Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,466,858 | G→C | A45G (GCC→GGC) | bfd ← | bacterioferritin‑associated ferredoxin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,466,858 | 0 | G | C | 97.1% | 357.5 / 0.4 | 102 | A45G (GCC→GGC) | bfd | bacterioferritin‑associated ferredoxin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base C (53/46); total (53/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.07e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ACGGCTTACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGGCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGACGAATTTT > NC_000913/3466763‑3466955 | aCGGCTTACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCg > 1:1965757/1‑100 (MQ=255) aCGGCTTACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCg > 1:1362569/1‑100 (MQ=255) cGGCTTACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCgg < 2:1007484/100‑1 (MQ=255) gCTTACGAGTAAGTCAAAAAACACCCTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGac < 1:1631578/100‑1 (MQ=255) cTTACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGaca < 1:186915/100‑1 (MQ=255) ttACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACACCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGacac < 1:406274/100‑1 (MQ=255) tACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGAcaca < 2:55785/100‑1 (MQ=255) tACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGAcaca < 2:688032/100‑1 (MQ=255) cGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACAtt > 1:1573535/1‑100 (MQ=255) aGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTa > 1:702253/1‑100 (MQ=255) aaGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCg > 2:663731/1‑100 (MQ=255) aGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGc > 2:6423/1‑100 (MQ=255) aGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGc > 1:1597802/1‑100 (MQ=255) aGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGc < 2:1163156/100‑1 (MQ=255) aGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGc < 2:1597790/100‑1 (MQ=255) gTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCa > 1:1175452/1‑100 (MQ=255) cAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACt < 2:760351/100‑1 (MQ=255) cAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACt > 2:106400/1‑100 (MQ=255) cAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACt > 1:1660397/1‑100 (MQ=255) cAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACt > 1:1892824/1‑100 (MQ=255) aaaaaaCACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTg < 2:842351/100‑1 (MQ=255) aaaaaCACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTg > 1:152155/1‑99 (MQ=255) aaaaCACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGAt > 2:23880/1‑100 (MQ=255) acacacTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGc < 1:160049/100‑1 (MQ=255) acacacTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGc < 1:550097/100‑1 (MQ=255) cacTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGa > 2:1687452/1‑100 (MQ=255) cTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGAcc > 2:395858/1‑100 (MQ=255) ccGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCgg > 1:1161551/1‑100 (MQ=255) gTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGaa < 1:140775/100‑1 (MQ=255) tATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATaa > 1:1190509/1‑100 (MQ=255) tATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATaa > 1:1533015/1‑100 (MQ=255) aTGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATaaa > 1:943421/1‑100 (MQ=255) aTGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATaaa > 1:943259/1‑100 (MQ=255) tGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAAt > 1:1926992/1‑100 (MQ=255) gCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAAtt < 2:321206/100‑1 (MQ=255) gCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAAtt > 2:337341/1‑100 (MQ=255) gCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAAtt > 1:1105687/1‑100 (MQ=255) cGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAAttt < 2:1161545/100‑1 (MQ=255) ggACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCCCTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAAttt < 2:1104864/99‑1 (MQ=255) ggACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAAtttt < 2:1573525/100‑1 (MQ=255) gACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAAttttt < 1:106401/100‑1 (MQ=255) tCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTa < 2:1892806/100‑1 (MQ=255) ccTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTaa < 2:1783900/100‑1 (MQ=255) cTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTaa < 2:770221/99‑1 (MQ=255) cTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAAt > 1:1823152/1‑100 (MQ=255) cTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAAt > 1:945625/1‑100 (MQ=255) cTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAAt > 2:697158/1‑100 (MQ=255) ttAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAAtt > 2:2019447/1‑100 (MQ=255) tAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGTACACATTTACTGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTg < 2:718061/100‑1 (MQ=255) tAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTg > 1:747352/1‑100 (MQ=255) aaaCTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGc < 1:1816201/100‑1 (MQ=255) aaCTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCt > 2:944576/1‑100 (MQ=255) tcTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTg < 1:28890/99‑1 (MQ=255) aCTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCt < 2:712923/99‑1 (MQ=255) cTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTgg < 1:399147/100‑1 (MQ=255) cTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTgg < 2:1926974/100‑1 (MQ=255) cTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTga > 2:28890/1‑99 (MQ=255) ccGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGaa > 1:622373/1‑100 (MQ=255) ccGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCCGCATGAACATATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATACATTTTTTTAAtt < 2:271807/93‑1 (MQ=255) cGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGTCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAAc < 1:1317826/100‑1 (MQ=255) cAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAg > 2:530268/1‑100 (MQ=255) aGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGAAACGAGt > 2:1101974/1‑100 (MQ=255) gCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGGCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTg < 2:1208658/100‑1 (MQ=255) gCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCCCTGATTGCCGCCCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTg > 1:650261/1‑100 (MQ=255) gCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTg < 2:1190503/100‑1 (MQ=255) gCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCCACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTg > 2:1770050/1‑100 (MQ=255) cTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGa < 2:1965739/100‑1 (MQ=255) tGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAg < 2:171188/100‑1 (MQ=255) gCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAgg > 1:1007760/1‑100 (MQ=255) cATTAATTCATCCTCCATCACTTCCCGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAggg < 1:1665027/100‑1 (MQ=255) cATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAggg < 2:2041915/100‑1 (MQ=255) cATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAggg > 2:1520533/1‑100 (MQ=255) aTTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAgggg < 2:1660384/100‑1 (MQ=255) aTTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAgggg > 1:951762/1‑100 (MQ=255) aTTAATTCATCCTCCATCACTGCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAgggg < 1:550331/100‑1 (MQ=255) ttCATCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAAc < 1:6423/100‑1 (MQ=255) aTCCTCCATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTgg > 2:937123/1‑100 (MQ=255) tcctccATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGgc < 1:23880/100‑1 (MQ=255) tcctccATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGgc < 2:271789/100‑1 (MQ=255) tcctccATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGgc > 2:521520/1‑100 (MQ=255) cctccATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGgcg > 1:1610484/1‑100 (MQ=255) cttccgatcTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGgcgc < 2:390714/92‑1 (MQ=255) ctccATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGgcgc > 1:273938/1‑100 (MQ=255) ccATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGcac > 1:151475/1‑100 (MQ=255) ccATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGcac < 2:1175446/100‑1 (MQ=255) cATCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGcaca > 1:1087986/1‑100 (MQ=255) tCACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGc > 1:921986/1‑100 (MQ=255) cACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGcc < 2:1007755/100‑1 (MQ=255) cACTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGcc > 2:749190/1‑100 (MQ=255) aCTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCt > 1:240372/1‑100 (MQ=255) aCTTCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCt < 2:704135/100‑1 (MQ=255) tCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGcagatcggaag > 1:390715/1‑91 (MQ=255) tCACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGa < 2:650259/99‑1 (MQ=255) naCGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTg > 2:1849056/2‑97 (MQ=255) cACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGACg < 2:1362560/100‑1 (MQ=255) cACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGACg < 1:697160/100‑1 (MQ=255) cACGCGCGCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGACg > 2:1928799/1‑100 (MQ=255) cgcgcgCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGACGaa > 2:335525/1‑100 (MQ=255) cgcgcgCCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGACGaa > 2:224223/1‑100 (MQ=255) cgGCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGACGAAtttt < 2:1040892/100‑1 (MQ=255) | ACGGCTTACGAGTAAGTCAAAAAACACACTCCGTTTATGCGGACTCCTTAAACTCCGGCAGCTGCATTAATTCATCCTCCATCACTTCACGCGCGGCCCGGACACATTTACCGCACTGATTGCCGACCGGAATAAATTTTTTTAATTGCTGGAACGAGTGAGGGGAAAACTGGCGCACAGCCTGACGAATTTT > NC_000913/3466763‑3466955 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |