| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,207,981 | G→A | 58.8% | A161T (GCC→ACC) | stfP → | e14 prophage; uncharacterized protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,207,981 | 0 | G | A | 58.8% | 34.6 / 102.8 | 90 | A161T (GCC→ACC) | stfP | e14 prophage; uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (19/18); new base A (22/31); total (41/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.11e-01 | |||||||||||
GAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTTTATTACG > NC_000913/1207882‑1208075 | gAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg < 2:550058/100‑1 (MQ=255) aGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGAAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGc > 2:2386421/1‑100 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATg < 1:2753689/98‑1 (MQ=255) gCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGcc > 2:2092683/1‑100 (MQ=255) gCAAGCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCCAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAAGACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGcc < 1:1994317/100‑1 (MQ=255) aaTCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCtg < 1:2521819/100‑1 (MQ=255) aaTCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCtg < 1:1542650/100‑1 (MQ=255) aTCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCtgt > 2:306666/1‑100 (MQ=255) tCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAAGGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCtgtg < 2:1628695/100‑1 (MQ=255) cAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATACCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGAGGGATGGAAATACAGATGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTgtgt > 1:645529/1‑100 (MQ=255) aGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGtt > 1:3292742/1‑100 (MQ=255) aGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGtt < 1:2217339/100‑1 (MQ=255) gTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTg > 2:665264/1‑100 (MQ=255) tAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGc > 2:786879/1‑100 (MQ=255) tAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGc < 2:2999590/100‑1 (MQ=255) tAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCAGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGc > 1:1804434/1‑100 (MQ=255) aTCATTCAGTGGGGGGGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGcc < 1:3024495/99‑1 (MQ=255) cATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGGTGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATACTACATGTGTTGCCgtt > 1:1977426/1‑100 (MQ=255) ccgatctggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttgt < 1:775657/93‑1 (MQ=255) tCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCgttgtt > 1:2602015/1‑100 (MQ=255) cagtggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGc > 1:283192/5‑100 (MQ=255) aGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCATGTGTTGCCGTTGTTGc > 2:2612854/1‑100 (MQ=255) aGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGc > 1:2437141/1‑100 (MQ=255) gggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCaaa > 1:2610085/1‑100 (MQ=255) gggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCaa > 1:1952220/1‑99 (MQ=255) gggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGGGTTGCCGTTGTTGCaaa > 2:1451809/1‑100 (MQ=255) ggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCgttgtagatcgg > 2:775660/1‑93 (MQ=255) ggggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAAt < 1:542439/100‑1 (MQ=255) gggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAAtt < 2:1712800/100‑1 (MQ=255) ggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTa < 1:2478013/100‑1 (MQ=255) ggTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTa > 2:35202/1‑100 (MQ=255) tGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATg < 1:3057255/100‑1 (MQ=255) tGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATg < 2:2038324/100‑1 (MQ=255) ggAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGa < 1:2806394/100‑1 (MQ=255) gAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGAc < 2:2743842/100‑1 (MQ=255) aTGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACaa < 2:983568/100‑1 (MQ=255) gCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATg > 2:331619/1‑100 (MQ=255) ccGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGt > 1:2352553/1‑100 (MQ=255) cGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTc < 1:549504/100‑1 (MQ=255) gCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTc < 2:1231985/99‑1 (MQ=255) aaaaGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgc < 1:569834/100‑1 (MQ=255) aaaaGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgc > 2:2787231/1‑100 (MQ=255) aaggCATCTGCGTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgcg < 1:2623/97‑1 (MQ=255) aaGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAgcgc < 2:2032038/100‑1 (MQ=255) aGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCa < 1:1925080/100‑1 (MQ=255) gCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCAc < 2:775060/100‑1 (MQ=255) cATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCAcc < 2:2602035/100‑1 (MQ=255) cATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCAcc < 1:2787208/100‑1 (MQ=255) cATCTGCCTCGGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCAcc < 1:2010630/100‑1 (MQ=255) tCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTa < 1:288017/100‑1 (MQ=255) tCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTATAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTa > 1:1876848/1‑100 (MQ=255) cTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTAt > 2:2197327/1‑100 (MQ=255) tGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATc > 1:1691777/1‑100 (MQ=255) tGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTAtn < 1:1685060/100‑2 (MQ=255) tctGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGGGTGGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATg > 2:631109/1‑100 (MQ=255) tctGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATg < 2:3197061/100‑1 (MQ=255) tGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGc < 1:2406270/99‑1 (MQ=255) gggggATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTTATAATACATGTGATGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTAAGCGCACCTATGAATGCAGTg > 1:3206310/1‑100 (MQ=255) gggggATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTg > 1:998399/1‑100 (MQ=255) gggggATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTg > 2:1809309/1‑100 (MQ=255) ggggATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTgg < 1:974439/100‑1 (MQ=255) gggATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGc < 1:3038801/100‑1 (MQ=255) ggATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGc < 1:620354/99‑1 (MQ=255) tGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACg > 2:3055547/1‑100 (MQ=255) tGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCaagg > 1:2534021/1‑98 (MQ=255) ggAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACgg > 2:992149/1‑100 (MQ=255) aaTACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACggggg < 2:2617313/100‑1 (MQ=255) tACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGa < 2:2931624/100‑1 (MQ=255) tACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGa < 2:2417351/100‑1 (MQ=255) tACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGa < 1:1038957/100‑1 (MQ=255) cAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGata > 2:2500230/1‑100 (MQ=255) gTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGAtata < 2:2072638/100‑1 (MQ=255) gTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGAtata > 1:3042467/1‑100 (MQ=255) tGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACa < 2:1052603/100‑1 (MQ=255) tATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAAc < 1:819772/100‑1 (MQ=255) aTTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAAcc > 2:1004312/1‑100 (MQ=255) tCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAAAGGGGGGATATACAACCAc > 2:1668727/1‑100 (MQ=255) cccGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACt < 1:2606536/100‑1 (MQ=255) ttGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGtt < 2:2847113/100‑1 (MQ=255) cGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGttttt > 1:511919/1‑100 (MQ=255) cGTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGttttt < 1:737124/100‑1 (MQ=255) ntttAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTtta > 1:95965/2‑100 (MQ=255) gTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGtttt > 1:1841141/1‑98 (MQ=255) gTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTtta < 2:60421/100‑1 (MQ=255) gTTTAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTtta < 1:3111814/100‑1 (MQ=255) tttAATAATAGCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAACGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGTGGGCTATACGACCACTTCGtttttt < 1:790000/99‑2 (MQ=255) tttAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTttat > 2:486025/1‑100 (MQ=255) tttAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTttat < 1:2930162/100‑1 (MQ=255) ttAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTttatt > 1:1586917/1‑100 (MQ=255) ttAATAATACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTttatn < 1:1400629/100‑2 (MQ=255) taataaTGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTttatta > 2:2950712/1‑100 (MQ=255) aataatACCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTTTATTAc < 1:310497/100‑1 (MQ=255) ataataCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTTTATTACg > 1:728091/1‑100 (MQ=255) | GAGCAATCAGTAATCATTCAGTGGGGGTGGAATGCCGCAAAAGCATCTGCCTCTGGGGGGGATGGAAATACAGTTGTATTCCCGGTTGCGTTTAATAATGCCTGTGTTGCCGTTGTTGCAAATTATGACAATGTCAGCGCACCTATCAATGCAGTGGCAACGGGGGGATATACAACCACTTCGTTTTTATTACG > NC_000913/1207882‑1208075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |