Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 545,486 | A→C | 76.3% | I293S (ATT→AGT) | allD ← | ureidoglycolate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 545,486 | 0 | A | C | 76.3% | 272.1 / 87.6 | 142 | I293S (ATT→AGT) | allD | ureidoglycolate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (19/15); new base C (47/61); total (66/76) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.66e-01 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CATCAACAATTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGTAATTGCCCCA > NC_000913/545388‑545582 | catcaACAATTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAAt < 1:2273682/100‑1 (MQ=255) atcaACAATTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTg > 2:668719/1‑100 (MQ=255) atcaACAATTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTg < 1:1785729/100‑1 (MQ=255) tcaACAATTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTgg < 2:3091483/100‑1 (MQ=255) caacaaTTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGc > 2:3851717/1‑100 (MQ=255) aacaaTTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCa > 1:2627497/1‑100 (MQ=255) aacaaTTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCa < 2:3856056/100‑1 (MQ=255) aacaaTTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAAGATCCTGATCCTGTCCGGGACAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCa > 2:2272085/1‑100 (MQ=255) caaTTTCGATGCCTTCGACGGGGGCTTTGCGTTGTTTAATTTCCTGATCCTGGCCGGGATAAGAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCAtt < 2:3783429/100‑1 (MQ=255) caaTTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCAtt > 1:91354/1‑100 (MQ=255) tttCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTaa < 2:1912809/100‑1 (MQ=255) gATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTcg > 1:1870038/1‑100 (MQ=255) tGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTcgcg < 1:1419192/100‑1 (MQ=255) tGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTcgcg < 1:2501106/100‑1 (MQ=255) cTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTATCCGGGATATTAAACCTGATTAAAACCGCGCGTGGTGGTAATGGCATATAATTCGCGGAt > 2:675231/1‑100 (MQ=255) ttCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTGATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATg < 1:1022836/100‑1 (MQ=255) ttCAACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTACTTCGCGCa < 2:3884869/98‑1 (MQ=255) tCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATgg < 1:854199/100‑1 (MQ=255) gACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTc < 1:1142316/100‑1 (MQ=255) gcggcTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAACCCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGc < 1:828484/100‑1 (MQ=255) gcggcTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGc < 2:3032272/100‑1 (MQ=255) gcggcTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGc > 1:2437345/1‑100 (MQ=255) ggcTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTa < 2:322389/100‑1 (MQ=255) ggcTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTa < 1:1356547/100‑1 (MQ=255) gcTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTa < 2:1952631/99‑1 (MQ=255) tGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATg > 1:2567083/1‑100 (MQ=255) cGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATACGCGAATGGTCTGGCTAAGATGtt > 2:3587439/1‑100 (MQ=255) gttgttTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTg < 1:992170/100‑1 (MQ=255) gttgttTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTg > 1:755658/1‑100 (MQ=255) tgttTAACATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGAc > 2:2178960/1‑100 (MQ=255) gttTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGa > 1:1229954/1‑98 (MQ=255) gttTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACg > 1:278162/1‑100 (MQ=255) gttTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACg > 2:1327999/1‑100 (MQ=255) tttAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAGTTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACgg < 1:1430208/100‑1 (MQ=255) tttAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACgg > 2:4103647/1‑100 (MQ=255) ttAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGa > 2:666645/1‑100 (MQ=255) ttAATAACCTGATGCTGTCCGGGATAAGAAACCTGATTAAAACCGGGGGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGGCTGGCTAAGATGTTGACgg < 2:110003/99‑1 (MQ=255) aaTATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGaat > 2:3352099/1‑100 (MQ=255) atatCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGaata > 2:2355970/1‑100 (MQ=255) tatCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGaataa > 1:2092339/1‑100 (MQ=255) tcctgatcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAAtt < 1:3374349/100‑1 (MQ=255) cctgatcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTc < 2:2171170/100‑1 (MQ=255) cctgagcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAAtt < 2:1854904/99‑1 (MQ=255) ctgatcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCg < 2:2022715/100‑1 (MQ=255) ctgatcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCg < 1:3538211/100‑1 (MQ=255) tgatcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGc < 1:1253388/100‑1 (MQ=255) tgatcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGc > 1:148656/1‑100 (MQ=255) tgatcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGc < 2:2822650/100‑1 (MQ=255) atcctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTg > 2:1575602/1‑100 (MQ=255) cctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTgga < 1:2737664/100‑1 (MQ=255) cctgTCAGTGATAATAAAGCTGATTCAATATGGTCGGGGCTGTGCTGGCATTAAATTCACGCATGGTCTCGCTAAGATGTTGTCGGAATAATTCGCTgga < 2:929226/100‑1 (MQ=255) ctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTggag < 1:2303439/100‑1 (MQ=255) ctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTggag < 1:338523/100‑1 (MQ=255) ctgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTggag > 1:247675/1‑100 (MQ=255) tgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTggagg < 1:1331590/100‑1 (MQ=255) tgTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGGCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTggagg < 2:1586355/100‑1 (MQ=255) ccGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGgaga < 2:3887261/100‑1 (MQ=255) taataaACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGt > 1:1010382/1‑100 (MQ=255) ataaACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTc > 2:1894713/1‑100 (MQ=255) ataaACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTc < 1:2265332/100‑1 (MQ=255) taaACGTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCg < 1:545442/100‑1 (MQ=255) taaACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCg < 2:496233/100‑1 (MQ=255) taaACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCg < 1:3448494/100‑1 (MQ=255) taaACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCg < 1:1951183/100‑1 (MQ=255) aaaCCTGCTTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGGTGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCgg > 2:521189/1‑100 (MQ=255) aaaCCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCgg < 1:3625350/100‑1 (MQ=255) aaCCTGATTAAAGCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCTCGCATGGACGGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGa < 2:352132/100‑1 (MQ=255) aaCCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGa < 1:3972074/100‑1 (MQ=255) aaCCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGa > 1:495747/1‑100 (MQ=255) aaCCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGa > 1:3730506/1‑100 (MQ=255) aCCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGAt < 1:3100250/100‑1 (MQ=255) aCCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGAt < 1:2765551/100‑1 (MQ=255) ccTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGAtt > 1:431681/1‑100 (MQ=255) ccTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGAtt > 1:2634859/1‑100 (MQ=255) gATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATtaat < 1:2723666/100‑1 (MQ=255) gATTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATtaat > 1:770461/1‑100 (MQ=255) aTTAACACCGGGCGCGGGGTTACTGTCATGGAATTCGCGCAGGGTCTGGAGAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGAtt < 2:4153894/96‑1 (MQ=255) aTTAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTTATTCGCGCATGGGCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATtaata < 2:2811802/100‑1 (MQ=255) ttAAAACCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATtaataa > 2:2938326/1‑100 (MQ=255) aaaaCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGCTGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACt > 2:3280067/1‑100 (MQ=255) aaaaCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACt < 1:533121/100‑1 (MQ=255) aaaCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACta > 2:1046755/1‑100 (MQ=255) aaaCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACta > 2:690149/1‑100 (MQ=255) aaCCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACt < 2:1518967/98‑1 (MQ=255) aCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACtata < 2:148654/100‑1 (MQ=255) aCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACtata > 1:3890201/1‑100 (MQ=255) aCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACtata > 2:788991/1‑100 (MQ=255) aCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACtata > 1:2934325/1‑100 (MQ=255) aCCGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACtata < 1:263184/100‑1 (MQ=255) ccGGGCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACTatat > 1:3203875/1‑100 (MQ=255) cGGGCGCGGGGATACTGGCATTTAATTCGCTCATTGTATGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCTCTGGAGGAGAAAAAGTTCCAATTACTAACTATATg < 2:3538731/100‑1 (MQ=255) gggCGGAGGGGTACTGGCATTTAATTCGAGAATGGTAAGGCTAAGATGTTGTCGTAATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAGTTCGGATTAATAACTatat < 2:430088/98‑1 (MQ=255) gggCGCGGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGt < 1:3758436/100‑1 (MQ=255) cgcgGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGTAAt < 2:350431/100‑1 (MQ=255) gcgGGGGTTATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAGTTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGGTTAATAACGATATGTAAt < 2:2913868/99‑1 (MQ=255) gcgGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTAGGGATAAGATGTTGGCTGAATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGTAAt < 2:2649348/99‑1 (MQ=255) cgGGGGTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGTAATTg < 1:566147/100‑1 (MQ=255) gggTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGTAATTGccc < 2:1490257/100‑1 (MQ=255) gTACTGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGTAATTGCCCCa < 2:1264250/100‑1 (MQ=255) aaTGGAATATAATTAGCGAAAGGACAAGCTAAGATGTTGACGTAATAATTAAAAAAAAAAAAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGTAATTGccc < 2:1103021/96‑1 (MQ=255) | CATCAACAATTTCGATGCCTTCGACGGCGGCTTTGCGTTGTTTAATATCCTGATCCTGTCCGGGATAATAAACCTGATTAAAACCGGGCGCGGGGGTAATGGCATTTAATTCGCGCATGGTCTGGCTAAGATGTTGACGGAATAATTCGCTGGAGGAGAAAAAGTTCGGATTAATAACTATATGTAATTGCCCCA > NC_000913/545388‑545582 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |