| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,594,073 | G→T | 16.6% | T45N (ACC→AAC) | livG ← | branched‑chain amino acid ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,594,073 | 0 | G | T | 16.6% | 465.7 / 73.9 | 179 | T45N (ACC→AAC) | livG | branched‑chain amino acid ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (68/81); new base T (11/19); total (79/100) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
CAATTTGCTGCCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCCAGCAGGCCGCCGAAGCGCATCA > NC_000913/3593975‑3594172 | cAATTTGCTGCCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGt < 1:1264155/100‑1 (MQ=255) tgctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGttttt < 2:2770280/99‑1 (MQ=255) tgctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTc > 2:418450/1‑100 (MQ=255) tgctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTc > 1:1828427/1‑100 (MQ=255) gctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTcc < 1:192551/100‑1 (MQ=255) gctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTcc < 1:3032426/100‑1 (MQ=255) gctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTcc > 1:2711950/1‑100 (MQ=255) ctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCg < 1:102220/100‑1 (MQ=255) ctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCg < 1:101546/100‑1 (MQ=255) ctgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCg < 1:2363899/100‑1 (MQ=255) tgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTcn < 2:727431/98‑2 (MQ=255) tgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCgg < 1:7752/100‑1 (MQ=255) tgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCgg > 1:2073986/1‑100 (MQ=255) tgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCg < 2:3857260/99‑1 (MQ=255) tgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCACGGtttttaact < 2:1796731/100‑5 (MQ=255) tgcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCAGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCgg > 2:547856/1‑100 (MQ=255) taccccGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCgg < 1:709793/98‑1 (MQ=255) ggcccGGTAAACCATCCAGGTGCTGATCGCGAAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGc > 1:2808210/3‑100 (MQ=255) gcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAACATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGc > 2:3259562/1‑100 (MQ=255) gcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGc > 2:264487/1‑100 (MQ=255) gcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCACGGtttttaactg < 1:1167739/100‑6 (MQ=255) gcCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATAGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCACGGtttttaactg < 1:3887284/100‑6 (MQ=255) ccccGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCa > 1:1345462/1‑100 (MQ=255) ccccGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCCGCGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGCTTTTCCGGc > 2:1123195/1‑99 (MQ=255) ccccGGTAAACCGTCCAGGTGCTGTTCGGGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAACCCACGGtttttaact < 2:300965/98‑5 (MQ=255) ccccGGGAAACCTTCCAGGGGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCa < 1:600307/100‑1 (MQ=255) tAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTa < 1:2410531/100‑1 (MQ=255) aaaCCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAg > 2:457130/1‑100 (MQ=255) aaaCCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGGCAGCCAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCAcc > 2:1636158/1‑95 (MQ=255) aaaCCTTCCAGGTCCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCAGTGGGTTTGTAGAATCCGATCACACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCTTTAg > 2:2574654/1‑100 (MQ=255) aCCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAggg < 2:1283612/100‑1 (MQ=255) ccTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAggg < 1:409363/99‑1 (MQ=255) ccTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGc < 2:2300989/100‑1 (MQ=255) gatCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGGATCCGGTCAGAAAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAg > 2:240737/3‑96 (MQ=255) ttCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCg < 2:1740146/100‑1 (MQ=255) tCCGGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAAACCGGTCAGACAGGTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCGCCGTTAAGGc < 2:3209213/97‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGAtt < 1:4160348/100‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGAtt > 1:3321343/1‑100 (MQ=255) aGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGCGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTa < 1:2932034/100‑1 (MQ=255) tGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACg < 1:3029282/100‑1 (MQ=255) tGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACg < 1:1753016/100‑1 (MQ=255) gCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACga < 2:51830/100‑1 (MQ=255) cTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACgag < 1:2481117/100‑1 (MQ=255) cTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACgag < 1:3448244/100‑1 (MQ=255) tgctCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACgaga > 2:2854991/4‑100 (MQ=255) tGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACGGTTAGGGCCGATTAACgaga > 2:3099255/1‑100 (MQ=255) tGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACgaga > 2:905528/1‑100 (MQ=255) tGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACgaga > 1:2405382/1‑100 (MQ=255) tGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACgaga > 1:2155770/1‑100 (MQ=255) gATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGAc > 1:4173351/1‑100 (MQ=255) aTCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACg > 2:731433/1‑100 (MQ=255) aTCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACg < 2:3415172/100‑1 (MQ=255) cgcgCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGAt > 1:1505946/1‑100 (MQ=255) gcgcAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGAtc < 1:457133/100‑1 (MQ=255) aGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCt < 2:1673565/100‑1 (MQ=255) aGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCt > 1:1336287/1‑100 (MQ=255) aaaTGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCgg < 2:540362/100‑1 (MQ=255) aaaTGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCgg > 2:3895088/1‑100 (MQ=255) aaTGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTAAGACAGTTAAAAACCGCGGTTTTTCCGGCACCGCTAGGGCCGATTAGCGAGACGCTCTGCTGCgg > 2:1184419/1‑99 (MQ=255) tGGTGCCGCCGGTGGGATTCTAGAATACGGTCAGACAGTTAAAAACCGTTGTTTATCCGGCAACGATAGGGACGAATAACGAGACGATCCCCGGCgcg > 2:390361/1‑96 (MQ=255) ggTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTAc < 2:182624/100‑1 (MQ=255) gTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACa < 2:3552297/100‑1 (MQ=255) tGCCGCCGGTGTGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAg < 2:360516/100‑1 (MQ=255) tGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGTCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAg > 2:3326458/1‑100 (MQ=255) gccgGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGGACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGtt < 2:1216873/98‑1 (MQ=255) gccgGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCa < 1:223085/100‑1 (MQ=255) gccgGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCa > 1:1695581/1‑100 (MQ=255) ccgGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCaa < 2:1941295/100‑1 (MQ=255) ccgGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCaa < 1:3580399/100‑1 (MQ=255) ggTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAGCGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAg < 2:2072520/99‑1 (MQ=255) ggTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGa < 1:1578077/100‑1 (MQ=255) gggTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTg < 2:567466/100‑1 (MQ=255) gggTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTg < 2:3268208/100‑1 (MQ=255) gTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGAc > 1:3226110/1‑100 (MQ=255) gTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGAc > 1:836790/1‑100 (MQ=255) tttGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTGCCGGCACCGTTAGGGTCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACg < 2:1428524/100‑1 (MQ=255) tGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACgtt > 1:2669984/1‑100 (MQ=255) gTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACgttg < 1:2027740/100‑1 (MQ=255) gAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTc < 2:2692333/100‑1 (MQ=255) gAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTc < 1:2459661/100‑1 (MQ=255) aaTCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCa < 2:1920796/100‑1 (MQ=255) aTCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCAc > 1:3595724/1‑100 (MQ=255) aTCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCAc > 1:1368692/1‑100 (MQ=255) tCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCAcc < 1:340043/100‑1 (MQ=255) tCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCAcc > 2:3977424/1‑100 (MQ=255) ccGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCaaga > 2:2235330/1‑97 (MQ=255) cGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGc > 1:3139332/1‑100 (MQ=255) cGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGc > 1:687593/1‑100 (MQ=255) ggTCAGACAGTTAAAAACCGTGTTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGcc < 2:2779250/100‑1 (MQ=255) ggTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGcc > 1:545489/1‑100 (MQ=255) gTCAGACAGTTAAACACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTCCAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCca < 2:2669968/100‑1 (MQ=255) cAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCcagc < 1:3067378/100‑1 (MQ=255) cAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCcagc < 2:3065368/100‑1 (MQ=255) cAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCcagc > 1:1405292/1‑100 (MQ=255) aCAGTGAAGAGCCGTGGTTTTGCCGGTACCGTTAGGGCCGATTAGCGAAACGATCTCCTGCTGGTACAGTTCAACATTGACGCTGTTCACCGCcagc < 2:2479262/97‑1 (MQ=255) gccggaaaaaCCACGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCCAGCAGgc > 1:2186254/6‑100 (MQ=255) cAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCCAGCAGgc < 1:3860845/100‑1 (MQ=255) gTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCCAGCAGgccg > 1:2332702/1‑100 (MQ=255) gTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCCAGCAGgccg > 1:1154502/1‑100 (MQ=255) ttAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCCAGCAGgccgc < 2:100203/100‑1 (MQ=255) | CAATTTGCTGCCCCGGTAAACCTTCCAGGTGCTGATCGCGCAGTAAAATGGTGCCGCCGGTGGGTTTGTAGAATCCGGTCAGACAGTTAAAAACCGTGGTTTTTCCGGCACCGTTAGGGCCGATTAACGAGACGATCTCCTGCGGGTACAGTTCAAGATTGACGTTGTTCACCGCCAGCAGGCCGCCGAAGCGCATCA > NC_000913/3593975‑3594172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |