New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4132351 = | NA (NA) | 9 (0.060) | 4/162 | NT | NA | noncoding (5/34 nt) | REP306 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP306 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
? | NC_000913 | 4132381 = | NA (NA) | intergenic (+114/‑235) | metL/metF | Bifunctional aspartokinase/homoserine dehydrogenase 2/5,10‑methylenetetrahydrofolate reductase |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GGCACAGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGATTTTCTTTTT > NC_000913/4132252‑4132450 | ggCACAGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAgg < 2:3449003/100‑1 (MQ=255) gCACAGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGc > 1:3842188/1‑100 (MQ=255) aGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGa < 1:1870141/100‑1 (MQ=255) aGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGa > 2:2562573/1‑100 (MQ=255) tgaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGa < 1:1718581‑M1/6‑1 (MQ=255) tgaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAt > 2:2713110‑M1/94‑100 (MQ=255) tgaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAt < 1:2264091‑M1/7‑1 (MQ=255) gttgttGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGAt < 1:1127021/100‑1 (MQ=255) gaaaaaacttcaggatggtaagaaaaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGAtt < 2:3243797‑M1/8‑1 (MQ=255) tgttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTa > 2:937791/1‑100 (MQ=255) gttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTaa < 1:2479030/100‑1 (MQ=255) gttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTaa > 1:3580398/1‑100 (MQ=255) ttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAg < 1:876420/100‑1 (MQ=255) ttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAg > 1:379004/1‑100 (MQ=255) ttgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAg < 2:578450/100‑1 (MQ=255) tgtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGc > 2:3384565/1‑100 (MQ=255) gtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCg < 2:3173440/100‑1 (MQ=255) gtAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCg > 2:1613974/1‑100 (MQ=255) aTTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGCAATATATTGATTTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGtct < 2:2888428/100‑3 (MQ=255) aTTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGttt > 1:3361021/1‑100 (MQ=255) aTTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGttt < 1:3236851/100‑1 (MQ=255) aTTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGttt > 1:3054247/1‑100 (MQ=255) tttCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTa < 2:1977704/100‑1 (MQ=255) tttCAGAAATTTAATAATGCCCAGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGtt < 1:1218998/98‑1 (MQ=255) ttCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTac > 2:2309758/1‑100 (MQ=255) tCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacg < 2:749729/100‑1 (MQ=255) tCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacg < 2:1273880/100‑1 (MQ=255) cAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacga > 2:973302/1‑100 (MQ=255) cAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacga < 2:380421/100‑1 (MQ=255) aGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgac < 1:2214243/100‑1 (MQ=255) gAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgacg < 1:1398345/100‑1 (MQ=255) gAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgacg > 2:85160/1‑100 (MQ=255) gAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgacg > 2:2469481/1‑100 (MQ=255) gAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTGTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacgacg < 1:2683776/100‑1 (MQ=255) aaTTTAATAATGACCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTacg < 2:2198820/95‑1 (MQ=255) taataaTGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCg < 1:94393/100‑1 (MQ=255) aataatGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCgg > 1:3654980/1‑100 (MQ=255) ataatGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGc < 2:153651/100‑1 (MQ=255) ataatGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGc < 2:1645294/100‑1 (MQ=255) ataatGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGAGTAAGCGTTTACGACGAATCCGGc < 2:3620409/100‑1 (MQ=255) aaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaa > 1:2119200‑M1/69‑100 (MQ=255) aaagaaaatccggtatgcaaagcaaaccggactgcaaatataaactaaccatgtacttattgcttcttGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaa > 2:3981295‑M1/69‑100 (MQ=255) tGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaaga < 1:4237210/100‑1 (MQ=255) tGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaa < 2:48075/98‑1 (MQ=255) gCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaagaa > 1:2073734/1‑100 (MQ=255) cccGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAACTATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCaaga > 1:3692046/1‑98 (MQ=255) ccGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGc < 2:3455143/100‑1 (MQ=255) ggTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCaa > 2:4205586/1‑100 (MQ=255) gTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAAt < 2:3878381/100‑1 (MQ=255) aCTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATa < 2:182497/99‑1 (MQ=255) tCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGt > 1:1934134/1‑100 (MQ=255) cATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTa < 1:1307199/100‑1 (MQ=255) ttttCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATg < 1:1087781/100‑1 (MQ=255) tttCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATgg > 2:1233012/1‑100 (MQ=255) tttCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATgg > 2:1735965/1‑100 (MQ=255) ttATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTta < 1:562944/100‑1 (MQ=255) tATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGTATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTtat < 2:1474187/100‑1 (MQ=255) aTGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACAAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTtata < 1:993785/100‑1 (MQ=255) tGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTATGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGCTTatat > 1:4020932/1‑100 (MQ=255) gtgtatAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATGAAGCGGGATTAAGCGTTTACGACGAATCTGGCAAGAAGCAAGAAGTACATGGTTAGTTTATAttt < 1:1699898/95‑1 (MQ=255) gTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATAttt > 2:1506564/1‑100 (MQ=255) ttCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGc > 1:24224/1‑100 (MQ=255) ttCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGc < 2:3581119/100‑1 (MQ=255) ttCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGc < 1:705532/100‑1 (MQ=255) ttCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGc < 2:2655542/100‑1 (MQ=255) tCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCa > 2:1884751/1‑100 (MQ=255) cTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATTCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAg < 1:2335193/100‑1 (MQ=255) cTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAg < 2:704848/100‑1 (MQ=255) cTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAg > 1:2889892/1‑100 (MQ=255) aTGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTcc > 1:3448711/1‑100 (MQ=255) atatatTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGttt < 2:214091/100‑1 (MQ=255) tatatTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGGTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGtttg > 1:2290572/1‑100 (MQ=255) tatTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGtttgct > 1:2297699/1‑100 (MQ=255) 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ggATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttt > 2:1989968/1‑100 (MQ=255) ggATTAGACCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttt > 2:2239862/1‑100 (MQ=255) aTTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttc < 2:3427239/100‑1 (MQ=255) aTTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttc < 2:4063242/100‑1 (MQ=255) aTTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttc > 1:1881806/1‑100 (MQ=255) ttAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCGAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATTCCGTAttttct < 1:2239856/100‑1 (MQ=255) tAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttctt < 2:379006/100‑1 (MQ=255) ggCCGGATTAAGCTTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttctttt < 1:1021272/100‑1 (MQ=255) ggCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttctttt < 2:2978859/100‑1 (MQ=255) ggCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttctttt > 1:1262563/1‑100 (MQ=255) ggCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttctttt > 2:1452084/1‑100 (MQ=255) GCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGAttttcttttt < 2:3284987‑M1/100‑1 (MQ=255) | GGCACAGTTGTTGTAATTTCAGAAATTTAATAATGCCCGGTACTCATGTTTTCGGGTTTATGGTTTCTAATGAAATATATTGAATTATCATAGGATTAGGCCGGATTAAGCGTTTACGACGAATCCGGCAAGAAGCAATAAGTACATGGTTAGTTTATATTTGCAGTCCGGTTTGCTTTGCATACCGGATTTTCTTTTT > NC_000913/4132252‑4132450 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |