| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3621557 = | NA (NA) | 7 (0.050) | 4/170 | NT | NA | coding (2366/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | 3621605 = | NA (NA) | coding (2414/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
TCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3621659‑3621557‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcaTGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATA > NC_000913/3621605‑3621703 TCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑G < 1:4247558/100‑1TCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑G > 2:2929351/1‑100TCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑G < 2:4084231/100‑1TCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACGCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑G < 1:1733950/100‑1TCCCGGTGCACGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑G > 2:3507411/1‑100 CCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GG > 2:2154228/1‑100 CCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GG > 2:1208807/1‑100 CCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GG > 2:1331569/1‑100 CCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACAGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑G > 1:1326397/1‑99 CCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCAAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GG > 1:2368858/1‑100 CCCGGTGCAGGCGGGCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GG > 2:3322209/1‑100 CCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGC > 1:2382000/1‑100 CCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCATGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGC > 1:1544533/1‑100 CGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGCA < 2:167390/100‑1 CGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGCA < 1:4052363/100‑1 CGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGCA > 2:4150125/1‑100 CGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGCCG‑‑‑‑GGCA > 1:3659217/1‑100 TTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCCCGGCG‑‑‑‑GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGC > 1:512753/1‑100 TTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGC > 1:544835/1‑100 TCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCA > 1:1428069/1‑100 CATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCATGAACCTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCT > 2:2784255/1‑100 CATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCAC > 1:1537900/1‑100 ATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCGGGCAGGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTG > 2:2025301/1‑100 ATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑CGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCCCC > 1:4134165/1‑100 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCTTTATGAACTCACCACCGCTT < 1:2604259/100‑1 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCCCCGCTT > 2:531281/1‑100 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTT > 1:658682/1‑100 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTT > 2:1344183/1‑100 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTT < 1:3288364/100‑1 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTT < 1:4151065/100‑1 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTT > 2:2266442/1‑100 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTT > 2:3666412/1‑100 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTT > 2:644590/1‑100 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCT > 1:2544141/1‑99 GGCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTCCGGCCGTTAGGCACTCACC > 1:1106351/1‑93 GCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGTCCCTGATGAACTCACAACCCCT > 1:1136346/1‑98 GCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTA > 1:760343/1‑100 GCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTA > 1:1221184/1‑100 GCATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTA < 2:2730320/100‑1 GCATGAAACTCCGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTA < 2:3741855/100‑1 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCTCGACCGCCTGCACCGGGAATCGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTAT < 1:2327491/100‑1 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAGCGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACCCACCACCGCTTAT < 1:2646130/100‑1 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGTAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTAT < 1:1871733/100‑1 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTAT > 2:2216788/1‑100 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTAT > 2:2336033/1‑100 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTAT > 2:2168548/1‑100 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTAT > 1:3781638/1‑100 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTAT < 1:3330187/100‑1 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCAACGCTTAT > 2:3916867/1‑100 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAAATCACCCCCGCTTAT > 1:1643796/1‑100 CATGAAACTCGGCGACACACCGCTAGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTAT > 1:1758637/1‑100 ATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATA < 1:3850895/100‑1 ATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATA < 1:1668423/100‑1 ATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCAGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATA > 1:4021949/1‑100 ATGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCAGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGACGTTATGCACTCACCACCGCTTATA > 2:754887/1‑100 TCCCGGTGCAGGCGGTCGCGGGTGTACTCCACCAGCGGTGTGTCGCCGAGTTTCATGCCTGCCAGGTAACCGCTGCCGTAGGTCAGCCATTCCACGGCG‑‑‑‑GGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3621659‑3621557‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcaTGAAACTCGGCGACACACCGCTGGTGGAGTACACCCGCGACCGCCTGCACCGGGAAACGCTGCGCAGCTTCGGCCGTTATGAACTCACCACCGCTTATA > NC_000913/3621605‑3621703 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |