| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,016,405 | C→T | 77.8% | L116F (CTT→TTT) | ygfK → | putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,016,405 | 0 | C | T | 77.8% | 337.1 / 99.2 | 180 | L116F (CTT→TTT) | ygfK | putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (21/19); new base T (64/76); total (85/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.16e-01 | |||||||||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
AACCGTCCAAATTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCTTTAATA > NC_000913/3016308‑3016504 | aaCCGTCCAAATTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCt < 1:3068182/99‑1 (MQ=255) aCCGTCCAAATTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTa < 2:2335066/100‑1 (MQ=255) gTCCAAATTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAg > 1:1007898/1‑100 (MQ=255) gTCCAAATTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAg > 1:337037/1‑100 (MQ=255) gTCCAAATTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAg < 2:1716805/100‑1 (MQ=255) cAAATTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCt > 1:3701050/1‑100 (MQ=255) aaTTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTgg < 1:3620505/100‑1 (MQ=255) aaTTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTgg < 1:787072/100‑1 (MQ=255) aaTTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTCAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCttg < 1:2811444/100‑3 (MQ=255) aTTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTggg < 1:2472921/100‑1 (MQ=255) ttCTTGACCGCCTGGAGCTTGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGTGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTggg < 2:3940725/99‑1 (MQ=255) tCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGAt < 2:3637455/100‑1 (MQ=255) cTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATg < 2:1115189/100‑1 (MQ=255) cTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATg > 2:3440033/1‑100 (MQ=255) tGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCCTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGa < 1:3612606/99‑1 (MQ=255) gACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAAt > 2:639233/1‑100 (MQ=255) ccGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATAc > 1:1436577/1‑100 (MQ=255) tGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCaa > 2:3571318/1‑100 (MQ=255) gAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGTCTGGGATGAATACCTCAAAg < 2:2538936/100‑1 (MQ=255) aGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGc > 2:871169/1‑100 (MQ=255) gCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGcc > 2:4078550/1‑100 (MQ=255) cTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCt < 1:1143313/100‑1 (MQ=255) cTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCt > 1:659139/1‑100 (MQ=255) ggAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTgg > 1:922434/1‑100 (MQ=255) aGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGc < 1:1170005/100‑1 (MQ=255) gCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGcc > 2:2469785/1‑100 (MQ=255) gCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGcc > 1:2079839/1‑100 (MQ=255) gCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGcc > 2:1323281/1‑100 (MQ=255) cccTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGccc > 1:355212/1‑100 (MQ=255) ccTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCt > 2:1093205/1‑100 (MQ=255) ccTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCt > 1:1768104/1‑100 (MQ=255) tGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGc < 2:3511724/100‑1 (MQ=255) tGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGCGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGc > 2:2071849/1‑100 (MQ=255) gTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCa < 1:117475/100‑1 (MQ=255) tATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGGCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCAc < 1:4143911/100‑1 (MQ=255) tATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCAc < 2:3532506/100‑1 (MQ=255) tCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCt < 2:3776617/100‑1 (MQ=255) cGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCtt > 1:2874310/1‑100 (MQ=255) cGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCtt > 2:285728/1‑100 (MQ=255) cGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCtt > 1:1247607/1‑100 (MQ=255) tGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTtctc < 1:2706003/100‑1 (MQ=255) gCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCg > 2:3343056/1‑100 (MQ=255) ccGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTGCCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTtctc < 2:2671434/98‑1 (MQ=255) gAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAg < 1:1568227/100‑1 (MQ=255) aaGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGc > 1:1005740/1‑100 (MQ=255) aaGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGc < 1:3160226/100‑1 (MQ=255) aGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCg < 2:1831547/100‑1 (MQ=255) aGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCg < 1:531417/100‑1 (MQ=255) gACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGa < 1:1899219/100‑1 (MQ=255) aCGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGAt < 2:948047/100‑1 (MQ=255) aCGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGAt > 2:3676502/1‑100 (MQ=255) gAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGt > 2:1590546/1‑100 (MQ=255) tGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTcc < 1:831756/100‑1 (MQ=255) gCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCa > 2:756154/1‑100 (MQ=255) gCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACATTCTCGACGCGATGTTCCa > 2:4154005/1‑100 (MQ=255) cTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAg < 1:2260435/100‑1 (MQ=255) cTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAg > 1:1356464/1‑100 (MQ=255) tttAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGc > 1:524948/1‑100 (MQ=255) tttAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGc < 1:4096988/100‑1 (MQ=255) ttAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGcc > 2:1090720/1‑100 (MQ=255) ttAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGcc > 1:3633087/1‑100 (MQ=255) ttAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGcc < 1:3026179/100‑1 (MQ=255) ttAACACCGAATGGTCTACCGAGTATACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGcc < 2:180208/100‑1 (MQ=255) taccaacGAATGGTCTACCGAGTTTATCCTGTCTAGAGCCGGCGATTATTAAGTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTGCCAGCCt < 2:2170360/94‑1 (MQ=255) tAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCt < 1:2107619/100‑1 (MQ=255) aaCACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAGTACCTCAAAGCCTGGTTTACCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCtt > 2:134880/1‑100 (MQ=255) aaCACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCtt > 2:2005162/1‑100 (MQ=255) acacCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTc < 2:3419540/100‑1 (MQ=255) cacCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCt > 1:2166831/1‑100 (MQ=255) acCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTg < 2:3356442/100‑1 (MQ=255) gAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGAtt > 1:1981443/1‑100 (MQ=255) gAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGAtt > 1:2788060/1‑100 (MQ=255) aTGGTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTcc < 2:2293825/100‑1 (MQ=255) ggTCTACCGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCgg < 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cTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTaa > 1:1947529/1‑100 (MQ=255) ccGAGTTTACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATc > 2:1198869/1‑100 (MQ=255) cGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCg > 1:3916330/1‑100 (MQ=255) ttACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGGAAATCGTTCAt < 2:3197538/100‑1 (MQ=255) tACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATc > 2:3053314/1‑100 (MQ=255) tACCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATc < 1:1485546/100‑1 (MQ=255) tACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATc > 1:1654844/1‑100 (MQ=255) aCCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCt < 1:185451/100‑1 (MQ=255) aCCCTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCt < 1:1104660/100‑1 (MQ=255) cccTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCtt < 1:1330882/100‑1 (MQ=255) cccTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCtt > 1:2548491/1‑100 (MQ=255) cccTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCtt < 2:2602457/100‑1 (MQ=255) cccTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCtt > 1:873395/1‑100 (MQ=255) cccTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGGTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCt > 2:148747/1‑99 (MQ=255) ccTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCttt < 1:1266198/100‑1 (MQ=255) ccTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCttt < 2:1028374/100‑1 (MQ=255) cTGTTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCTTTa > 2:142858/1‑100 (MQ=255) gCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCTTTAat < 2:330024/100‑1 (MQ=255) cTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCTTTAata < 1:4078581/100‑1 (MQ=255) | AACCGTCCAAATTCTTGACCGCCTGGAGCTGGAAAAGCCCTGTATCGATGCCGAAGACGAGTGCTTTAACACCGAATGGTCTACCGAGTTTACCCTGCTTAAAGCCTGGGATGAATACCTCAAAGCCTGGTTTGCCCTGCACCTTCTCGAAGCGATGTTCCAGCCTTCTGATTCCGGTAAATCGTTCATCTTTAATA > NC_000913/3016308‑3016504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |