| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620116 | NA (NA) | 10 (0.070) | 5/166 | NT | 100% | coding (925/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620152 | 0 (0.000) | coding (961/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > NC_000913/3620053‑3620251 | tatttatcatcgtaagtaaagctgcgcacctgtttgccactacggtcatacaccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcg > 1:2503307‑M2/95‑100 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:4088407‑M2/1‑100 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:1140548‑M2/1‑100 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG < 1:2449897‑M2/100‑1 (MQ=255)ggCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCG > 1:2210579‑M2/1‑100 (MQ=255) ggCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggta < 1:3030957‑M2/100‑23 (MQ=255) gACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgt < 1:2309539‑M2/100‑34 (MQ=255) accgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTttac > 2:4143698‑M2/46‑100 (MQ=255) caccaccgccagttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccaGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTttact > 1:1545401‑M2/45‑100 (MQ=255) aTTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCggtaaattctccgggtattccggggcgtgcgtcagccacacggcagacagac < 2:3343440‑M2/100‑53 (MQ=255) tACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacag < 1:233699‑M2/100‑56 (MQ=255) gttcgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACgat > 2:2167522‑M2/39‑100 (MQ=255) cTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacg < 2:1822959‑M2/100‑59 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattgcgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 1:1067928‑M2/100‑60 (MQ=255) tGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgg < 1:197798‑M2/100‑60 (MQ=255) cgccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACgatgat > 2:1780589‑M2/36‑100 (MQ=255) gccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATa > 2:3878800‑M2/35‑100 (MQ=255) gccgcgtggcgtccagccatagcgcaccagcggcGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATa > 1:3478174‑M2/35‑100 (MQ=255) gccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacgga < 1:3846308‑M2/100‑61 (MQ=255) ccgcgccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCCCGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggat < 1:150894‑M2/100‑62 (MQ=255) gccgcgtggcgtccagccatagcgcaccaGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTGACGATGATAAATAc > 2:3929649‑M2/30‑100 (MQ=255) gccgcTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccg < 1:4141512‑M2/100‑66 (MQ=255) cacccgcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggccgtgcgtcagccgcacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcgg > 2:3526582‑M2/5‑11 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacccggcagccagacggctgccgttgtcccggccatattcggtgtaaccc > 2:2310692‑M2/1‑6 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccgg > 1:2408229‑M2/1‑6 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccgg < 1:4112595‑M2/100‑95 (MQ=255) gcggcgcggcaggtaaattctccgcggattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccg > 1:984979‑M2/1‑6 (MQ=255) GCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCacac > 2:2911898‑M2/1‑100 (MQ=255) GCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCacac > 2:250445‑M2/1‑100 (MQ=255) GCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCacac > 1:1126432‑M2/1‑100 (MQ=255) GCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCacac > 1:632210‑M2/1‑100 (MQ=255) cggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggc > 1:123463‑M2/1‑5 (MQ=255) cggcgcggcagggaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgcccttgtcccggccatgttcggtgtcacccgcc < 1:329902‑M2/100‑96 (MQ=255) CGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACGGTCAAACg > 2:1289624‑M2/1‑100 (MQ=255) CGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACg > 2:2899738‑M2/1‑100 (MQ=255) CGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACg > 2:3089408‑M2/1‑100 (MQ=255) ggcgcggcatgtacattcgccgcgtattccggcgcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcgg > 2:1972825‑M2/1‑4 (MQ=255) ggcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggca < 1:1583302‑M2/100‑97 (MQ=255) GGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACgg < 1:3088294‑M2/100‑1 (MQ=255) GGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACgg < 1:4017932‑M2/100‑1 (MQ=255) GGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACgg > 2:3913194‑M2/1‑100 (MQ=255) gcgcgggaggtaaattctccggggattcctggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcan > 2:4023018‑M2/1‑3 (MQ=255) gcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcag > 1:3789374‑M2/1‑3 (MQ=255) gcgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcag > 2:1231086‑M2/1‑3 (MQ=255) GCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACggg < 1:756536‑M2/100‑1 (MQ=255) GCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACggg < 1:156983‑M2/100‑1 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagcgacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg > 2:2669841‑M2/1‑2 (MQ=255) cgcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcagg > 2:548055‑M2/1‑2 (MQ=255) cGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGC < 1:1545572‑M2/100‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg < 2:3874394‑M2/100‑100 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:1972456‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:2866738‑M2/1‑1 (MQ=255) gcggcaggtaaattctccgggtattccgggtcgtgcgtcagccacacggcagacagacggatgccgttgtcccggccatattcggtgtaacccggcaggg > 1:2883693‑M2/1‑1 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > 2:2850949‑M2/1‑100 (MQ=255) gAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAAAACCGGGACAGGATGGTGGCACACCGTCACAGGGGCC < 2:4009328‑M2/100‑1 (MQ=255) | GGCATCCGTCTGTCTGCCGTGTGGCTGACGCACGACCCGGAATACCCGGAGAATTTACCTGCCGCGCCGCTGGTGCGCTATGGCTGGACGCCACGCGGCGAACTGGCGGTGGTGTATGACCGTAGTGGCAAACAGGTGCGCAGCTTTACTTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCC > NC_000913/3620053‑3620251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |