| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,410,649 | A→G | I124V (ATC→GTC) | dusB → | tRNA‑dihydrouridine synthase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,410,649 | 0 | A | G | 98.8% | 290.1 / ‑4.7 | 82 | I124V (ATC→GTC) | dusB | tRNA‑dihydrouridine synthase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (45/36); total (46/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
CCAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGCCC > NC_000913/3410552‑3410745 | ccAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTc < 1:293135/100‑1 (MQ=255)ccAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTc < 2:256649/100‑1 (MQ=255)ccAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCATCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTc > 2:1754670/1‑100 (MQ=255) cAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTcc < 2:373186/100‑1 (MQ=255) attGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCg < 1:535166/100‑1 (MQ=255) ttGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGa < 1:1321349/100‑1 (MQ=255) ttGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGa < 2:1874766/100‑1 (MQ=255) gATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAgg > 1:913955/1‑100 (MQ=255) gATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAgg > 1:1983216/1‑100 (MQ=255) cAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGgtcgtc > 1:1040651/1‑100 (MQ=255) cAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGgtcgtc < 2:1216009/100‑1 (MQ=255) tatGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCGCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAAt < 2:1946405/100‑1 (MQ=255) tGGGTTTCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGc > 2:705724/1‑100 (MQ=255) tGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGc > 2:1823021/1‑100 (MQ=255) gggTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCa > 1:773775/1‑100 (MQ=255) gggTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCa > 2:439602/1‑100 (MQ=255) tGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTgg > 2:829977/1‑100 (MQ=255) ggCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGtt > 1:146551/1‑100 (MQ=255) gatctgTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGACCCTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGt < 2:1337549/95‑1 (MQ=255) aaaaaGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGt < 1:1823037/100‑1 (MQ=255) aaaaaGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGt < 1:582109/100‑1 (MQ=255) aaaaaGGGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTg > 1:1706112/1‑99 (MQ=255) aaaaGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGtt > 2:1296211/1‑100 (MQ=255) aaaaGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGtt > 1:382415/1‑100 (MQ=255) gTGAATCGCAAGGTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGACCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGtagatc > 1:1337558/1‑95 (MQ=255) gTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTAccc > 2:818427/1‑100 (MQ=255) gTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTAccc < 2:145210/100‑1 (MQ=255) gTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTAccc > 1:516943/1‑100 (MQ=255) gTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTCGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTAccc < 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cAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGAtt > 1:455906/1‑100 (MQ=255) aGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCg < 1:576789/100‑1 (MQ=255) aGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCg < 2:883369/100‑1 (MQ=255) cTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCa > 2:424562/1‑100 (MQ=255) cTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCa > 1:661982/1‑100 (MQ=255) cGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCAcc < 1:1852611/100‑1 (MQ=255) ggTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCt > 2:844127/1‑100 (MQ=255) ggTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCt > 1:283072/1‑100 (MQ=255) ggTTCAGCACTCTTGCAGTACCCGGATGTCGCTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCt > 1:79676/1‑100 (MQ=255) gTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTg < 1:415378/100‑1 (MQ=255) ttCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTgg < 2:89713/100‑1 (MQ=255) tCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTggg < 2:702505/100‑1 (MQ=255) aGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCa < 2:761022/100‑1 (MQ=255) aGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCa < 2:441893/100‑1 (MQ=255) aGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCa > 1:299942/1‑100 (MQ=255) cccTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCGcc > 2:1915196/1‑100 (MQ=255) ctctTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCgg < 2:382414/100‑1 (MQ=255) ctctTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCgg < 2:1040646/100‑1 (MQ=255) tctTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGa > 2:438805/1‑100 (MQ=255) gCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAacac > 2:197094/1‑100 (MQ=255) cAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACAcc > 1:1667098/1‑100 (MQ=255) aGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCg < 1:524587/100‑1 (MQ=255) aGTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCg < 1:770252/100‑1 (MQ=255) gTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGt > 2:560607/1‑100 (MQ=255) gTACCCGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGt < 1:844130/100‑1 (MQ=255) cccGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAAc > 1:560005/1‑100 (MQ=255) cccGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAAc > 1:776303/1‑100 (MQ=255) cGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTg < 2:471870/100‑1 (MQ=255) cGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTg < 2:913951/100‑1 (MQ=255) cGGATGTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTg > 1:134992/1‑100 (MQ=255) 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1:1914994/100‑1 (MQ=255) gTCGTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAag > 1:1461036/1‑100 (MQ=255) cGTTAAACCGGCCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCATCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAagag > 2:1074295/1‑100 (MQ=255) gTTAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAgaga > 2:321961/1‑100 (MQ=255) tAAATCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGACGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGAtt > 2:1888598/1‑100 (MQ=255) aaaTCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTg > 2:736533/1‑100 (MQ=255) tCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGccc > 2:1347602/1‑100 (MQ=255) tCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGccc > 2:1382452/1‑100 (MQ=255) tCGGTCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGccc > 2:2018323/1‑100 (MQ=255) | CCAGATTATTGATATCAATATGGGTTGCCCGGCTAAAAAAGTGAATCGCAAGCTCGCAGGTTCAGCCCTCTTGCAGTACCCGGATGTCGTTAAATCGATCCTTACCGAGGTCGTCAATGCAGTGGACGTTCCTGTTACCCTGAAGATTCGCACCGGCTGGGCACCGGAACACCGTAACTGCGAAGAGATTGCCC > NC_000913/3410552‑3410745 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |