| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,035,846 | C→A | 15.2% | A26E (GCG→GAG) | hyaD → | hydrogenase 1 maturation protease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,035,846 | 0 | C | A | 15.2% | 329.0 / 36.1 | 121 | A26E (GCG→GAG) | hyaD | hydrogenase 1 maturation protease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (49/52); new base A (8/11); total (58/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
AAAATAAGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCGAAAGCGCCAG > NC_000913/1035747‑1035945 | aaaaTAAGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGc > 1:330323/1‑100 (MQ=255) aaGTGACAAGGAGCGTTCATGAGCGCGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCGGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCgg < 2:404735/97‑1 (MQ=255) aGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACg > 1:176012/1‑100 (MQ=255) gTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACgg > 1:507304/1‑100 (MQ=255) gTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACgg > 2:81852/1‑100 (MQ=255) aaCAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTAATGGGGCTGGGCAACATGCTGTCGGCCGATGAAGCCTGCGGCCTGCGGTTGGCTGAACGGCt > 2:853975/1‑100 (MQ=255) aCAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCGGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGGGGGTGAGCGGcgg > 1:1230999/1‑98 (MQ=255) aCAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTg < 2:3226305/100‑1 (MQ=255) cAAGGATCGTTCATGAGCGAGCAACGCGAGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTg < 1:2946756/99‑1 (MQ=255) cAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTg > 1:1834223/1‑99 (MQ=255) aaGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTa < 1:3455139/100‑1 (MQ=255) aaGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTa < 1:3977341/100‑1 (MQ=255) aGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTAt < 1:2490692/100‑1 (MQ=255) gCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGccc > 1:2988276/1‑100 (MQ=255) gCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGccc > 1:915525/1‑100 (MQ=255) cGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCa < 1:3126622/100‑1 (MQ=255) cATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTa > 1:3134285/1‑99 (MQ=255) aTGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTAcc > 1:81814/1‑100 (MQ=255) aTGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTAcc < 2:3596633/100‑1 (MQ=255) aTGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTAcc < 2:2296571/100‑1 (MQ=255) gagcgagcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCAc > 2:4050138/1‑100 (MQ=255) gcgagcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTg > 1:1451307/1‑100 (MQ=255) gcgagcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTg < 2:1115631/100‑1 (MQ=255) cgagcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTgg > 1:2320193/1‑100 (MQ=255) gagcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGc > 2:1408570/1‑100 (MQ=255) gagcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGc > 2:1716321/1‑100 (MQ=255) agcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGcn < 1:4114543/100‑2 (MQ=255) agcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGcc < 1:1468476/100‑1 (MQ=255) agcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGcc > 1:1290977/1‑100 (MQ=255) gcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAGCCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGccc < 2:1206431/100‑1 (MQ=255) gcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGccc > 1:2299139/1‑100 (MQ=255) gcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGccc > 1:61548/1‑100 (MQ=255) gcAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGccc > 2:1257236/1‑100 (MQ=255) aaagcgTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACATGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCAGTACCACTGGCCCg < 2:1802605/96‑1 (MQ=255) acacgTGGTGGTCATGGGGATGGGCAACCTGATTTGGTCCGGTGGAGGCTTCGGCTTGCGTGTAGCGGGACGGCGGTATGCCCATTACCACTGGcccta > 2:3479565/4‑97 (MQ=255) aCGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAg < 1:1476956/100‑1 (MQ=255) cgcgTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGt < 1:956546/100‑1 (MQ=255) gcgTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTa < 2:1160930/100‑1 (MQ=255) gcgTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTa > 1:4009326/1‑100 (MQ=255) cgTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTAt > 1:736995/1‑100 (MQ=255) tggtggTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTAtgt > 1:1598154/1‑100 (MQ=255) ggtggtCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTAtgtg < 1:475500/100‑1 (MQ=255) ggtggtCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTAtgt > 1:4164694/1‑99 (MQ=255) gtggtCATGGGGCTGGGCAGCCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTgg < 2:1465597/100‑1 (MQ=255) gtggtCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTgg < 1:250040/100‑1 (MQ=255) tggtCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGga < 1:2651926/100‑1 (MQ=255) tggtCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGga < 1:2596688/100‑1 (MQ=255) ggtCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGgag > 2:2122475/1‑100 (MQ=255) ggtCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGgag > 1:1815497/1‑100 (MQ=255) cATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGCGTATGGGGGGAt > 2:3030665/1‑99 (MQ=255) cATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGAtt > 1:1593831/1‑100 (MQ=255) cATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGAtt > 2:1405866/1‑100 (MQ=255) tGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGt > 2:2290608/1‑100 (MQ=255) ggggCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTc < 1:276705/100‑1 (MQ=255) ggggCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTc < 2:115342/100‑1 (MQ=255) gggCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCg < 2:1044360/100‑1 (MQ=255) gggCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCg > 1:982382/1‑100 (MQ=255) gggCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGc < 2:3500515/100‑1 (MQ=255) gggCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGc < 1:1060040/100‑1 (MQ=255) gggCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGc > 2:4162967/1‑100 (MQ=255) gCAACCTGCTGTGGGCCGCAGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCGCGCGTAGGTGGAGATTGTCGATGGCgg > 2:3973899/1‑100 (MQ=255) gCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCgg < 1:1682501/100‑1 (MQ=255) gCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCgg > 2:2712642/1‑100 (MQ=255) gCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCgg < 1:4061119/100‑1 (MQ=255) cAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCAGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGt > 2:1174270/1‑100 (MQ=255) atccTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCgg < 2:3876074/96‑1 (MQ=255) aaCCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGGGTATGTGGAGATTGTCGAAGGCAGTa > 2:1317819/1‑100 (MQ=255) aCCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTAc < 1:3317685/100‑1 (MQ=255) ctgctgTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTc > 1:1026155/1‑100 (MQ=255) tgctgTGGGCCGATGTAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTGCTc > 1:2851048/1‑99 (MQ=255) tgctgTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCa < 1:296101/100‑1 (MQ=255) tgctgTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCa < 1:4056672/100‑1 (MQ=255) tgtgGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCGCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAggg > 2:3205945/1‑100 (MQ=255) cgtgGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGGGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGGACTCAggg > 1:1620472/2‑100 (MQ=255) gtgGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGa > 1:1044434/1‑100 (MQ=255) tgGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGAc < 1:2855708/100‑1 (MQ=255) gggCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACt > 2:276939/1‑100 (MQ=255) ccGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGaa < 2:4083296/100‑1 (MQ=255) cGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGTACTGAAc < 2:736991/100‑1 (MQ=255) gATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACt < 1:1408578/100‑1 (MQ=255) gAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTg < 1:4163001/99‑1 (MQ=255) ggCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCTCTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTgn < 2:2660366/100‑2 (MQ=255) ggCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTgg < 1:433450/100‑1 (MQ=255) cTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTgggg < 1:4081253/100‑1 (MQ=255) cTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTgggg > 1:1806800/1‑100 (MQ=255) tCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTa < 1:3818631/100‑1 (MQ=255) tCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTa > 2:391008/1‑100 (MQ=255) cGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTc < 2:4009296/100‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTATCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCg < 1:2957116/100‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCg < 1:195949/100‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCg > 1:2198474/1‑100 (MQ=255) gTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCg < 1:609223/100‑1 (MQ=255) gTGCGGGTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCg < 2:3942228/100‑1 (MQ=255) tGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTc > 2:574717/1‑98 (MQ=255) tGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCGa > 1:2603551/1‑100 (MQ=255) gggTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCGAAAg < 1:3748968/100‑1 (MQ=255) gggTGGAGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCGAAAg < 1:2371741/100‑1 (MQ=255) ggTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCGAAAgc > 1:2871464/1‑100 (MQ=255) gTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCGAAAgcg > 2:3012626/1‑100 (MQ=255) cGGAACGGCTGTATGACCATTACCACTGGACCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGCGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCGAAAGCgccag < 2:2000341/100‑1 (MQ=255) | AAAATAAGTAACAAGGAGCGTTCATGAGCGAGCAACGCGTGGTGGTCATGGGGCTGGGCAACCTGCTGTGGGCCGATGAAGGCTTCGGCGTGCGGGTGGCGGAACGGCTGTATGCCCATTACCACTGGCCCGAGTATGTGGAGATTGTCGATGGCGGTACTCAGGGACTGAACTTGCTGGGGTATGTCGAAAGCGCCAG > NC_000913/1035747‑1035945 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |