| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2304789 | 186 (1.210) | 28 (0.290) +CTACGGGGTGGAGCACTTCACAGCGGTGTAGGC |
10/112 | NT | 19.4% | noncoding (373/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 2305065 | NA (NA) | noncoding (649/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
GCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTT > NC_000913/2304690‑2304888 | gCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGAc < 1:165642/100‑1 (MQ=32) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATcc < 2:3978600/100‑1 (MQ=35) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATcc < 2:1088750/100‑1 (MQ=35) ttGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATcc < 2:1059358/99‑1 (MQ=35) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCACCGTcc > 2:2484983/1‑100 (MQ=255) aTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCg < 2:2801365/100‑1 (MQ=255) aTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCg > 2:162128/1‑100 (MQ=255) gCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGTCCGAg > 1:1271766/1‑100 (MQ=17) gCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAg < 1:2198185/100‑1 (MQ=255) gACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGc < 1:3166250/99‑1 (MQ=255) cggtatcgTCTTTGCGGGCCTACGCGGCT‑GTGGAGTGCGGCACCACGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGc < 1:2912405/89‑1 (MQ=14) tGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCACCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTg < 2:1594222/100‑1 (MQ=255) ggCGCCTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGc < 1:1039910/100‑1 (MQ=255) gcgcGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGcc < 2:3585080/100‑1 (MQ=255) gcgcGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGcc > 2:1729436/1‑100 (MQ=40) gcgcGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGcc > 1:4126489/1‑100 (MQ=40) cgcgTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCt < 2:4256216/100‑1 (MQ=255) gcgTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTg < 2:1678118/100‑1 (MQ=255) cgTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGa < 2:2624388/100‑1 (MQ=255) cgTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCCAGCCGGGTGCCTg > 1:605871/1‑99 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGGCGCATCCAACctacggggtggagcacttcacagcggtg > 1:2323905‑M1/1‑72 (MQ=255) tCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATg < 1:563214/100‑1 (MQ=255) cTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGc < 1:180372/100‑1 (MQ=255) ttATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCg > 1:3993989/1‑100 (MQ=40) tATCAGGCCTCCA‑CGCTCGTGAAGTGCTGCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGc < 1:1381148/98‑1 (MQ=14) tATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGc > 2:3762325/1‑98 (MQ=40) tATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGa > 2:1985735/1‑100 (MQ=17) aTCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGAc < 2:1503724/100‑1 (MQ=255) cAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGc > 2:2973233/1‑100 (MQ=40) cAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGc > 1:750937/1‑100 (MQ=17) cTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcg > 2:81280/1‑100 (MQ=40) cTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGgcg > 1:1746366/1‑100 (MQ=40) acacCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGgcgc > 1:4233343/1‑93 (MQ=255) acacCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGcgcg < 2:3053113/100‑1 (MQ=255) acCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTc < 1:2276321/100‑1 (MQ=17) ccGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCt > 2:2834745/1‑100 (MQ=255) ccGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCt < 1:2829535/100‑1 (MQ=255) ccGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCt < 2:841549/100‑1 (MQ=40) ccGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCt > 1:2154116/1‑100 (MQ=255) gCT‑GTGAAGTGCGCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTa < 1:11320/100‑1 (MQ=255) gcggtgAAGTGCGCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGCCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTc < 1:3938276/94‑1 (MQ=255) tgAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAg < 2:3238945/100‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgg > 2:2222959/1‑100 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 2:2034887/100‑1 (MQ=255) aaGTGCTCCACCCCGTAGATTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACATCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 1:162128/100‑1 (MQ=255) aGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAg > 1:1957333/1‑97 (MQ=40) gTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGACGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgga > 2:3861576/1‑97 (MQ=255) gCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTac > 2:938034/1‑100 (MQ=255) caccgccccGTAGTTTGGACAAGGCGGTCACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCt < 1:3201182/92‑1 (MQ=11) cTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTaca < 1:425628/100‑1 (MQ=255) ccACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAcc > 2:3189889/1‑100 (MQ=255) cACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAGCAGGCCTACACCg > 1:3299084/1‑100 (MQ=255) ccGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtgt > 2:1436320/1‑100 (MQ=255) cGTAGGTCGGGTACGACGGTGACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCtg < 1:3344950/98‑1 (MQ=11) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAg < 2:4001476/100‑1 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccg > 2:2441638‑M1/1‑32 (MQ=255) aGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccg > 2:1323828‑M1/1‑32 (MQ=255) ggTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccgg > 1:1465223‑M1/1‑31 (MQ=255) gtcggataAGGCGGTTACGCCGCATCCGACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc > 2:2589024‑M1/4‑30 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTg < 2:3874965/100‑1 (MQ=255) gTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggc > 2:1746371‑M1/1‑30 (MQ=255) tcggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGc < 2:2279142/98‑1 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcacccggctcg > 2:1161648‑M1/1‑27 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcg > 2:633850‑M1/1‑27 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggcccg > 2:152995‑M1/1‑27 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCt > 1:2987862/1‑99 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTc > 2:1384881/1‑100 (MQ=255) ggATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcg > 1:2647365‑M1/1‑27 (MQ=255) ggATAAGGCGGTGACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTc < 1:3778759/100‑1 (MQ=12) ggATAACGCGGTTACGCGACATCAGACGTCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTc < 2:2507527/100‑1 (MQ=14) gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgg < 1:2599260‑M1/100‑75 (MQ=255) gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACctacggggtggagcacttcacagcggtgtaggcctgataagacgcgccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgg > 2:100743‑M1/1‑26 (MQ=255) gATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGCCCTCCACCCCTCTGACGTGc > 1:3913792/1‑97 (MQ=14) tAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAc < 2:2703345/100‑1 (MQ=38) aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcc > 1:4006869/1‑100 (MQ=38) aaGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAc < 1:991139/99‑1 (MQ=35) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc > 2:3338539/1‑100 (MQ=38) aGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAccc < 2:2987874/100‑1 (MQ=38) ggCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCAcccc > 1:3686810/1‑100 (MQ=38) ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 1:862899/100‑1 (MQ=35) ggTTACGCCGCATCCGACATCCAACGGCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTa < 2:2922436/100‑1 (MQ=17) gTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACCCAGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGtcg > 1:2518274/1‑98 (MQ=255) ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGCTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg < 2:2549340/100‑1 (MQ=25) ttACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAgg < 2:1702189/100‑1 (MQ=35) cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg < 2:517606/100‑1 (MQ=32) cgccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCg > 1:2936763/1‑100 (MQ=33) gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCGCCCCGTAGGTCgg < 1:553076/100‑1 (MQ=17) gccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCgg < 2:2154121/100‑1 (MQ=33) ccgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGa < 2:3676265/100‑1 (MQ=33) cgcATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGAt < 2:4470/100‑1 (MQ=33) ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc < 2:3102347/100‑1 (MQ=32) ccGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGc > 2:2081859/1‑100 (MQ=33) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg > 2:3147128/1‑100 (MQ=33) gACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCgg < 2:891211/100‑1 (MQ=32) cATCCGATGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 2:679513/100‑1 (MQ=16) cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 2:1560386/100‑1 (MQ=32) cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 2:1173314/100‑1 (MQ=32) cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 1:3803004/1‑100 (MQ=33) cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt > 2:1779352/1‑100 (MQ=33) cATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGtt < 2:1871126/100‑1 (MQ=32) | GCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCT‑GTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCCAACGTCCGAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTT > NC_000913/2304690‑2304888 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |