| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2304590 | 98 (0.650) | 23 (0.170) | 9/164 | NT | 20.3% | noncoding (174/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 2304721 | NA (NA) | noncoding (305/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
GTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAA > NC_000913/2304491‑2304689 | gTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAT < 1:3525073‑M1/100‑1 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGAT < 2:1922093‑M1/99‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGc > 1:14036/1‑100 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCAGCACAACGTCGGCGAGAAAGGGCGGTCAGGCCTCATCCGACATCCAACGCCGGAGCCGGTTGCCTAATGc > 2:3153232/1‑100 (MQ=14) ttATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCg < 2:2987011/100‑1 (MQ=255) tgaacAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCg < 2:774555/96‑1 (MQ=255) tATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGa > 1:3982462/1‑100 (MQ=255) tATCAGCCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCg < 2:3046230/99‑1 (MQ=255) aTCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGAc > 2:1591077/1‑100 (MQ=255) tccgaccTACACCGCTGTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGAc < 2:2061115/94‑1 (MQ=11) cAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGc > 2:3366948/1‑100 (MQ=255) ggCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTg < 1:1498216/100‑1 (MQ=255) ccTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgc > 1:2765286/1‑100 (MQ=255) cTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcg > 1:1219508/1‑100 (MQ=40) cTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACCCt > 2:3954966/1‑96 (MQ=255) gacacCGCTGTGAAGTGGGGCACCCCGTAGGTGCGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcg < 2:1504418/98‑1 (MQ=255) acacCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGcgcg < 1:2380055/100‑1 (MQ=38) acacCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGcgcg < 1:557903/100‑1 (MQ=38) acacCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACACCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGcgcg > 1:2061125/1‑100 (MQ=255) cacCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGt > 1:3906911/1‑100 (MQ=38) acCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTc < 2:3660900/100‑1 (MQ=35) ccGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGGTGCGACGCTGGCTCGt > 2:2127458/1‑98 (MQ=255) ccGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCGGGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCt > 2:2675424/1‑100 (MQ=255) ccGCTGGGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCt < 2:2462143/100‑1 (MQ=18) cGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTc < 2:578806/98‑1 (MQ=18) gCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa > 1:1020186/1‑100 (MQ=32) gCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACAGCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgca < 1:3421593‑M1/100‑20 (MQ=255) gtgAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCT‑‑acgcgccagcgtcgcatcaggca < 1:898488‑M1/99‑24 (MQ=255) gTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaa < 1:2078422‑M1/100‑28 (MQ=255) tGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaac < 1:2803036‑M1/100‑29 (MQ=255) tGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaac < 1:3937411‑M1/100‑29 (MQ=255) gcgcCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaacc < 1:2861489‑M1/100‑30 (MQ=255) gCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaacc < 1:1837019‑M1/100‑30 (MQ=255) gCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaacc < 1:597966‑M1/100‑30 (MQ=255) ggCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccgg < 1:3842245‑M1/100‑32 (MQ=255) ggCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccgg < 1:1703840‑M1/100‑32 (MQ=255) cAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt < 1:4103107/100‑1 (MQ=11) gACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTc > 1:654401/1‑99 (MQ=31) cAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCa < 2:252804/99‑1 (MQ=33) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTcc > 2:3993049/1‑96 (MQ=32) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:3002546/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:235114/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:190213/100‑1 (MQ=38) aGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 1:1076076/100‑1 (MQ=38) ggCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc < 2:894438/100‑1 (MQ=38) cGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 1:4076998/1‑100 (MQ=38) cGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt < 1:3039646/100‑1 (MQ=38) cGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGt > 2:1148418/1‑100 (MQ=35) ggttgcgccgcAGCTGTCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 1:449273/95‑1 (MQ=11) ggTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 2:3610162/100‑1 (MQ=38) gttaCGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 1:1148423/96‑1 (MQ=1) gTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAg < 1:520207/100‑1 (MQ=38) gTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAg > 2:63788/1‑100 (MQ=35) tCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGG < 1:1809970‑M1/100‑1 (MQ=255) cACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGT > 2:2737969‑M1/1‑100 (MQ=255) cgccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCG < 2:719450‑M1/100‑1 (MQ=255) cgccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCG > 1:351268‑M1/1‑100 (MQ=255) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGCCGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGG < 2:2923657‑M1/100‑1 (MQ=255) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAg < 1:1585132/95‑1 (MQ=33) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGG < 2:128375‑M1/100‑1 (MQ=255) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGG < 2:351265‑M1/100‑1 (MQ=255) gccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGG > 1:1894468‑M1/1‑100 (MQ=255) ccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGA > 1:2718141‑M1/1‑100 (MQ=255) ccgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGA < 2:3855292‑M1/100‑1 (MQ=255) cgcATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAT < 1:3678207‑M1/100‑1 (MQ=255) aTCCGCCACCCAACCCCCGAGGCGGTTGCCTGCTGCCACGCTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGG < 2:3699542‑M1/95‑1 (MQ=255) aTCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCTTACCCAGCTGCGACGTGCCCCACCCCGTGGGTCGGATaa > 2:3391832/1‑99 (MQ=11) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 1:3646409/1‑100 (MQ=33) ccGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 1:1873614/1‑100 (MQ=33) aCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGt < 2:3308122/100‑1 (MQ=14) aCATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt < 1:1423179/100‑1 (MQ=33) aCATCCAACGCCCGAGCCGGGTGCCTGACGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGt < 2:834493/100‑1 (MQ=12) cATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATCAGGCgg > 2:2789067/1‑98 (MQ=17) cATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg > 1:3872314/1‑98 (MQ=32) cATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 1:134168/1‑100 (MQ=33) catcGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGCGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc < 2:1720217/97‑1 (MQ=12) cAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgc > 1:957412/1‑100 (MQ=33) aaCGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgcc < 1:2095940/100‑1 (MQ=33) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc > 2:1312882/1‑100 (MQ=32) cGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTAcgccgc < 2:134166/100‑1 (MQ=32) gCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCCCCACCCCGTAGGTCGGATACGGCGGTTACGCCGCa > 1:2170352/1‑100 (MQ=9) ccaagccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatc < 1:2560934‑M1/97‑20 (MQ=255) caagcCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatcc < 2:204450‑M1/98‑21 (MQ=255) gggggtaggctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtgg < 2:783594‑M1/91‑87 (MQ=255) gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATgcggcgtaaccgccttatccaac < 1:1675177‑M1/100‑24 (MQ=255) ggggtaggctgataaggcgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtgg < 2:4155013‑M1/91‑87 (MQ=255) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccgacc < 1:2344651‑M1/100‑25 (MQ=255) ccGGTTGCCGGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATgcggcgtaaccgccttatccg < 2:65999‑M1/97‑22 (MQ=255) gaaggctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagca < 2:2592700‑M1/95‑91 (MQ=255) gCCTGATaaggcgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcactt > 2:2859403‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcactt > 1:2776057‑M1/1‑7 (MQ=255) ccTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcgggtgcggcgtaaccctcttatccggcctacggggtggagcacttc > 1:3732359‑M1/1‑6 (MQ=255) ccTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtagatcggaag > 1:842226‑M1/1‑6 (MQ=255) cTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtgaccgccttatccggcctacggggtggagcgcttca > 2:1476207‑M1/1‑5 (MQ=255) cTGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttca > 1:2025485‑M1/1‑5 (MQ=255) tGATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttc < 2:1829791‑M1/98‑95 (MQ=255) gATaagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcaca > 1:1649966‑M1/1‑3 (MQ=255) taagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgctttatccgacctacggggtggagcacttcacagc < 2:2323965‑M1/100‑100 (MQ=255) taagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagc > 2:2144061‑M1/1‑1 (MQ=255) taagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcttgggcgttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagc > 2:3451078‑M1/1‑1 (MQ=255) | GTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCGGCACCCCGTAGGTCAGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAA > NC_000913/2304491‑2304689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |