| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3943654 | NA (NA) | 7 (0.050) | 5/164 | NT | 19.7% | intergenic (+144/‑50) | gltU/rrlC | tRNA‑Glu/23S ribosomal RNA of rrnC operon |
| ? | NC_000913 | = 4037431 | 31 (0.210) | intergenic (+96/‑88) | alaT/rrlA | tRNA‑Ala/23S ribosomal RNA of rrnA operon | |||||
CTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAaattttc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3943556‑3943654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCT < NC_000913/4037431‑4037326 CTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAA > 1:1062470/1‑100CTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAA < 1:3964585/100‑1CTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAA < 1:2131281/100‑1 TCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAA > 2:2607656/1‑100 CATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAAT > 2:2956323/1‑100 CATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAAT > 1:342378/1‑100 CATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAAT > 2:3832544/1‑100 CATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAAT > 1:2324306/1‑100 ATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAATACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATT > 1:1405905/1‑100 ATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATT > 2:1985220/1‑100 ATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATT > 1:437918/1‑100 ATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATT > 2:867803/1‑100 TCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTT > 1:2838745/1‑100 TCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTT > 1:2851742/1‑100 TCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTT > 1:1292007/1‑100 TCTGCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCTAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATT < 2:2894518/99‑1 CTTCGGGTGATGTTTGCGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACAATGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTT < 2:2428747/100‑1 CTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTT > 1:1133836/1‑100 CTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTT > 1:1561248/1‑100 CTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTT < 1:1369628/100‑1 TTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTC < 2:4112433/100‑1 TTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTC > 2:2057930/1‑100 TTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTC > 1:4138457/1‑100 TCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTC < 2:3965186/99‑1 TGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTC‑‑‑AGTGTTTC‑AATTTTCAGCTTGATCCAGATTTT > 1:2145541/1‑100 AAAATCTGGGTCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACT > 1:1164945/1‑100 GGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAATGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAG > 1:2653537/1‑99 ATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAATGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGA > 1:541397/1‑100 AGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCT > 2:789896/1‑100 GAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGC > 1:353396/1‑100 GAACAACGAAAGTTGTTC‑‑‑AGTGTTTC‑AATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATT > 1:1558707/1‑100 acaatgaTCAGCTTGATGCAGTTTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACTGTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTTCAG > 2:3818981/8‑95 AATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGT > 1:24902/1‑100 AATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGT < 2:2639909/100‑1 AATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGT > 2:476620/1‑100 ATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTG > 1:633178/1‑100 ATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTG < 1:3370694/100‑1 TTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGTAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGG < 2:911349/100‑1 TTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGG < 2:121743/100‑1 TTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGG < 1:895243/100‑1 TTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGG < 1:1049222/100‑1 TTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGG < 1:566003/100‑1 TTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGG < 2:2675204/100‑1 TTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGCTGGTGGA > 1:685134/1‑100 TTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGA < 1:1972284/100‑1 TTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGA < 2:2706820/100‑1 TTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAG < 2:2725554/100‑1 TTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAG < 1:1917191/100‑1 TTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAG < 1:821728/100‑1 TTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAG < 2:1117728/100‑1 TTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGG > 2:2519681/1‑98 TCATCTTTAGCCAGAGTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC < 1:2852447/100‑1 TCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC < 1:1173697/100‑1 TCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC < 2:3125555/100‑1 TCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC > 2:3514857/1‑100 TCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC > 2:3751276/1‑100 TCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC < 2:858983/100‑1 TCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC < 1:1813734/100‑1 TCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC < 2:197762/100‑1 TCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTAGTTAATCACTACAGGGATGGTGGAGC < 2:112945/100‑1 TCAGCTTGAGCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGA < 1:3997049/98‑1 CAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCT < 2:388317/100‑1 CAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCT > 1:3396482/1‑100 CAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGC < 1:3800423/99‑1 CTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAaattttc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3943556‑3943654‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTTTCAGCTTGATCCAGATTTTTAAAGAGCAAAACTTCGCAGTGAACCTTTGCAGGTACACTCTGAAGTATTTTTTATTTAATCACTACAGAGATGGTGGAGCT < NC_000913/4037431‑4037326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |