New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	NC_000913	= 730045	NA (NA)	17 (0.120)	9/168	NT	NA	coding (463/4194 nt)	rhsC	Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor
	?	NC_000913	= 730067	NA (NA)					coding (485/4194 nt)	rhsC	Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor

TGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGC  >  NC_000913/730046‑730166                      |                                                                                                    tGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTg                       <  1:89824/100‑1 (MQ=32)   gCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCCGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTgg                      >  2:220787/1‑99 (MQ=17)   gCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgt                     >  2:77790/1‑100 (MQ=32)    ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg                    >  2:509567/1‑100 (MQ=33)    ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg                    <  2:3172189/100‑1 (MQ=33)    ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg                    >  2:1859243/1‑100 (MQ=33)    ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg                    >  1:3900693/1‑100 (MQ=33)    ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg                    >  1:3730772/1‑100 (MQ=33)    ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg                    >  1:2564727/1‑100 (MQ=32)    ccGCACTCTGGCAGCCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTCTCTGGCGCCAAACAGTCCCCAGGGGCCGTGGTGGCTGCCCGGCTGgt                     >  2:3548141/1‑99 (MQ=11)     cGCCCTCTGCCGCGCGCTGCCGGACGAACTCCGCTTCAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAACGAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg                    <  2:3939446/99‑1 (MQ=11)     cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtgt                   >  1:3765673/1‑100 (MQ=33)     cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtgt                   >  2:3353952/1‑100 (MQ=32)     cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtgt                   <  2:65200/100‑1 (MQ=33)      gCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGtgtg                  >  2:1640261/1‑100 (MQ=32)      gCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGtgtg                  <  2:1318039/100‑1 (MQ=33)      gCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGtgtg                  <  1:996937/100‑1 (MQ=33)       cACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGa                 >  2:73699/1‑100 (MQ=33)         ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGc               <  2:2650845/100‑1 (MQ=33)           ctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGc               <  1:3165052/98‑1 (MQ=32)           ctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCgg             <  1:2691262/100‑1 (MQ=33)            tGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTACGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCggg            <  2:649147/100‑1 (MQ=17)            tGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCggg            >  2:517497/1‑100 (MQ=33)             ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGt           >  1:634179/1‑100 (MQ=33)             ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGt           >  1:541151/1‑100 (MQ=32)             ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGt           <  1:423351/100‑1 (MQ=33)             ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGCCGACCAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGCGCGGGt           >  2:3666211/1‑100 (MQ=255)                aGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGcc        <  1:2175700/100‑1 (MQ=33)                aGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGcc        <  1:1963371/100‑1 (MQ=33)                 ggCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCg       >  1:1529004/1‑100 (MQ=33)                 ggCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCg       <  2:3211913/100‑1 (MQ=33)                 ggCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCg       <  1:1653443/100‑1 (MQ=32)                  gcgcTGCCGGGAGATCTCCGCTTACGGCCGCATCGTTCTCTGGCGGCAAAGGGTCCGCAGGGGGCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGct        <  2:1384687/98‑2 (MQ=11)                  gcgcTGCCGGAAGAACTCCGCTTCAGTCCGCAGCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCgg      <  2:1032865/100‑1 (MQ=16)                  gcgcTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCgg      <  2:592896/100‑1 (MQ=33)                      tGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGc  <  1:1184355/100‑1 (MQ=33)                      |                                                                                                    TGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGC  >  NC_000913/730046‑730166

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.