| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,310,728 | T→C | 78.6% | I85V (ATT→GTT) | alsA ← | D‑allose ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,310,728 | 0 | T | C | 78.6% | 412.7 / 103.2 | 205 | I85V (ATT→GTT) | alsA | D‑allose ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (22/22); new base C (74/85); total (98/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.41e-01 | |||||||||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
CGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCG > NC_000913/4310629‑4310825 | cGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCACTATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGataaat > 2:3367566/1‑100 (MQ=255) taataTTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAaacaat < 2:2677564/100‑1 (MQ=255) taataTTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTCTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAaacaat > 2:20391/1‑100 (MQ=255) aataTTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATc < 1:3879484/100‑1 (MQ=255) atatTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATcc < 1:2214425/100‑1 (MQ=255) tatTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATccc < 2:1866663/100‑1 (MQ=255) cGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATAcc < 1:1607249/100‑1 (MQ=255) gCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCg < 2:2147094/100‑1 (MQ=255) cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGCTTCCCTGATAAATAATCCCAATAccaa > 1:3826128/1‑97 (MQ=255) cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAg > 1:4083030/1‑100 (MQ=255) cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAg > 1:315797/1‑100 (MQ=255) acaGATTTTTTTTTTTTTTTGTCGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCgtgt > 2:1049882/1‑100 (MQ=255) acaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGt < 2:1134243/100‑1 (MQ=255) aGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATATATTTTCCATTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTACCTGACAAACAATCCCGATACCAAGtt < 2:3031216/99‑1 (MQ=255) aGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTtg > 1:1040955/1‑100 (MQ=255) aGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTtg < 1:999083/100‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTtgt > 1:3253236/1‑100 (MQ=255) tttttttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTtgtg < 2:579045/99‑1 (MQ=255) ttttttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATACCGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGcc < 1:2921700/100‑1 (MQ=255) ttttttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGcc < 1:1575588/100‑1 (MQ=255) tttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCt < 2:2338869/100‑1 (MQ=255) tttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACACTGAGTTCTTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGc > 2:4021166/1‑99 (MQ=255) gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAAtt < 1:3547538/100‑1 (MQ=255) gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAAAAATCCCGATACAGAGTTATGCCGCTAAtt > 1:2033225/1‑100 (MQ=255) tCAGATGACGACCAATGTATTTATTTTACAGTACGGTTAATTCATAAATACCACTGAGTTGGTGATAAACAATCCCGATGCCGAGTTGTGACGAGAAttt < 2:201925/100‑1 (MQ=255) aGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTAt < 1:1730071/100‑1 (MQ=255) aGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTAt < 2:795674/100‑1 (MQ=255) gATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATg < 2:163815/100‑1 (MQ=255) gATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATg > 2:1349650/1‑100 (MQ=255) gATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATg < 2:1589873/100‑1 (MQ=255) tGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGAt > 1:1775687/1‑100 (MQ=255) gacgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATc < 2:2764109/100‑1 (MQ=255) acgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATcc < 2:1296970/100‑1 (MQ=255) acgacCAATATATAAATTTTCCAGTACAGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATcc < 2:2544495/100‑1 (MQ=255) cgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCa < 1:1761875/100‑1 (MQ=255) cgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAAGCCCGATACCGATTTGTGCCGCTAATTTATGATCCa > 2:1802543/1‑100 (MQ=255) acCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGc > 2:448182/1‑100 (MQ=255) ccAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCt < 2:1820951/100‑1 (MQ=255) ccAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCTCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCt > 2:1911206/1‑100 (MQ=255) ccAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCt < 2:694174/100‑1 (MQ=255) cAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATGCCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCtt > 2:3570171/1‑100 (MQ=255) atatatAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGt < 2:1953583/100‑1 (MQ=255) atataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTta > 2:3130383/1‑100 (MQ=255) tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 1:1944160/1‑100 (MQ=255) tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat < 2:240330/100‑1 (MQ=255) tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 1:2302129/1‑100 (MQ=255) tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 1:1169540/1‑100 (MQ=255) tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 1:3528532/1‑100 (MQ=255) ataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtata < 2:928435/100‑1 (MQ=255) ataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtata > 2:116556/1‑100 (MQ=255) taAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAg > 1:2867484/1‑100 (MQ=255) aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc < 2:4064661/100‑1 (MQ=255) aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc < 1:57751/100‑1 (MQ=255) ccAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtt > 1:1990250/1‑100 (MQ=255) cAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtta < 1:708095/100‑1 (MQ=255) cAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtta > 2:515389/1‑100 (MQ=255) gTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttatt < 2:3670229/100‑1 (MQ=255) gTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttatt > 1:2535668/1‑100 (MQ=255) aCGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaa > 2:2114204/1‑100 (MQ=255) aCGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaa < 1:781160/100‑1 (MQ=255) cGGTTAATNCATCAATAACGCTGCGTNCATGNTANACAATCCCGATACCGAGTTGTGGCGCTATTTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTNATtcat > 1:3379483/1‑100 (MQ=255) ggTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatg > 2:242833/1‑100 (MQ=255) gTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatgg > 1:1372027/1‑100 (MQ=255) ttAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggt < 2:1144533/100‑1 (MQ=255) tAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACATTCCCGATACCGAGTTGTGCAGCTAATTTAAGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggta < 2:2271443/100‑1 (MQ=255) aaTTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTACAGCTAATGTTATtaatgctaa > 2:15186/1‑100 (MQ=255) ttCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatg > 1:813337/1‑100 (MQ=255) ttCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatg < 2:383099/100‑1 (MQ=255) ttCATCAANAACGCTGAGTTCCTGATNAATANTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtagtngtaatg > 1:3423322/1‑100 (MQ=255) catcaATAACGCTGAGTTCCTGATACATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatgg > 2:841061/1‑99 (MQ=255) catcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTaatggtaatggt < 1:106184/100‑1 (MQ=255) catcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCAGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTCTtaatggtaatgg > 2:3327957/1‑99 (MQ=255) atcaATACCGCAGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTg > 2:2188541/1‑100 (MQ=255) atcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTg > 1:2597325/1‑100 (MQ=255) tcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGc > 1:420191/1‑100 (MQ=255) tcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTCTAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGc > 2:3038518/1‑100 (MQ=255) caATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGcc > 2:2788372/1‑100 (MQ=255) caATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATAATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGcc > 2:4170744/1‑100 (MQ=255) aaTAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCt > 2:3053893/1‑100 (MQ=255) aTAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCtt > 1:3616247/1‑100 (MQ=255) tAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCttt < 2:1852653/100‑1 (MQ=255) aCGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTgg < 2:3905146/100‑1 (MQ=255) cTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTc < 1:1189592/99‑1 (MQ=255) cTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCg < 2:2361755/100‑1 (MQ=255) cTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCg < 1:1668827/100‑1 (MQ=255) gAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGTCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 2:226067/100‑1 (MQ=255) gAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 2:3264389/100‑1 (MQ=255) gAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 1:2059851/100‑1 (MQ=255) gTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTc > 1:2451249/1‑100 (MQ=255) ccTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:1105963/100‑1 (MQ=255) ccTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 2:2973496/100‑1 (MQ=255) cTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt < 1:3947572/100‑1 (MQ=255) cTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt > 2:3342245/1‑100 (MQ=255) cTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt > 2:3155744/1‑100 (MQ=255) cTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt < 1:2707386/100‑1 (MQ=255) tGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTa < 2:740147/100‑1 (MQ=255) gATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAt > 1:461640/1‑100 (MQ=255) gATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAt > 2:2578065/1‑100 (MQ=255) taaataaTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAtt > 2:3220665/1‑99 (MQ=255) aataatCCCGATACCGTGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCg < 1:1022740/100‑1 (MQ=255) | CGATAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCG > NC_000913/4310629‑4310825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |