| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 274525 = | NA (NA) | 20 (0.140) | 11/164 | NT | NA | noncoding (625/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 274559 = | NA (NA) | noncoding (591/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
GCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274630‑274525‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgccaa‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGCATC > NC_000913/274559‑274655 GCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCACTCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGGCGA > 1:582177/1‑100GCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGA < 1:3144086/100‑1GCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGA < 1:2045985/100‑1GCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGA < 2:3387065/100‑1GCTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGA < 1:2259146/100‑1 CTCGACCAAGAACAAAGGGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT > 2:578346/1‑100 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT > 2:1964748/1‑100 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT > 1:2252805/1‑100 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT > 1:2191535/1‑100 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT > 1:4132744/1‑100 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT > 2:3167845/1‑100 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT < 2:355568/100‑1 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT > 1:1147274/1‑100 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT < 2:611516/100‑1 CTCGACCAAGAACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGAT > 2:840299/1‑100 ACAAAGAGCAGCAACGCGATCCGGAGATGCATCAGACCAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTCGCATGAAGTCCCACATTGGTGTCGATGC > 1:1094235/1‑91 CAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATC > 1:945323/1‑100 CAAGAAAGGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATC > 1:2963197/1‑100 GGCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGTGGC‑CTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGC > 2:2410177/1‑100 GCAATCAGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCT > 2:1668829/1‑100 AGTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCT > 1:2518313/1‑100 AGTGGCACTTTGGCATGAAGGCACACATTGGTGTCGATGCCAAGAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCT > 1:445996/1‑100 nTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGTGGCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTT > 1:1872901/2‑100 GTGGCACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAAGAGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTT > 1:1068901/1‑100 ccCTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTC > 1:383390/3‑100 CACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTC > 1:3516790/1‑100 CACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTC > 2:3695491/1‑100 ACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCT > 1:3276452/1‑100 ACTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGGGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATGGCGTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCGTTGTTCT > 1:427730/1‑100 CTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTT > 1:1706409/1‑100 CTTTGGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTT > 2:741255/1‑100 GGCATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTC > 1:1112322/1‑100 ATGAAGGCCCACATTGGTGTCGATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAG < 2:796044/100‑1 tcattaCAA‑TGTGTCACTGATTGTCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGTTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGG < 1:1387677/93‑1 gatctCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTG < 2:2173339/95‑1 cataCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTG > 2:3949508/5‑100 tctCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 2:2126188/97‑1 tTGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 2:2635056/99‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGCTTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 1:3999202/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG > 1:2338202/1‑100 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 1:2689645/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 2:1778162/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG > 1:1061791/1‑100 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG > 2:2206830/1‑100 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 2:558870/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 2:2737572/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 2:2940577/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 1:3808083/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 2:3385372/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG > 1:1538712/1‑100 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 2:3488438/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCACCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 1:2999645/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCGGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGGCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 1:3308055/100‑1 ATGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTAGTCTGATGCACCTGCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGATCTGGGTGCCTCAATGATGGTGG < 1:1663360/100‑1 TGCCAA‑AGTGCCACTGGTTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGC < 1:2525475/100‑1 TGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGTGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGC > 2:2993736/1‑100 TGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGa > 1:2635047/1‑99 TGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGC > 1:2005967/1‑100 TGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGC > 2:1085310/1‑100 TGCCAA‑AGTGCCACTGATTGCCTTTCTTGGTCTGATGCATCTCCGGATCGCGTTGCTGCTCTTTGTTCTTGGTCGAGCTGGGTGCCTCAATGATGGTGGC > 1:4105636/1‑100 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |