| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,365,836 | T→C | 74.4% | intergenic (‑216/‑92) | ais ← / → arnB | putative LPS core heptose(II)‑phosphate phosphatase/uridine 5'‑(beta‑1‑threo‑pentapyranosyl‑4‑ulose diphosphate) aminotransferase, PLP‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,365,836 | 0 | T | C | 74.4% | 251.3 / 85.7 | 144 | intergenic (‑216/‑92) | ais/arnB | putative LPS core heptose(II)‑phosphate phosphatase/uridine 5'‑(beta‑1‑threo‑pentapyranosyl‑4‑ulose diphosphate) aminotransferase, PLP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/20); new base C (50/56); total (68/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
CAAAATTTTGCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAGCAATGTCA > NC_000913/2365739‑2365933 | aaaaTTTGGCAAATGTCAAGGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAAGTTCAATATTTACGTCGAATATGAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTAccc < 2:1248375/99‑1 (MQ=255) aaaTTTTGCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCtt > 1:3802452/1‑100 (MQ=255) ttttGCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTaaa < 2:1184652/100‑1 (MQ=255) ttttGCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTaaa > 1:1695190/1‑100 (MQ=255) ttttGCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTaaa < 1:3443052/100‑1 (MQ=255) tatgacAAATG‑CAAAGACTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTaaaa < 2:3985594/95‑1 (MQ=255) ttGCTAAATG‑CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTaa < 2:1776148/97‑1 (MQ=255) tGCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAAAAAAAAAATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAAtt < 2:2210764/100‑1 (MQ=255) gCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAAttt > 2:1556009/1‑100 (MQ=255) gCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGATAAGTTCAGATTCTACCCTTAAAAttt > 1:3261848/1‑100 (MQ=255) cAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCg > 1:978593/1‑100 (MQ=255) cAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCg > 2:2607908/1‑100 (MQ=255) aaaTG‑CAAAGCGTAAATAAGAAAAAATATAAAAATGTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTc < 2:1173280/98‑1 (MQ=255) aaaTG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGc < 1:88618/100‑1 (MQ=255) aTG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTc > 2:3208297/1‑100 (MQ=255) tG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTcc < 2:987312/100‑1 (MQ=255) g‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCa < 1:4094026/100‑1 (MQ=255) g‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTATAAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCa > 2:2440110/1‑100 (MQ=255) cAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCaa > 2:152643/1‑100 (MQ=255) cAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCaa > 1:604659/1‑100 (MQ=255) aGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATg < 1:2843601/100‑1 (MQ=255) gCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATgg < 2:84765/100‑1 (MQ=255) gCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATgg < 1:2512441/100‑1 (MQ=255) ccTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGc < 1:3255412/100‑1 (MQ=255) ccTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGc < 2:2719661/100‑1 (MQ=255) cTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCACAATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGc < 2:1993823/99‑1 (MQ=255) tAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATgg < 2:278148/97‑1 (MQ=255) aaaTAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCaaa > 1:1462243/1‑100 (MQ=255) tAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAata < 2:2712698/100‑1 (MQ=255) aaGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAatat > 2:503934/1‑100 (MQ=255) aGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAatat < 2:147832/99‑1 (MQ=255) aGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAAtata < 2:2126146/100‑1 (MQ=255) gAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAATGTTAAGTTAATATTATACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATac < 2:1476128/100‑1 (MQ=255) gAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATac < 1:3855418/100‑1 (MQ=255) gAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATac > 1:110199/1‑100 (MQ=255) aaaaaaTATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTTTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATaca < 2:2920320/100‑1 (MQ=255) aaaaaaTATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATaca < 1:3861688/100‑1 (MQ=255) aaaaTATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATAcac‑a < 1:284656/100‑1 (MQ=255) aaTATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACac‑aac > 1:670126/1‑100 (MQ=255) taAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACActc > 2:1563802/1‑100 (MQ=255) taAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACActc > 1:3493913/1‑100 (MQ=255) taAAAATTTCAATATTTACGCCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACAct > 2:2547340/1‑99 (MQ=255) aaaTTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCttt < 1:1955672/100‑1 (MQ=255) aaaTTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCttt < 2:4082026/100‑1 (MQ=255) aaTTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTta < 2:1036462/100‑1 (MQ=255) tttCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTtata < 2:931317/100‑1 (MQ=255) ttgcAAGATTTACATTGAATATTAATTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATACTAAAAATTACGCTCCAAGTAGCAAAATATACAA‑AACACGCttttt < 2:3340045/96‑3 (MQ=255) ttCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAg < 2:497382/100‑1 (MQ=255) tCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGc < 2:3201657/100‑1 (MQ=255) aaTATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCaa > 1:2121298/1‑100 (MQ=255) aaTATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCaa > 2:768876/1‑100 (MQ=255) atatTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCaaa < 2:2965973/100‑1 (MQ=255) atatTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCaaa < 2:2966003/100‑1 (MQ=255) tttACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAatat > 1:1512281/1‑100 (MQ=255) ttACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAAtata < 2:369048/100‑1 (MQ=255) tACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATaa > 1:1020142/1‑100 (MQ=255) aCGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAg < 2:212152/100‑1 (MQ=255) gTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTg < 2:3059537/100‑1 (MQ=255) gTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTg < 1:240291/100‑1 (MQ=255) tCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATCCTACCCTTAAAATTTCACTCCAAATGACAAAATATACAC‑AACACTCTTTATACAAAATATaa > 2:2366121/1‑96 (MQ=255) cTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGa > 1:1009412/1‑100 (MQ=255) cTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGa > 1:3689905/1‑100 (MQ=255) cTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGa < 1:224378/100‑1 (MQ=255) tAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGAc > 1:2481982/1‑100 (MQ=255) aaTATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGATCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACa < 2:2013796/100‑1 (MQ=255) atatTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAg < 2:1338234/100‑1 (MQ=255) atatTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAg < 1:2391553/100‑1 (MQ=255) tatTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAgg < 1:4036387/100‑1 (MQ=255) aGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTAtt < 1:22146/100‑1 (MQ=255) gTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTc < 1:4123705/100‑1 (MQ=255) gTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTc > 1:3735863/1‑100 (MQ=255) ttCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCaa > 2:1782087/1‑100 (MQ=255) ttCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCaa > 2:302820/1‑100 (MQ=255) tCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAAt > 2:2780492/1‑100 (MQ=255) tCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAAt > 2:1530220/1‑100 (MQ=255) ttAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATgg < 1:2547355/100‑1 (MQ=255) tAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGc > 1:1599917/1‑100 (MQ=255) tAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGc < 2:3088189/100‑1 (MQ=255) tAAGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGc > 1:2641492/1‑100 (MQ=255) aaGGTTAAGTTAATATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCg < 1:4652/100‑1 (MQ=255) ggTTACGTTAATATTCTACCCTTAAACTTTCGCTTCAAAAGTCAAACTATACACAAACAC‑CTTTATAGCAAATATAAGTCGACAGGTATTCAATGGCg > 2:699522/1‑98 (MQ=255) gttaagttaaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCggaa > 1:479899/1‑100 (MQ=255) ttaagttaaTATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCggaag < 2:1425740/100‑1 (MQ=255) ttaagttaaTATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCggaag > 1:1523443/1‑100 (MQ=255) ttaagttaaTATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCggaag < 1:2076237/100‑1 (MQ=255) aagttaaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCggaagga < 2:1062018/100‑1 (MQ=255) agttaaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCggaaggaa > 2:2885346/1‑100 (MQ=255) agttaaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCggaaggaa > 1:2178441/1‑100 (MQ=255) agttaaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATCCAATGGCggaaggaa > 1:4118142/1‑100 (MQ=255) agttaaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGAGAACAGGTATTCAATGGCggaaggaa > 2:251588/1‑100 (MQ=255) gttaaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGaaa > 2:676440/1‑100 (MQ=255) gttaaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGaaa < 1:2068002/100‑1 (MQ=255) taaTATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAg < 2:3802423/100‑1 (MQ=255) taaTATTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAg > 2:430646/1‑100 (MQ=255) aaTATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAGc > 1:57211/1‑100 (MQ=255) atatTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAGCa > 2:1952450/1‑100 (MQ=255) tatTCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAGCaa < 1:2664675/100‑1 (MQ=255) ttCTACCCTTAAAATTTCGCTCCACATGGCAAAATATACAC‑AACACTCCTTATCGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAGCAATg < 1:2267119/100‑1 (MQ=255) ttCTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAGCAATg > 2:3474772/1‑100 (MQ=255) cTACCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAGCAATGTc > 2:2189748/1‑100 (MQ=255) | CAAAATTTTGCCAAATG‑CAAAGCCTAAATAAGAAAAAATATAAAAATTTCAATATTTACGTCTAATATTAGTTTCTTAAGGTTAAGTTAATATTCTATCCTTAAAATTTCGCTCCAAATGGCAAAATATACAC‑AACACTCTTTATAGCAAATATAAGTGGACAGGTATTCAATGGCGGAAGGAAAAGCAATGTCA > NC_000913/2365739‑2365933 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |