| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621232 | NA (NA) | 11 (0.080) | 5/168 | NT | 100% | coding (2041/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3621274 | 0 (0.000) | coding (2083/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
GACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAG > NC_000913/3621175‑3621373 | gACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGTCGCACACAGTGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCA > 2:2931949‑M2/1‑100 (MQ=255)gACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCA < 2:2278881‑M2/100‑1 (MQ=255)gACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCA < 1:2888443‑M2/100‑1 (MQ=255)gACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCA > 1:3004508‑M2/1‑100 (MQ=255)gACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCA < 1:3068318‑M2/100‑1 (MQ=255)gACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACATGACCGGCCAACTTAGCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCA < 2:4025273‑M2/100‑1 (MQ=255) ccGGCGGATACAGGAAACCGGCTGTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCA > 2:1433537‑M2/1‑98 (MQ=255) tCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgt < 1:908915‑M2/100‑48 (MQ=255) accacGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagcc < 1:2088047‑M2/100‑50 (MQ=255) cacGACCTGGCCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatca < 1:322121‑M2/100‑52 (MQ=255) aCCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccg < 2:3883991‑M2/100‑56 (MQ=255) aCCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccg < 1:3859965‑M2/100‑56 (MQ=255) ccTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccgg < 1:4130680‑M2/100‑57 (MQ=255) cTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggt < 1:3690198‑M2/100‑58 (MQ=255) cTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggt < 1:679304‑M2/100‑58 (MQ=255) gACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGG‑CTGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcg < 2:1360680‑M2/100‑60 (MQ=255) ggCAAACTTATCCGCAGCGAGGATAAGTTTGCCGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagt < 2:2600753‑M2/100‑63 (MQ=255) aaCTTATCCGCAGCGAGGATAAGTTTGCCGGTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacat < 1:3376122‑M2/100‑67 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt > 2:1896158‑M2/1‑5 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt > 2:2370995‑M2/1‑5 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt < 2:1274390‑M2/100‑96 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt < 1:4100310‑M2/100‑96 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt > 1:3516622‑M2/1‑5 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt > 2:461138‑M2/1‑5 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt < 1:2633633‑M2/100‑96 (MQ=255) ggTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt < 1:2136464‑M2/100‑96 (MQ=255) gTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccttcaaaaccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgtttt > 2:2261685‑M2/1‑4 (MQ=255) gTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgtttt < 1:1494770‑M2/100‑97 (MQ=255) gTCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgtttt > 1:215442‑M2/1‑4 (MQ=255) gTCAggtcgtggcgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttt > 1:829509‑M2/1‑4 (MQ=255) tCAtgtcgtggtgataacgctgtgtgcggccggcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 2:84002‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 1:874905‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 2:4058918‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 2:4125209‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 2:4015784‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 2:3406630‑M2/1‑3 (MQ=255) tCAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagcccgtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttc > 1:2811165‑M2/1‑3 (MQ=255) cAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttca > 2:3918651‑M2/1‑2 (MQ=255) cAggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttca < 1:3807690‑M2/100‑99 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 2:1514555‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 1:4046772‑M2/1‑1 (MQ=255) aggtcgtggtgataacgctgtgtgcggccgtcaaagccggtttcctgtatcagccggtcaagtacatcgtaacggaaggtggtgtggctgccgttttcac > 1:204167‑M2/1‑1 (MQ=255) | GACCGGCTGATACAGGAAACCGGCTTTGACGGCCGCACACAGCGTTATCACCACGACCTGACCGGCAAACTTATCCGCAGCGAGGATGAGGGT‑CTGGTCACCCACTGGCACTATGACGAAGCAGACCGCCTCACGCACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAG > NC_000913/3621175‑3621373 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |