New junction evidence
		seq id	position	reads (cov)	reads (cov)	score	skew	freq	annotation	gene	product
*	?	NC_000913	3622466 =	NA (NA)	31 (0.210)	12/170	NT	49.6%	coding (3275/4236 nt)	rhsB	Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor
	?	NC_000913	3622497 =	33 (0.210)					coding (3306/4236 nt)	rhsB	Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor

CGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACC  >  NC_000913/3622368‑3622519                                                                                                   |                                                      cGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGCTGCCCTTCAGCGGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGCGTGGTGTTCccg                                                      >  1:3952404/1‑100 (MQ=255) cGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccg                                                      >  2:4101231/1‑100 (MQ=40)  gAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccgc                                                     >  1:3638431/1‑100 (MQ=38)    aaCTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccgccg                                                   >  1:3045241/1‑100 (MQ=35)     aCTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCgg                                                  <  2:222992/100‑1 (MQ=38)     aCTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCgg                                                  <  2:2453466/100‑1 (MQ=38)     aCTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCgg                                                  <  2:3433143/100‑1 (MQ=38)     aCTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCgg                                                  <  2:2974064/100‑1 (MQ=38)      cTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGTGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt                                                 <  2:3270109/100‑1 (MQ=25)      cTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt                                                 >  2:1164401/1‑100 (MQ=35)      cTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt                                                 >  2:3930526/1‑100 (MQ=35)      cTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt                                                 <  1:428469/100‑1 (MQ=35)      cTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt                                                 <  2:575237/100‑1 (MQ=35)      cTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt                                                 >  1:2129373/1‑100 (MQ=35)      cTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt                                                 >  1:3283972/1‑100 (MQ=35)        gCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGc                                               >  1:2719635/1‑100 (MQ=32)           aCCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTgg                                            <  2:1271650/100‑1 (MQ=33)            ccGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGt                                           <  2:4077148/100‑1 (MQ=33)            ccGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGt                                           >  2:186332/1‑100 (MQ=33)             cGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTg                                          >  2:1818661/1‑100 (MQ=33)              ggTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGc                                         >  2:2707144/1‑100 (MQ=32)              ggTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGc                                         <  1:1635942/100‑1 (MQ=32)                 gAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGa                                      <  2:3836142/100‑1 (MQ=33)                  aGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGAt                                     <  2:891716/100‑1 (MQ=33)                   gCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATg                                    >  2:1619952/1‑100 (MQ=33)                   gCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATg                                    >  2:1167295/1‑100 (MQ=33)                    cTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGc                                   <  1:2115060/100‑1 (MQ=32)                     tGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCt                                  <  2:629711/100‑1 (MQ=32)                     tGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCt                                  <  2:1490736/100‑1 (MQ=32)                     tGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCt                                  <  2:1089863/100‑1 (MQ=32)                     tGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCt                                  >  2:2086954/1‑100 (MQ=32)                     tGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCt                                  >  2:315583/1‑100 (MQ=33)                     tGGCGAAAACACAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCt                                  <  1:320468/100‑1 (MQ=18)                      ggCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGGTGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAACACGGTTGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGc                                   <  1:350626/98‑1 (MQ=255)                      ggCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTc                                 >  2:3288352/1‑100 (MQ=33)                       gCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCg                                <  1:4039403/100‑1 (MQ=32)                        cGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGa                               >  1:37879/1‑100 (MQ=33)                        cGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGa                               >  2:1913647/1‑100 (MQ=32) 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                                           cTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATcc           >  2:1643723/1‑100 (MQ=33)                                            cTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATcc           >  2:2351077/1‑100 (MQ=32)                                            cTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATcc           >  2:2457361/1‑100 (MQ=32)                                             tGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCt          >  1:3171913/1‑100 (MQ=33)                                              ggCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTg         <  1:186332/100‑1 (MQ=33)                                                cGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGc       <  1:862732/100‑1 (MQ=33)                                                 ggATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGCAAGTGAAATCCTGGCt      >  1:241752/1‑100 (MQ=17)                                                 ggATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGc       <  2:1145477/99‑1 (MQ=32)                                                 ggATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCt      <  2:3225939/100‑1 (MQ=33)                                                 ggATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGCCAAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCCCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGAGAAATCGTGGCt      >  1:1394887/1‑100 (MQ=11)                                                   aTGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGTCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGa    >  1:2822187/1‑100 (MQ=17)                                                   aTGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGGGAAATCCTGGCTGa    >  2:1630082/1‑100 (MQ=17)                                                    tGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCtttc   >  1:3779527/1‑97 (MQ=14)                                                    tGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGAc   >  2:3823629/1‑100 (MQ=31)                                                     gCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGAcc  <  2:3377571/100‑1 (MQ=11)                                                                                                   |                                                      CGAAACTGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATGCCCTTCAGCAGTCCGGCGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACC  >  NC_000913/3622368‑3622519

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.