| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,515,267 | A→T | 73.7% | D169V (GAT→GTT) | ydcV → | putative ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,515,267 | 0 | A | T | 73.7% | 204.2 / 93.1 | 130 | D169V (GAT→GTT) | ydcV | putative ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (19/15); new base T (57/38); total (76/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.48e-01 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TCGTGGTCGGTCATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTC > NC_000913/1515168‑1515363 | tCGTGGTCGGTCATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGa < 2:2408134/100‑1 (MQ=255) tcggtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTgg > 2:2723243/1‑100 (MQ=255) ggtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTTGTTGAGGCGTCAATGGATCTTgggg < 1:1939396/100‑1 (MQ=255) ggtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTgggg < 1:1047529/100‑1 (MQ=255) gtcATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGc < 1:892814/100‑1 (MQ=255) cATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCa > 1:3727455/1‑100 (MQ=255) cATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCa > 2:529604/1‑100 (MQ=255) aTGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCaa > 2:2364858/1‑100 (MQ=255) tGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAAt > 2:865452/1‑100 (MQ=255) tGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCaa > 2:3900580/1‑99 (MQ=255) gCGAGTTTTTGTGTAGTTGTGGTTTTGAACTTTGTCGTTGCGCGTTTGCGTCGCACCTCCTGCAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCaa < 2:3633337/98‑1 (MQ=255) gtcTTTTTGTGTAATTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGATTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAAtggc > 1:2821393/3‑100 (MQ=255) gACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAAtggc > 2:3598802/1‑100 (MQ=255) gACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAAtggc > 2:3093603/1‑100 (MQ=255) gACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAAtggc < 1:476945/100‑1 (MQ=255) cTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAAtggctg > 1:2157875/1‑100 (MQ=255) cTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAAtggctg < 2:2799345/100‑1 (MQ=255) tttttGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAAtggctgg > 1:4083740/1‑100 (MQ=255) ttGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCaa > 1:1906123/1‑100 (MQ=255) gtgtAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAAc > 1:3887747/1‑100 (MQ=255) gtgtAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAAc > 1:2848755/1‑100 (MQ=255) gtAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCt > 1:1185099/1‑100 (MQ=255) tAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCtt < 1:1439613/100‑1 (MQ=255) aGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTc > 1:3722920/1‑100 (MQ=255) gTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTcc < 1:1018344/100‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCg < 1:137107/100‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGc < 1:789908/100‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTAACAATGTCATCACCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGc < 1:3843350/100‑1 (MQ=255) gtggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGCGGCCAATAGCTGGCAAACCTTCCGCt > 2:3880907/1‑100 (MQ=255) tggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTa > 2:1818668/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTAc > 2:3459023/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTAc > 1:3759936/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTAc > 2:3413271/1‑100 (MQ=255) ggtgTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGGTGAGGCGTCAATGGTTCTTCGGGCCAATGGCTGGCAGACCTTCCGCTAc > 2:1922951/1‑100 (MQ=255) gtgtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACg > 1:1953838/1‑100 (MQ=255) gtgtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACg > 1:429826/1‑100 (MQ=255) gtTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCGGGTTGAGGTGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAATCCTTCCGCTACGt < 1:2403983/99‑1 (MQ=255) ttAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgt > 1:1601402/1‑100 (MQ=255) tAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgtg > 2:3345459/1‑100 (MQ=255) tAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgtg > 1:400497/1‑100 (MQ=255) tAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgtg > 1:416653/1‑100 (MQ=255) aaCAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCCATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgtgt > 2:1428816/1‑100 (MQ=255) aaCAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAgtgt < 1:649882/100‑1 (MQ=255) cAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTg > 1:3029425/1‑100 (MQ=255) aaTGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGc > 2:1223471/1‑100 (MQ=255) aTGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGcc > 1:1084244/1‑100 (MQ=255) tCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGaa < 1:1609840/100‑1 (MQ=255) cATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAt > 2:1696670/1‑100 (MQ=255) tCGCCCGTGTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAtct < 2:1116962/100‑1 (MQ=255) cGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGACGTCAATGGTACTTGGGGCAAATGACTGGCAAACCATCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAtctc > 2:3533142/1‑100 (MQ=255) gCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAAtctc > 1:2413323/1‑99 (MQ=255) gCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCa > 2:3488260/1‑100 (MQ=255) cccGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAg > 1:2981796/1‑100 (MQ=255) ccGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGt > 1:199336/1‑100 (MQ=255) ccGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGt > 2:3435537/1‑100 (MQ=255) ccGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGt < 2:3727428/100‑1 (MQ=255) tttCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGTCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCgg < 2:4150589/100‑1 (MQ=255) tttCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCgg > 2:729124/1‑100 (MQ=255) tCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCg < 1:2797183/100‑1 (MQ=255) tCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCg > 2:3446816/1‑100 (MQ=255) tCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCg < 1:3951353/100‑1 (MQ=255) cgccgcACCTCCTGCAGGCTGGTTGAGGCGTCAATGGTCCTTGCGGCCAATGGCTGTCAAACCTTCCGCGACGGAGTGTGGCCGAATCTCAGGTCGGc > 2:1384170/1‑98 (MQ=255) gccgcACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGtt > 1:2991141/1‑100 (MQ=255) cgcACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTAc < 1:1440995/100‑1 (MQ=255) cACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTg < 1:3983270/100‑1 (MQ=255) cACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTg < 1:3452987/100‑1 (MQ=255) cctcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGc > 1:8273/1‑100 (MQ=255) cctcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGc < 2:3722893/100‑1 (MQ=255) cctcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGc < 2:3665252/100‑1 (MQ=255) tcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCag > 2:809050/1‑100 (MQ=255) tcctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCag > 1:3127483/1‑100 (MQ=255) cctGGAGTCTTGTTGAGGCGCCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCagg < 2:2488059/100‑1 (MQ=255) cctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCagg > 2:4066524/1‑100 (MQ=255) cctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCagg > 2:4121407/1‑100 (MQ=255) cctGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCGTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCagg < 2:3534458/100‑1 (MQ=255) tGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCaggag > 2:2972247/1‑100 (MQ=255) ggAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCaggagg < 2:2533343/100‑1 (MQ=255) aGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAggagga < 2:1740180/99‑1 (MQ=255) gTCTGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAAt > 2:3989260/1‑100 (MQ=255) tGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCt < 2:3858224/100‑1 (MQ=255) tGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGCCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCt > 1:2531193/1‑100 (MQ=255) tGGTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGCCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCt > 1:2531426/1‑100 (MQ=255) tGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCt > 1:461929/1‑100 (MQ=255) ggTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTg > 2:2127786/1‑100 (MQ=255) gTTGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTgg > 2:162150/1‑100 (MQ=255) gTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTgg < 2:1906113/100‑1 (MQ=255) ttGAGGCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGc < 1:3598829/100‑1 (MQ=255) ttGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGc < 1:1320381/100‑1 (MQ=255) gAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGt < 2:3280186/100‑1 (MQ=255) aGGCGGCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAGGGCTGGCg > 2:4172794/1‑98 (MQ=255) ggCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGttt > 1:1507187/1‑100 (MQ=255) gCGTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTg < 2:2329540/100‑1 (MQ=255) cGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGt < 2:3282853/96‑1 (MQ=255) gtgaaTGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGcc < 1:1133396/97‑1 (MQ=255) gTCAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGcc > 1:2509423/1‑100 (MQ=255) gTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGcc < 1:3852899/100‑1 (MQ=255) tCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCTAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCt < 2:2591136/100‑1 (MQ=255) cAATGGTTCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCt < 1:359257/99‑1 (MQ=255) aaTGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTg > 2:2722335/1‑100 (MQ=255) tGGGTCGTGGGGCGAATGGGTGGCAAAGCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGACGCTCAGTTCGGCGTTGGGGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTg < 2:3831753/93‑1 (MQ=255) | TCGTGGTCGGTCATGCGACTTTTTGTGTAGTTGTGGTGTTTAACAATGTCATCGCCCGTTTTCGCCGCACCTCCTGGAGTCTGGTTGAGGCGTCAATGGATCTTGGGGCCAATGGCTGGCAAACCTTCCGCTACGTAGTGTTGCCGAATCTCAGTTCGGCGTTACTGGCAGGAGGAATGCTGGCGTTTGCCTTGTC > NC_000913/1515168‑1515363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |