| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,501,197 | A→C | 79.3% | N23T (AAC→ACC) | ypdC → | putative DNA‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,501,197 | 0 | A | C | 79.3% | 295.9 / 63.3 | 124 | N23T (AAC→ACC) | ypdC | putative DNA‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (8/18); new base C (50/48); total (58/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.90e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
AGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCT > NC_000913/2501101‑2501293 | aGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAcccc > 1:1303584/1‑100 (MQ=255) ttAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCAGATCAACAATTTCTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGc < 2:1043466/100‑1 (MQ=255) tAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCa < 1:2579248/100‑1 (MQ=255) tAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCa < 2:1485227/100‑1 (MQ=255) tAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCa > 2:553220/1‑100 (MQ=255) aaTGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCaa > 2:1016194/1‑100 (MQ=255) aaTGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCaa > 2:490773/1‑100 (MQ=255) ttccgatctAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAact < 1:510285/92‑1 (MQ=255) gCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCACGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGAGGCCTGGTGCTTACTCCGCAact > 2:3924363/1‑99 (MQ=255) cATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAactac > 1:1749259/1‑100 (MQ=255) cTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTgg > 1:11316/1‑100 (MQ=255) cTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTgg < 2:3171013/100‑1 (MQ=255) tttAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTggg < 1:434502/100‑1 (MQ=255) tttAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTggg < 1:3517361/100‑1 (MQ=255) ttAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTggg > 1:2429761/1‑99 (MQ=255) ttAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTAGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTgg > 2:2756441/1‑98 (MQ=255) aaTCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAactagatcggaa > 2:510282/1‑92 (MQ=255) aTCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCTGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATTTGGTCAGCGGCCTGGTGCTTTAACCGCAACGACTGGGgcgc > 1:610289/1‑100 (MQ=255) gggAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTc < 1:2613268/100‑1 (MQ=255) aaCTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTgg < 1:3622164/100‑1 (MQ=255) cTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGtt > 1:2843709/1‑100 (MQ=255) cTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGt < 2:2075979/99‑1 (MQ=255) tttCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACACCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGttt > 2:1476013/1‑100 (MQ=255) ttCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTg < 1:3618178/100‑1 (MQ=255) cATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCAGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTgcc > 2:4154028/1‑100 (MQ=255) aTGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTgcca > 1:1009158/1‑100 (MQ=255) tGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTgccag > 1:1058491/1‑100 (MQ=255) tGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTgccag > 1:1491515/1‑100 (MQ=255) gAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTgccagc > 1:1668998/1‑100 (MQ=255) aaaGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTgccagcc < 1:3228797/100‑1 (MQ=255) gCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCcagccagc > 1:3812723/1‑100 (MQ=255) aCCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAgcct < 1:409252/100‑1 (MQ=255) ggCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGAGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAgcctgc > 2:1850758/1‑98 (MQ=255) gCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTc < 1:3252436/100‑1 (MQ=255) gCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTg < 1:438865/100‑1 (MQ=255) gCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTg < 1:2602468/100‑1 (MQ=255) cccGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGc < 1:2493033/100‑1 (MQ=255) cccGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGc < 1:570055/100‑1 (MQ=255) ccgccgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGcc > 1:3288877/1‑100 (MQ=255) cgccgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGcc < 2:3083228/99‑1 (MQ=255) gccgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGcccg > 2:1933733/1‑98 (MQ=255) gccgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCgg < 1:3044390/100‑1 (MQ=255) gccgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCgg < 2:1281267/100‑1 (MQ=255) gccgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCgg < 1:1817244/100‑1 (MQ=255) ccgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGt > 1:823386/1‑100 (MQ=255) ccgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGt > 2:3245122/1‑100 (MQ=255) cgctCAACAATGTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTg < 2:4132632/97‑1 (MQ=255) cgATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTg < 1:3419086/100‑1 (MQ=255) gATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTgg > 2:474954/1‑100 (MQ=255) aTCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTggg < 2:3358159/100‑1 (MQ=255) aTCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTggg < 1:3742728/100‑1 (MQ=255) caacatTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCa < 2:1857156/100‑1 (MQ=255) caacaaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCa > 2:2891318/1‑100 (MQ=255) aacaaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAg > 2:3802832/1‑100 (MQ=255) aacaaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAg > 2:4117476/1‑100 (MQ=255) caaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGtt > 1:4093274/1‑100 (MQ=255) caaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGtt < 1:1611809/100‑1 (MQ=255) caaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGtt > 1:2355658/1‑100 (MQ=255) caaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGtt > 1:1988168/1‑100 (MQ=255) caaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGtt < 1:3713703/100‑1 (MQ=255) aaTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCTTCGTTGCCGGTGGGCAGttt < 2:2537550/100‑1 (MQ=255) aTTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTa > 2:488652/1‑100 (MQ=255) tttCGCCGATCGGTTCAGCGGCCTGTTGCTTACCCCGCAACGACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATg < 2:3278093/99‑1 (MQ=255) tCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTAt < 2:2130962/100‑1 (MQ=255) gacGATCTGTTCAACGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTg > 1:2830636/3‑100 (MQ=255) ccGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGa > 1:1060326/1‑100 (MQ=255) aTCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCTCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCATCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGAttt < 2:1853522/100‑1 (MQ=255) cTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTc > 2:1956540/1‑100 (MQ=255) cTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTc > 2:1956786/1‑100 (MQ=255) tGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTcc > 2:130640/1‑100 (MQ=255) tGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTcc < 2:2121264/100‑1 (MQ=255) tGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTcc < 1:1860015/100‑1 (MQ=255) tGTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTc > 1:44528/1‑99 (MQ=255) gTTCAGCGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTccc < 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cGGCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTg < 1:490580/100‑1 (MQ=255) cGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTg < 1:1339037/100‑1 (MQ=255) ggCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTgg < 1:4087607/100‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGa < 2:1690861/100‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGa < 1:490776/100‑1 (MQ=255) gCCTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGa < 1:3276097/100‑1 (MQ=255) ccTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGat > 1:1352848/1‑100 (MQ=255) ccTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGat > 1:1797184/1‑100 (MQ=255) ccTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGAGTTTCCCCGTCTGGat > 1:4107493/1‑100 (MQ=255) cTGGTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGata > 1:646984/1‑100 (MQ=255) ggTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATc > 1:1717044/1‑100 (MQ=255) gTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCg > 2:585072/1‑100 (MQ=255) gTGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCg < 1:481256/100‑1 (MQ=255) tGCTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGA‑TTTCCCCGTCTGGATATCGtg < 1:440188/100‑1 (MQ=255) tGCTTACCCCGCAACGACTGGGGCGCTTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGTCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATGTTCCTTATCTGGGTATCGt < 2:219564/100‑1 (MQ=255) ncTTACCCCGCAAATACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGtg > 2:2581131/2‑100 (MQ=255) cTTACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAACCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGtgc > 2:2229775/1‑100 (MQ=255) cTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGtgc < 2:2830620/100‑1 (MQ=255) ttACCCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGtgct > 1:2314098/1‑100 (MQ=255) | AGTTAATGCATCTTTAATCGGGAACTTTCATGAAAGCACCAGGCTTGCCCGCCGATCAACAATTTTTCGCCGATCTGTTCAGCGGCCTGGTGCTTAACCCGCAACTACTGGGGCGCGTCTGGTTTGCCAGCCAGCCTGCCTCGTTGCCGGTGGGCAGTTTATGTATTGATTTTCCCCGTCTGGATATCGTGCT > NC_000913/2501101‑2501293 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |