| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1468681 | NA (NA) | 64 (0.850) +ACACCATGTTATCGGAGAGCTGCCAACGTATGGTTATCGTCGGG |
13/90 | NT | NA | noncoding (560/1331 nt) | IS2 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 1650843 = | NA (NA) | noncoding (1/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 624 total aligned reads displayed.
CAGTACACTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > NC_000913/1650744‑1650941 | acTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGgc > 1:13803/1‑100 (MQ=255) gAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGACCTATGGGCgct > 2:3474425/1‑100 (MQ=255) aTTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCtt < 1:2158626/100‑1 (MQ=255) aaCAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCa < 2:3831952/100‑1 (MQ=255) ggAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACa > 1:471649/1‑100 (MQ=255) atggtgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAg > 1:1169127‑M2/74‑100 (MQ=255) ggtgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGaa > 1:2051295‑M2/72‑100 (MQ=255) tgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACt > 1:1746019‑M2/70‑100 (MQ=255) tgtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgagTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACt > 2:2139007‑M2/70‑100 (MQ=255) gtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACtt > 2:1010893‑M2/69‑100 (MQ=255) gtatacggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctaccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACtt > 1:1557733‑M2/69‑100 (MQ=255) ggagaagcacatccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGt > 1:653428‑M2/63‑100 (MQ=255) gcCATTCATGGCGAATACAAGCAGACTGGGAAAACAATGGATGACGAACTGGCGAAGGGGGGCAGATTAGGAGAAAGGGAGAACTTGATgggaggac > 2:3935995/1‑91 (MQ=255) gcCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGc > 1:894885/1‑100 (MQ=255) ccATTCATCGCGAATATAAGCAGACATGGAAAACTCTTGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAATTTGATGGTATGCCTGCg < 2:3728459/100‑1 (MQ=25) tccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGAt < 1:827342‑M2/49‑1 (MQ=255) tccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGAt < 2:1255559‑M2/49‑1 (MQ=255) tccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGAt < 1:1040029‑M2/49‑1 (MQ=255) tccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGAt > 1:3218739‑M2/52‑100 (MQ=255) tccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGAt > 1:3067461‑M2/52‑100 (MQ=255) ccgtctacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGTACTTGATGGTATGCCTGCGATc < 2:2423697‑M2/50‑1 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc > 2:118821‑M2/51‑100 (MQ=255) ccgtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATc > 2:1822693‑M2/51‑100 (MQ=255) taaTCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCGATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCa < 2:416871/98‑1 (MQ=255) gtatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCaa > 1:3834875‑M2/49‑100 (MQ=255) tatacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAAt < 1:3097223‑M2/53‑1 (MQ=255) atacacgatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 2:3231270‑M2/54‑1 (MQ=255) atacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAatt < 1:271681‑M2/54‑2 (MQ=255) atacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 2:877881‑M2/54‑1 (MQ=255) atacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 2:806428‑M2/54‑1 (MQ=255) atacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATg < 2:653424‑M2/54‑1 (MQ=255) tacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGc < 2:2658015‑M2/55‑1 (MQ=255) tacaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGc > 2:234353‑M2/46‑100 (MQ=255) acaccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGcc < 2:107083‑M2/56‑1 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa > 1:2650723‑M2/44‑100 (MQ=255) caccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCa > 2:468089‑M2/44‑100 (MQ=255) accatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaa > 1:2872702‑M2/43‑100 (MQ=255) accatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaa > 1:2007354‑M2/43‑100 (MQ=255) ccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCaaa > 1:3740345‑M2/42‑100 (MQ=255) ccatgttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTCGATGGTATGCCCGCGATCAATGGCaa > 2:915460‑M2/42‑99 (MQ=255) ttatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACgtgt < 2:2083550‑M2/64‑1 (MQ=255) tatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGtt < 2:3289311‑M2/65‑1 (MQ=255) tatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGtt < 1:2795065‑M2/65‑1 (MQ=255) tatcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGtt < 1:3291053‑M2/65‑1 (MQ=255) atcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGttt < 2:144161‑M2/66‑1 (MQ=255) tcggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTa > 1:2357988‑M2/34‑100 (MQ=255) cggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAc > 2:745056‑M2/33‑100 (MQ=255) ggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAcc > 1:420931‑M2/32‑100 (MQ=255) ggagagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTAc < 2:1507534‑M2/68‑1 (MQ=255) cATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCgg < 2:1332405/100‑1 (MQ=255) agagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCgg > 2:2482178‑M2/30‑100 (MQ=255) agagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCgg < 2:302549‑M2/71‑1 (MQ=255) agagctgccaacgtatggttatcgtcgggGATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCCATACCACACGTGTTTACCgg > 2:1914752‑M2/30‑100 (MQ=255) gagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGa > 1:1834108‑M2/29‑100 (MQ=255) gagctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGCGTTTACCGGa < 1:2475678‑M2/72‑1 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgtgTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc < 2:2039119‑M2/74‑1 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc > 1:3459675‑M2/27‑100 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc > 1:3154730‑M2/27‑100 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc > 1:2440479‑M2/27‑100 (MQ=255) gctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATc > 1:4094298‑M2/27‑100 (MQ=255) ctgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCa < 1:4007172‑M2/75‑1 (MQ=255) tgccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCAt > 1:1330407‑M2/25‑100 (MQ=255) gccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg < 2:593398‑M2/77‑1 (MQ=255) gccaacgtatggttatcggcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGGATGACTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTaccggacaatg > 2:501109‑M2/24‑95 (MQ=255) gccaacgtatggttatcatcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGACGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATg > 2:3550787‑M2/24‑100 (MQ=255) ttccgatctggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc < 1:3331826‑M2/78‑1 (MQ=255) ccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc < 1:3849580‑M2/78‑1 (MQ=255) ccaacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgc < 2:4034611‑M2/78‑1 (MQ=255) aacgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATgcgc < 1:3516491‑M2/80‑1 (MQ=255) acTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGcc > 2:1135542/1‑100 (MQ=255) acTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGcc > 2:3157598/1‑100 (MQ=255) cgtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCa < 1:1625977‑M2/82‑1 (MQ=255) gtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAg < 2:2243651‑M2/83‑1 (MQ=255) gtatggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAg < 2:2988005‑M2/83‑1 (MQ=255) gtatggttagcgaggggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTTCGATCAATGCCAAACGGCTTTACCAGATCATGCGCCAg < 2:3620368‑M2/83‑1 (MQ=255) atggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGaa < 1:1250949‑M2/85‑1 (MQ=255) ggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATg > 1:3016464‑M2/14‑100 (MQ=255) ggttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATg > 1:563851‑M2/14‑100 (MQ=255) ggttatcgtcgggTATGGGAGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATACCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATg > 2:293291‑M2/14‑100 (MQ=255) ttatcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATgcg > 1:2254127‑M2/12‑100 (MQ=255) atcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCt > 2:2788330‑M2/10‑100 (MQ=255) atcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCt < 2:176221‑M2/91‑1 (MQ=255) atcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCt < 1:852935‑M2/91‑1 (MQ=255) tcgtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCCGAATGCGCt > 2:3376324‑M2/9‑99 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 1:3538404‑M2/7‑100 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 1:596878‑M2/7‑100 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 1:3665731‑M2/7‑100 (MQ=255) gtcgggTATGGGCGCTGCTTCACAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt > 2:2380247‑M2/7‑100 (MQ=255) tcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGtt < 2:1626022‑M2/94‑1 (MQ=255) tcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 1:2941786‑M2/95‑1 (MQ=255) tcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 1:40561‑M2/95‑1 (MQ=255) tcgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 1:1467128‑M2/95‑1 (MQ=255) tGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTg < 1:530397/100‑1 (MQ=35) cgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGc < 1:1000372‑M2/96‑1 (MQ=255) cgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGc > 1:1682402‑M2/5‑100 (MQ=255) cgggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGc > 1:1906707‑M2/5‑100 (MQ=255) gggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCt > 2:1700514‑M2/4‑100 (MQ=255) ggTATGGTCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGTTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt < 2:4136921‑M2/98‑1 (MQ=255) ggTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGAAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCtt > 1:2536384‑M2/3‑100 (MQ=255) gTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTg < 1:72153‑M2/99‑1 (MQ=255) | CAGTACACTGAAAATTCAACAGGAAAAATCAGCCCGGTCATTGCTGCCATTCATCGCGAATACAAGCAGACATGGAAAACACTGGATGACGAACTGGCCTATGGGCGCTGCTTCGCAGACAGGCAGAACTTGATGGTATGCCTGCGATCAATGCCAAACGTGTTTACCGGATCATGCGCCAGAATGCGCTGTTGCTTG > NC_000913/1650744‑1650941 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |