| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,993,111 | (A)5→4 | 100% | coding (1018/1377 nt) | ygeH → | putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,993,107 | 0 | A | . | 75.5% | 428.7 / 219.2 | 200 | coding (1014/1377 nt) | ygeH | putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (19/30); new base . (70/81); total (89/111) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
TATGTCTTTGGCACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAACTGATATA > NC_000913/2993008‑2993206 | tGTCTTTGGCACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGaaa > 2:471213/1‑100 (MQ=255) tGTCTTTGGCACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGaaa < 1:4057666/100‑1 (MQ=255) tCTTTGGCACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGaaaat > 1:1970285/1‑99 (MQ=255) cgatctaCTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAttt < 1:1069431/94‑1 (MQ=255) tGGCACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAtttta < 1:2214640/100‑2 (MQ=255) tGGCACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAtttta < 2:1211584/100‑2 (MQ=255) tGGCACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAtttta < 1:994897/100‑2 (MQ=255) ggCACTTCATGGAAAAAGTGACCTTGCACTTGCTGCTCCAAACGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAg < 1:1230604/100‑1 (MQ=255) cACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAg < 2:2702560/98‑1 (MQ=255) aCTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGaaaatttagatcg > 2:1069427/1‑91 (MQ=255) cTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCtat > 1:2137848/1‑100 (MQ=255) cATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCtattat > 1:3558735/1‑100 (MQ=255) aTGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGCCATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATg > 1:668656/1‑100 (MQ=255) aTGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATg < 1:1792761/100‑1 (MQ=255) ggAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATggg < 1:156799/100‑1 (MQ=255) gAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGa > 2:280667/1‑100 (MQ=255) aaaaaGTGAACTTGAAATAGCAGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGAc < 2:3567163/100‑1 (MQ=255) aaaaGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACt < 1:3559692/100‑1 (MQ=255) aaaaGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACt < 1:2408084/100‑1 (MQ=255) aaaGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTg < 1:4014340/100‑1 (MQ=255) aaGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGa < 2:3883071/100‑1 (MQ=255) aGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGAt < 2:1323250/100‑1 (MQ=255) gTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑CAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATa < 2:3768789/100‑1 (MQ=255) gTGAACTTGAACTGGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGATTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATa < 2:253250/100‑1 (MQ=255) gaacttgaacttGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAAc < 2:458277/100‑1 (MQ=255) gaacttgaacttGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAAc < 2:3848510/100‑1 (MQ=255) cttgaacttgCTGCTCAAAAAGGATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTgg > 2:2422136/1‑100 (MQ=255) cttgaacttgCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTgg < 1:226159/100‑1 (MQ=255) cttgaacttgCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTgg < 2:2212746/100‑1 (MQ=255) cttgaacttgCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTgg < 2:2798328/100‑1 (MQ=255) tgaacttgCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGgt > 2:1853530/1‑100 (MQ=255) tgaacttgCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGgtc < 1:3010520/100‑1 (MQ=255) acttgCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGgtctgt < 2:3160667/100‑1 (MQ=255) ttgCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGgtctgtct < 2:1592883/100‑1 (MQ=255) ttgCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGgtctgtct < 1:1123670/100‑1 (MQ=255) tgctgcTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGgtctgtct > 2:3868878/1‑100 (MQ=255) tgctgcTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGtctgtctg > 2:3384235/1‑100 (MQ=255) gctgctCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑TAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGtctgtctg > 2:1993468/1‑99 (MQ=255) gctgctCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTgg < 2:2283052/100‑1 (MQ=255) gctgctCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTgg < 1:137412/100‑1 (MQ=255) gctCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACa > 1:924489/1‑100 (MQ=255) gctCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACa > 1:577753/1‑100 (MQ=255) gctCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACa > 2:2466206/1‑100 (MQ=255) ctCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACaa > 2:677973/1‑100 (MQ=255) cAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCTGTTTTAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGc < 1:150264/100‑1 (MQ=255) cAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGc < 1:1047238/100‑1 (MQ=255) cAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGc > 2:577528/1‑100 (MQ=255) cAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGc > 2:2489547/1‑100 (MQ=255) aaaaaGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCa > 1:3511530/1‑100 (MQ=255) aaaGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCaa < 2:1761597/100‑1 (MQ=255) aGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCaaaa > 1:2379655/1‑100 (MQ=255) gCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAg < 1:3221205/100‑1 (MQ=255) cATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTa < 2:3180926/100‑1 (MQ=255) aTTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTa < 1:1722823/100‑1 (MQ=255) ttAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTAtc > 1:2806050/1‑100 (MQ=255) ttAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTAtc < 1:3415855/100‑1 (MQ=255) tAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTAtct > 1:1669118/1‑100 (MQ=255) gagCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCa < 2:4103777/100‑1 (MQ=255) cTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCata > 2:2688968/1‑100 (MQ=255) ttttAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCatat < 2:2305643/100‑1 (MQ=255) tAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCtt > 1:3918999/1‑99 (MQ=255) tAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTa < 1:756850/100‑1 (MQ=255) tAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTa > 1:3442281/1‑100 (MQ=255) tAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTa > 1:3539851/1‑100 (MQ=255) aGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTAt > 2:2970298/1‑100 (MQ=255) gATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTAt > 1:3106967/1‑100 (MQ=255) aTTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTAtt > 1:1202662/1‑100 (MQ=255) aTTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTAttt < 2:14738/100‑1 (MQ=255) ttATGTATCAGACATAACCACTGTCGATTGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTAttt < 2:844629/100‑1 (MQ=255) ttATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTg < 2:3539824/100‑1 (MQ=255) tATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTg < 2:552947/100‑1 (MQ=255) tGTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAAc < 2:1837373/100‑1 (MQ=255) gTATCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACa > 1:3034326/1‑100 (MQ=255) aTCAGACATAACCACTGTCGATGG‑ACAATTTTAGCTATTATGGGACAGATAACTGGTAAGTCTGGACACGCAAGAGGACCTAATAGCTTATTTGAAc > 2:3592676/1‑97 (MQ=255) aTCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAgg > 2:3337951/1‑100 (MQ=255) tCAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGc < 2:2578465/100‑1 (MQ=255) cAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGc < 1:255870/100‑1 (MQ=255) cAGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCt < 1:2857629/100‑1 (MQ=255) aGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTa < 1:2520671/100‑1 (MQ=255) aGACATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCATATTTGAACAGGCTa > 1:4113907/1‑100 (MQ=255) gACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTa > 2:755800/1‑100 (MQ=255) aCATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAg < 2:2719359/100‑1 (MQ=255) aCATAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAg < 1:3695751/100‑1 (MQ=255) aTAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGAt < 1:1082214/100‑1 (MQ=255) tAACCACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATa > 2:508427/1‑100 (MQ=255) ccACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATacac > 1:2496993/1‑100 (MQ=255) ccACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATacac < 1:1687658/100‑1 (MQ=255) ccACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATacac > 1:435046/1‑100 (MQ=255) ccACTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATacac < 1:1021515/100‑1 (MQ=255) aCTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACt < 2:295054/100‑1 (MQ=255) cTGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCa < 1:2692165/100‑1 (MQ=255) tGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCa > 2:3229581/1‑100 (MQ=255) tGTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCaa > 1:825950/1‑100 (MQ=255) gTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAAc < 1:1963416/100‑1 (MQ=255) gTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAAc > 1:1265608/1‑100 (MQ=255) gTCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAAc > 1:4036648/1‑100 (MQ=255) tCGATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAACt > 1:4077611/1‑100 (MQ=255) cGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAACt < 1:3168013/100‑1 (MQ=255) gATGG‑AAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAACTGa < 2:1695506/100‑1 (MQ=255) ggAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAACTGata < 1:2475835/100‑1 (MQ=255) | TATGTCTTTGGCACTTCATGGAAAAAGTGAACTTGAACTTGCTGCTCAAAAAGCATTAGAGCTTTTAGATTATGTATCAGACATAACCACTGTCGATGGAAAAATTTTAGCTATTATGGGACTGATAACTGGTCTGTCTGGACAAGCAAAAGTATCTCATATCTTATTTGAACAGGCTAAGATACACTCAACTGATATA > NC_000913/2993008‑2993206 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |