:334816/1‑100 (MQ=255) aaGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTGCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgc < 2:2819269/100‑1 (MQ=255) aGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgct < 2:341738/100‑1 (MQ=255) gACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctg < 2:1435712/100‑1 (MQ=255) aCCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGCCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctgc < 2:1213985/100‑1 (MQ=255) aCCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgctgc < 2:904118/100‑1 (MQ=255) ccATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCa > 1:3386417/1‑100 (MQ=255) ccATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCa > 2:1246232/1‑100 (MQ=255) cATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTGTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCaa < 2:3061548/100‑1 (MQ=255) gtgcttcCTTATGAGGGGGGGGCGACGATTAATTCTGTGCATGTGGTTGGGGAGGATTTGTGGGTTTCCTTTACGAAGCTTATGCCTCATAtgct > 1:1248122/4‑95 (MQ=255) tcttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAcc < 2:2163009/100‑1 (MQ=255) cttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCg > 2:133882/1‑100 (MQ=255) ttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg < 2:2326640/100‑1 (MQ=255) ttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg < 1:3178574/100‑1 (MQ=255) ttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgn < 2:2576931/100‑2 (MQ=255) cTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTAt < 2:2812571/100‑1 (MQ=255) gggTTGGGCGCTGATTAATCATATGAATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATc < 2:1339790/100‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATcc < 2:1677594/100‑1 (MQ=255) ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATc > 2:285614/1‑99 (MQ=255) ggCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTCGTTGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCttt > 1:1334924/1‑100 (MQ=255) cgcTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc < 1:1155537/100‑1 (MQ=255) cgcTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc < 1:1760653/100‑1 (MQ=255) cTGATTAATCCTCTGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCttt > 1:1586494/1‑96 (MQ=255) cTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCATTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCgg < 2:809112/100‑1 (MQ=255) tGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGt < 1:3087667/100‑1 (MQ=255) tGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGt < 2:3353013/100‑1 (MQ=255) tGATTAATCCTATGGGTATGGTTAGTCAGGATTTGTGGGTTTCATTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCg > 1:1620663/1‑98 (MQ=255) tGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCg < 1:635763/98‑1 (MQ=255) tGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGt < 1:2452647/100‑1 (MQ=255) tGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGt < 2:1880267/100‑1 (MQ=255) aTTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAc < 1:2238642/100‑1 (MQ=255) aTTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAc < 1:2730154/100‑1 (MQ=255) tAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTAGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCGGATCCTCTTTGCGGTActg < 1:1123870/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc < 1:1292376/100‑1 (MQ=255) tCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGTGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTTCGGTActgttc < 2:3235312/100‑1 (MQ=255) ccTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttct > 2:1137595/1‑100 (MQ=255) ccTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttct > 2:1053234/1‑100 (MQ=255) cTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGGAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctg < 1:1810109/100‑1 (MQ=255) cTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctg < 1:145102/100‑1 (MQ=255) aTGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctgtt > 1:2721419/1‑100 (MQ=255) tGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTg > 1:1350940/1‑100 (MQ=255) ggATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTgg < 1:109312/100‑1 (MQ=255) ggAAATGGTTGGGCAGGATTTTTGGGTTTCCTTTATTCAGCTTCTGCCTTATAGTCTGCAAACCTTTATCCGGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTgg > 1:1974059/1‑100 (MQ=255) | ACATTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGTTGG > NC_000913/1111278‑1111474 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |