| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 933,387 | C→T | A55V (GCC→GTC) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 933,387 | 0 | C | T | 98.0% | 171.8 / ‑4.1 | 51 | A55V (GCC→GTC) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (22/28); total (22/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.25e-01 | |||||||||||
TGGAGGCGTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGCCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGATGGCTTACAC > NC_000913/933291‑933477 | tGGAGGCGTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTg < 1:867022/100‑1 (MQ=255) gAGGCGTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGc < 2:736521/100‑1 (MQ=255) aGGCGTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCa < 1:598045/100‑1 (MQ=255) aGGCGTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCa < 2:1509673/100‑1 (MQ=255) aGGCGTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCa < 1:318658/100‑1 (MQ=255) gTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGaa > 2:220171/1‑100 (MQ=255) gTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGCCTGGCATGaa < 1:470008/100‑1 (MQ=255) gATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATc > 2:1552005/1‑100 (MQ=255) cTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATa > 2:628113/1‑100 (MQ=255) tGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTa < 2:1493657/100‑1 (MQ=255) tGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTa > 2:1173197/1‑100 (MQ=255) gTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAg < 1:1445364/100‑1 (MQ=255) gTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAg < 2:431708/100‑1 (MQ=255) gTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTggg > 1:1534703/1‑100 (MQ=255) gTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTggg < 1:901316/100‑1 (MQ=255) gTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTggg > 2:791001/1‑100 (MQ=255) gCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGc > 1:1565525/1‑100 (MQ=255) gTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCg > 1:1394174/1‑100 (MQ=255) gTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCg < 1:1262063/100‑1 (MQ=255) tGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTg > 1:56493/1‑100 (MQ=255) gTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCg < 1:1006586/100‑1 (MQ=255) tGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTg > 2:1228902/1‑100 (MQ=255) gATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTgg > 1:739957/1‑100 (MQ=255) cTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGTGTGGTTGGc < 1:1332344/100‑1 (MQ=255) ccTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGa < 1:372317/100‑1 (MQ=255) cTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGAt > 2:428469/1‑100 (MQ=255) ttACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATa > 2:1026514/1‑100 (MQ=255) cTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGc < 1:1450735/100‑1 (MQ=255) aaGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTg < 1:630486/100‑1 (MQ=255) aaGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTg > 1:13020/1‑100 (MQ=255) aaGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTg > 2:121326/1‑100 (MQ=255) aGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGt < 1:473839/100‑1 (MQ=255) aGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGt > 1:1003032/1‑100 (MQ=255) cTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTc > 2:1326776/1‑100 (MQ=255) tttAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTCGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCGGATACGCTGTTCt > 2:1251204/1‑100 (MQ=255) ctaCCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCttt < 1:1175727/98‑1 (MQ=255) aCCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTag > 2:1175722/1‑99 (MQ=255) aCCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTAt > 1:832227/1‑100 (MQ=255) tCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTg < 1:551140/100‑1 (MQ=255) tCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTg < 1:1173202/100‑1 (MQ=255) cGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTgg < 1:361294/100‑1 (MQ=255) cGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTgg < 1:1355916/100‑1 (MQ=255) ggACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGc < 2:13020/100‑1 (MQ=255) gACCCCAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCg < 2:407406/100‑1 (MQ=255) cccAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGa > 1:1174303/1‑100 (MQ=255) ccAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGAt < 1:283397/100‑1 (MQ=255) cAGCTGGTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGATg < 1:758276/100‑1 (MQ=255) gTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGATGGCTTac < 2:441409/100‑1 (MQ=255) gTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGATGGCTTac < 2:1565515/100‑1 (MQ=255) gTCGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGATGGCTTac < 1:791006/100‑1 (MQ=255) cGCAAACGGTCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGATGGCTTacac > 2:823475/1‑100 (MQ=255) | TGGAGGCGTTGCTGATCCTTATTGTCCTGTTTGCCGTCTGGTTGATGGCTGCCTTACTAAGCTTTAACCCTTCGGACCCCAGCTGGTCGCAAACGGCCTGGCATGAACCTATCCATAATTTAGGTGGGATGCCCGGTGCGTGGTTGGCAGATACGCTGTTCTTTATTTTTGGCGTGATGGCTTACAC > NC_000913/933291‑933477 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |