| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,278,298 | C→T | 100% | intergenic (‑61/+272) | yejG ← / ← bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,278,298 | 0 | C | T | 98.8% | 378.8 / ‑4.3 | 119 | intergenic (‑61/+272) | yejG/bcr | uncharacterized protein/bicyclomycin/cysteine/sulfonamide efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/1); new base T (51/66); total (52/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
CGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCACGTT > NC_000913/2278206‑2278394 | cGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATc > 2:145974/1‑100 (MQ=255)cGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATc < 1:782821/100‑1 (MQ=255) gATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTCCATCAATTTTAACACATCATTAACAATc > 2:3748522/1‑99 (MQ=255) aTGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCg < 2:1100896/100‑1 (MQ=255) ggcGATTGAGAGTTGTAATAAAGTCAATTATTTTCCTCAGAAGCACCTTTACTACAAACTTTGTTTGCATCAGTTCTAACACATCATTCACAATcc > 2:1500933/3‑96 (MQ=255) gACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCt > 1:1413590/1‑100 (MQ=255) gACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCt > 2:3898356/1‑100 (MQ=255) gACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCt < 2:702645/100‑1 (MQ=255) cGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCttt < 2:626562/100‑1 (MQ=255) gATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTta < 1:1725359/100‑1 (MQ=255) aTTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTtat > 2:1121411/1‑100 (MQ=255) aTTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTtat > 2:848021/1‑100 (MQ=255) ttGAGAGCTGTAATGAAGTCCGTTATTTTCTCCGGAAGCACATTTACTACACAATTTGTTTACATCAATCTTAACACATCATTAACAATCTGACTTtat > 2:4050671/1‑99 (MQ=255) tGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATAc < 2:2384816/100‑1 (MQ=255) tGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATAc > 1:3310012/1‑100 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCgagatcggaa > 1:3747490/1‑90 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa < 1:247944/100‑1 (MQ=255) gagaGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACa < 2:751044/100‑1 (MQ=255) gagaGTTGTAAAGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACCTCATTAACAATCCGTCTTTATACa < 2:1490964/100‑1 (MQ=255) agagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAg < 2:1919555/100‑1 (MQ=255) agagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAg < 2:1395069/100‑1 (MQ=255) agagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAg < 2:469965/100‑1 (MQ=255) gagTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTATTTATACAGa > 2:4002592/1‑100 (MQ=255) gTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCTGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATc < 2:834574/100‑1 (MQ=255) gTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATc < 2:2605554/100‑1 (MQ=255) gTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATc < 1:2241640/100‑1 (MQ=255) tGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGATGTATATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACACCATTAACAATCCGTCTTTATACAg < 2:2160628/95‑1 (MQ=255) gTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATGAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTa > 2:2669920/1‑100 (MQ=255) gTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTa > 2:1185287/1‑100 (MQ=255) gTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTa > 2:4122288/1‑100 (MQ=255) tAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAATCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAAGACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTa < 2:3519963/99‑1 (MQ=255) tAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTaa > 2:3764913/1‑100 (MQ=255) gAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAt > 2:1836798/1‑100 (MQ=255) aaGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAtt < 2:2156597/100‑1 (MQ=255) aaGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAtt > 2:1837802/1‑100 (MQ=255) aaGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGAtt < 1:3064774/100‑1 (MQ=255) aGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTg < 1:3394994/100‑1 (MQ=255) gacACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGa > 1:2804551/3‑100 (MQ=255) gTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGa > 1:2508906/1‑100 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGAt > 2:3927202/1‑99 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg < 2:3663584/100‑1 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg > 2:1726461/1‑100 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg > 2:1087065/1‑100 (MQ=255) cACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATg < 1:3737661/100‑1 (MQ=255) aCTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGc > 1:237497/1‑100 (MQ=255) aCTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGc < 1:1849988/100‑1 (MQ=255) cTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGcc < 2:371852/100‑1 (MQ=255) cTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTAGACAGATCGTAAAGATTGATGcc < 2:2644194/100‑1 (MQ=255) tATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTc > 1:651260/1‑100 (MQ=255) aTTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCg > 2:3407970/1‑100 (MQ=255) aTTTTCCCCGGAAGAACATTCAATTCACAATTTGTTTCCATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCg < 2:3478483/100‑1 (MQ=255) tttCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGcc > 2:1776547/1‑100 (MQ=255) ggAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTgg < 1:3259920/100‑1 (MQ=255) ggAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTg < 2:378826/99‑1 (MQ=255) gAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGc < 1:1511545/100‑1 (MQ=255) ngCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCct > 2:307906/2‑100 (MQ=255) aGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCct > 1:1635154/1‑100 (MQ=255) aGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCct > 2:1805588/1‑100 (MQ=255) aGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCct < 1:3895725/100‑1 (MQ=255) gCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctc < 1:295714/100‑1 (MQ=255) gCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctc < 1:60459/100‑1 (MQ=255) cacaTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCctct > 1:2631099/1‑100 (MQ=255) cacaTGCACTTCACAATTTGTTTACATCAATGTTAACACAGCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGAGGCCTCGCCTGCGTGGCctct < 2:2797515/100‑1 (MQ=255) acaTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTa < 1:706981/100‑1 (MQ=255) caTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTAt < 1:1620045/100‑1 (MQ=255) aTTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATg < 2:322126/100‑1 (MQ=255) ttcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTTGCCTCTATgg > 2:1167126/1‑100 (MQ=255) tcacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCTTTAACAACCCGTCTTTATACTGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATgg < 1:372624/99‑1 (MQ=255) cacttcagAATTTGTTTACATCAATGTTAACACATCAGTAACAATCCGTCTTGATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGct < 1:4171192/100‑1 (MQ=255) cacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGct > 1:3909171/1‑100 (MQ=255) cacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGct > 1:897700/1‑100 (MQ=255) cacttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGc < 1:1696132/99‑1 (MQ=255) acttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGctc > 1:3210288/1‑100 (MQ=255) cttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGctct > 1:2594436/1‑100 (MQ=255) cttcacAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAAGCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGctc < 1:1922694/99‑1 (MQ=255) cacaATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGAt < 1:970997/100‑1 (MQ=255) aaTTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTa < 1:874807/100‑1 (MQ=255) aaTTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTa > 1:3565598/1‑100 (MQ=255) aaTTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTa < 1:2985582/100‑1 (MQ=255) tttGTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAg < 2:322153/100‑1 (MQ=255) gTTTACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTTCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTaa > 2:3664989/1‑100 (MQ=255) ttgcATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTATTTATACAGATCGTAAACATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTaaga < 2:1337061/97‑3 (MQ=255) ttACATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAata > 2:4104984/1‑100 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCt > 2:2004397/1‑100 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCt > 2:981654/1‑100 (MQ=255) cATCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCt > 2:981655/1‑100 (MQ=255) aTCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTg > 1:789120/1‑100 (MQ=255) tCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGc > 2:2714922/1‑100 (MQ=255) tCAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGc > 2:574130/1‑100 (MQ=255) cAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCg > 2:545602/1‑100 (MQ=255) cAATTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCg < 2:2330814/100‑1 (MQ=255) aTTTTAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCggg < 1:689108/100‑1 (MQ=255) ttttAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGc > 2:1780015/1‑100 (MQ=255) tttAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCg < 2:2396739/100‑1 (MQ=255) tAACACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCgac < 1:1152934/100‑3 (MQ=255) aaCACATCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCTTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTgg < 2:2307783/100‑1 (MQ=255) acacATCATTAACAATCCTTCTTTAGACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCACCTGCGTGCCCTCTAGGGCGCTGCTTTAAGTCATATCTGCg > 2:3322884/1‑92 (MQ=255) acaTCATTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCa < 1:2713216/100‑1 (MQ=255) catcatTAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCAc > 2:1745954/1‑100 (MQ=255) cattaACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGCGGCCTCTATGGCTATGATTTAAGTAATATCTGCGGGGGTGGTCACGtt > 2:4125484/1‑100 (MQ=255) | CGATGGACGATTGAGAGTTGTAATGAAGTCACTTATTTTCCCCGGAAGCACATTCACTTCACAATTTGTTTACATCAATTTTAACACATCATCAACAATCCGTCTTTATACAGATCGTAAAGATTGATGCCTCGCCTGCGTGGCCTCTATGGCTCTGATTTAAGTAATATCTGCGGGCGTGGTCACGTT > NC_000913/2278206‑2278394 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |