Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	1,111,377	A→G	D172G (GAT→GGT)	opgH →	OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	1,111,377	0	A	G	100.0%	223.9 / NA	62	D172G (GAT→GGT)	opgH	OPG biosynthetic ACP‑dependent transmembrane UDP‑glucose beta‑1,2 glycosyltransferase; nutrient‑dependent cell size regulator, FtsZ assembly antagonist
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base A (0/0);  new base G (33/29);  total (33/29)

TTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGT  >  NC_000913/1111281‑1111471                                                                                                 |                                                                                               ttCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGgtat                                                                                             >  2:1519338/1‑100 (MQ=255) ttCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGgtat                                                                                             >  1:1094893/1‑100 (MQ=255)      ttGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttg                                                                                        >  2:1074138/1‑100 (MQ=255)       tGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttgg                                                                                       >  1:1027852/1‑100 (MQ=255)        gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt                                                                                      >  2:1051781/1‑100 (MQ=255)        gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt                                                                                      <  2:661161/100‑1 (MQ=255)        gATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTAtggttggt                                                                                      >  2:1051799/1‑100 (MQ=255)           ccTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAg                                                                                   >  2:1291909/1‑100 (MQ=255)            cTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAgg                                                                                  <  1:1540451/100‑1 (MQ=255)              gACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGAt                                                                                >  2:239839/1‑100 (MQ=255)                  cTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtgt                                                                            >  1:1435883/1‑100 (MQ=255)                   tCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtgtg                                                                           <  2:573457/100‑1 (MQ=255)                   tCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTtgtg                                                                           <  2:1557577/100‑1 (MQ=255)                    cgcgCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTgg                                                                          >  2:223356/1‑100 (MQ=255)                     gcgcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTggg                                                                         <  1:209448/100‑1 (MQ=255)                       gcAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGtt                                                                       <  1:1121551/100‑1 (MQ=255)                         aaaCTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTc                                                                     <  1:562938/100‑1 (MQ=255)                         aaaCTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGCATTTGTGGGTTTc                                                                     <  1:1073859/100‑1 (MQ=255)                            cTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCtt                                                                  <  2:1094888/100‑1 (MQ=255)                             tGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCttt                                                                 >  2:334022/1‑100 (MQ=255)                                   cgcgACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAg                                                           >  1:497885/1‑100 (MQ=255)                                   cgcgACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAg                                                           >  2:578448/1‑100 (MQ=255)                                        ccTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGttt                                                        >  2:596885/1‑98 (MQ=255)                                         cTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTg                                                     >  1:1025295/1‑100 (MQ=255)                                         cTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTg                                                     <  1:12909/100‑1 (MQ=255)                                          tGGTATATGAAGACCCTTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGc                                                    <  1:1557136/100‑1 (MQ=255)                                            gTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCt                                                  >  2:1217476/1‑100 (MQ=255)                                             tataTGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCtt                                                 <  2:417612/100‑1 (MQ=255)                                              atatGGAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTta                                                >  2:1130676/1‑100 (MQ=255)                                                  gAAGATAATTCTTTCTTATTAGGGTTGGGAGCTGATTAATTATATGGGTCTGGTTGGCCAGGATTTGTGGGTTTACTTTATGCAGCTTCTGATTTATAtg                                            >  2:1107660/1‑100 (MQ=255)                                                  gAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtg                                            >  2:531948/1‑100 (MQ=255)                                                  gAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtg                                            >  2:531806/1‑100 (MQ=255)                                                  gAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtg                                            >  2:33279/1‑100 (MQ=255)                                                   aaGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCGATGGGTATGGTTGGTCAGGCTTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATAtgc                                           >  2:860805/1‑100 (MQ=255)                                                        cATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCaa                                      >  1:655182/1‑100 (MQ=255)                                                           tcttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAAcc                                   <  2:99522/100‑1 (MQ=255)                                                             ttcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCATGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCgg                                 <  2:1538263/100‑1 (MQ=255)                                                              tcCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATTCTATGGGGATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGCTTCCTTTATGCCGCTTCTGCATTATATGCTGCAAGCCGGt                                >  1:1351241/1‑100 (MQ=255)                                                                 ttATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATc                             >  1:750757/1‑100 (MQ=255)                                                                  tATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATcc                            <  2:497884/100‑1 (MQ=255)                                                                    tCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTg                          >  1:279502/1‑100 (MQ=255)                                                                    tCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTg                          >  2:1140934/1‑100 (MQ=255)                                                                    tCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATAGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTg                          >  2:1029950/1‑100 (MQ=255)                                                                     cAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTg                          <  1:355718/99‑1 (MQ=255)                                                                     cAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTATCATTTATACAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCt                           >  2:319705/1‑98 (MQ=255)                                                                      aGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGAt                        <  1:1149695/100‑1 (MQ=255)                                                                        ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATcc                      <  2:1481698/100‑1 (MQ=255)                                                                        ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATcc                      <  1:1071215/100‑1 (MQ=255)                                                                        ggTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATcc                      <  2:1494970/100‑1 (MQ=255)                                                                         gTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCct                     >  1:1312213/1‑100 (MQ=255)                                                                            gggCGCTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCtt                  <  1:549502/100‑1 (MQ=255)                                                                               cgcTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc               <  1:1291915/100‑1 (MQ=255)                                                                               cgcTGATTAACCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTTTACGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGc               <  2:1038026/100‑1 (MQ=255)                                                                                 cTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCgg             <  1:1051805/100‑1 (MQ=255)                                                                                 cTGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCgg             <  1:1051787/100‑1 (MQ=255)                                                                                  tGATTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGt            >  2:1266253/1‑100 (MQ=255)                                                                                    aTTAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAc          <  1:1130681/100‑1 (MQ=255)                                                                                     ttAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTAct         <  1:92832/100‑1 (MQ=255)                                                                                      tAATCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActg        >  2:1150975/1‑100 (MQ=255)                                                                                        aTCCTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgtt      >  1:1452908/1‑100 (MQ=255)                                                                                         tCCTATGGGTATGGTTGGTAAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttc     <  1:596887/100‑1 (MQ=255)                                                                                           cTATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctg   <  2:681924/100‑1 (MQ=255)                                                                                            tATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgttctgt  >  2:882001/1‑100 (MQ=255)                                                                                            tATGGGTATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTActgtt      >  2:137633/1‑96 (MQ=255)                                                                                                 |                                                                                               TTCTGTTGATCCTGACGCTCGCGCAAACTGTCGTCGCGACCTGGTATATGAAGACCATTCTTCCTTATCAGGGTTGGGCGCTGATTAATCCTATGGATATGGTTGGTCAGGATTTGTGGGTTTCCTTTATGCAGCTTCTGCCTTATATGCTGCAAACCGGTATCCTGATCCTCTTTGCGGTACTGTTCTGT  >  NC_000913/1111281‑1111471

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑