| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,720,629 | T→C | 74.4% | T66A (ACT→GCT) | slyA ← | global transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,720,629 | 0 | T | C | 74.4% | 214.6 / 75.3 | 127 | T66A (ACT→GCT) | slyA | global transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (14/18); new base C (42/52); total (56/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
GCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCC > NC_000913/1720533‑1720724 | gCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTAc < 2:2016855/99‑1 (MQ=255)gCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACg > 1:1353676/1‑100 (MQ=255) ctctGCCTTTTCCTTCAGTTTAATACGTTTAGCCCTACGATCTCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACgg < 2:3707659/100‑1 (MQ=255) tctGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGa < 2:3393929/100‑1 (MQ=255) tGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCTAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGAcc < 1:348752/100‑1 (MQ=255) tGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAAGTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGAcc < 2:3582230/100‑1 (MQ=255) cTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTTGTCCAGAGTACGGACCAGt > 2:2970956/1‑100 (MQ=255) cTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGt > 1:2176805/1‑100 (MQ=255) ttCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGAt < 1:1160120/100‑1 (MQ=255) ccGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGCGCACGGACCAGTGATgg > 2:223731/1‑100 (MQ=255) ccGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATgg > 1:1741547/1‑100 (MQ=255) cGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGgc < 1:2499101/100‑1 (MQ=255) cAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGgctgc > 1:241482/1‑100 (MQ=255) cAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGgctgc > 2:2624684/1‑100 (MQ=255) aGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGgctgct > 2:1609460/1‑100 (MQ=255) gTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTc < 2:647898/100‑1 (MQ=255) gTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTc > 1:1236140/1‑100 (MQ=255) tttAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCg > 1:2751463/1‑100 (MQ=255) tAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCTAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGAt > 2:3229129/1‑100 (MQ=255) tAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGAt < 1:1509849/100‑1 (MQ=255) aaTACGTTTAGCGCGCCGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTGTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATg < 2:1870897/100‑1 (MQ=255) aaTACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATg > 1:541737/1‑100 (MQ=255) tACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGcc < 1:1366983/100‑1 (MQ=255) tACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTGCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGcc > 2:2659368/1‑100 (MQ=255) gTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAAt < 2:1396144/100‑1 (MQ=255) tttAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATc < 1:1217279/100‑1 (MQ=255) tAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGc < 1:638315/100‑1 (MQ=255) aGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCt < 2:706163/100‑1 (MQ=255) gCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCtt > 2:4130625/1‑100 (MQ=255) ccGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCtttt > 1:2585206/1‑100 (MQ=255) cgacgaTCGCTGGCACAAGTTTCACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCttt < 2:3095457/98‑1 (MQ=255) gacgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGc < 1:1340349/100‑1 (MQ=255) acgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGcc < 2:3729186/100‑1 (MQ=255) acgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGcc < 2:3879487/100‑1 (MQ=255) acgaTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGcc < 1:3529363/100‑1 (MQ=255) aTCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCATTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAg < 2:477044/99‑1 (MQ=255) cGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTg < 2:445054/100‑1 (MQ=255) cGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTg > 1:521261/1‑100 (MQ=255) cGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTg < 2:1000996/100‑1 (MQ=255) gCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGtt > 2:2046653/1‑98 (MQ=255) gCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTg < 2:155597/99‑1 (MQ=255) cTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGaa < 1:1495345/100‑1 (MQ=255) ggCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAAtt < 2:4008116/100‑1 (MQ=255) ggCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAAtt > 1:2468964/1‑100 (MQ=255) cacaAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTg > 1:3042619/1‑100 (MQ=255) acaAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGc < 1:3561975/100‑1 (MQ=255) acaAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGc < 1:3699430/100‑1 (MQ=255) caAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCg > 1:1084042/1‑100 (MQ=255) caAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCg < 1:505207/100‑1 (MQ=255) caAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCg < 1:857521/100‑1 (MQ=255) aGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGAc < 1:3791083/100‑1 (MQ=255) aGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGAc < 1:1731248/100‑1 (MQ=255) aGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGAc > 1:2657811/1‑100 (MQ=255) gTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACt > 1:1517452/1‑100 (MQ=255) tttGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACtn < 1:1345289/100‑2 (MQ=255) ttGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTgg < 2:3810480/100‑1 (MQ=255) tGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGt > 1:1110281/1‑100 (MQ=255) gACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTc < 2:3515719/100‑1 (MQ=255) cgcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTg > 2:2800876/1‑100 (MQ=255) cgcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTg > 2:187910/1‑100 (MQ=255) cgcgAAATTAACCCTTTCTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTg > 1:1161803/1‑100 (MQ=255) gcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTgg < 1:1554911/100‑1 (MQ=255) gcgAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTgg > 1:3453228/1‑100 (MQ=255) gAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAg > 2:1960129/1‑100 (MQ=255) aaaTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAgg < 1:3818434/100‑1 (MQ=255) aaaTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAgg < 1:3493066/100‑1 (MQ=255) aaTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGGACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAgg < 1:322870/99‑1 (MQ=255) aTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTa < 1:672143/100‑1 (MQ=255) aTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTa < 1:671915/100‑1 (MQ=255) aTTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTa < 2:3107516/100‑1 (MQ=255) tAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAAc < 1:838790/100‑1 (MQ=255) tAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAAc > 1:2164504/1‑100 (MQ=255) tAACCCTTTTTCGTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTTACGGCTGTCCTATGCCAATCGGCTTTGCCTGTCGCATCTGCACCCGGTCTggcagtagc > 2:1862987/1‑93 (MQ=255) cccTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGa > 1:4135434/1‑100 (MQ=255) cTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATg < 1:2569310/100‑1 (MQ=255) cTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATg < 1:304950/100‑1 (MQ=255) tttttCTTCCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATgg < 2:529639/100‑1 (MQ=255) ttttCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGa < 2:121359/100‑1 (MQ=255) tcttcCAGTTGGTCCAGAGTACGGTCCAGTGATGGCTGCTCGATGGCAATCGCTTTTGCCAGTGGAATTTGCGACTGGGCTGGAGGTAACTGATGGata < 2:3259572/99‑1 (MQ=255) cttcCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATAtt > 2:627925/1‑100 (MQ=255) cttcCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATAtt > 1:3138446/1‑100 (MQ=255) ttcCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATtg < 1:1185189/100‑1 (MQ=255) tcCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATtgt > 1:4125087/1‑100 (MQ=255) tcCAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGCCTGGAGGTAACTGATGGATATtgt > 1:1239475/1‑100 (MQ=255) ccAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATtgtg > 1:3236067/1‑100 (MQ=255) cAGTTGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTgtgt < 1:2283336/100‑1 (MQ=255) aGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgta > 1:2434765/1‑100 (MQ=255) gTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaa > 1:3505417/1‑100 (MQ=255) gTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaa < 2:3004242/100‑1 (MQ=255) ttGGTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaac < 1:376952/100‑1 (MQ=255) ggTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgt > 1:3233174/1‑100 (MQ=255) ggTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGATCGATGCCAATCGGTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGATGTAACTGCTGGGTATTGTgtaa > 2:3816463/1‑97 (MQ=255) gTCCAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgta > 1:1656661/1‑100 (MQ=255) ccAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgtaac > 1:963652/1‑100 (MQ=255) ccAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgtaac > 1:210511/1‑100 (MQ=255) ccAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgtaac < 2:1360844/100‑1 (MQ=255) ccAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgtaac > 1:4031831/1‑100 (MQ=255) ccAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgtaac > 1:3913681/1‑100 (MQ=255) ccAGAGCACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTgtaacgtaac > 1:3365986/1‑100 (MQ=255) agagTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAAccc > 2:2128715/1‑100 (MQ=255) | GCTCTGCCTTTTCCGTCAGTTTAATACGTTTAGCCCGACGATCGCTGGCACAAGTTTGACGCGAAATTAACCCTTTTTCTTCCAGTTGGTCCAGAGTACGGACCAGTGATGGCTGCTCGATGCCAATCGCTTTTGCCAGTTGAATTTGCGACTGGTCTGGAGGTAACTGATGGATATTGTGTAACGTAACCC > NC_000913/1720533‑1720724 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |