| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,835,227 | T→C | 39.4% | F140F (TTT→TTC) | ydjZ → | TVP38/TMEM64 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,835,227 | 0 | T | C | 39.4% | 105.7 / 167.2 | 160 | F140F (TTT→TTC) | ydjZ | TVP38/TMEM64 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/52); new base C (31/32); total (76/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
GGCCGGCGCGGCGCTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACTTCAATACG > NC_000913/1835128‑1835325 | ggCCGGCGCGGCGCTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCttt > 2:700599/1‑100 (MQ=255) gCCGGCGCGGCGCTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCtttt > 2:1057014/1‑100 (MQ=255) cggcgcggcgCTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCttcttc < 2:3462395/100‑1 (MQ=255) cggcgcggcgCTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTc < 2:3652810/100‑1 (MQ=255) gcgcggcgcTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCAc < 2:4165120/100‑1 (MQ=255) cgcggcgcTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACt < 1:3874459/100‑1 (MQ=255) gcggcgcTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACtn < 1:275351/100‑2 (MQ=255) cggcgcTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCg < 2:2740195/100‑1 (MQ=255) cggcgcTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCg > 1:1025621/1‑100 (MQ=255) cggcgcTGTACTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCg < 1:160978/100‑1 (MQ=255) gcgcTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCt < 2:1883744/100‑1 (MQ=255) cTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACg > 2:3042368/1‑100 (MQ=255) tgtgCTTTGTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCGTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACgg < 1:1243576/100‑1 (MQ=255) gtgCTTTTTTATCGCCAGCGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCTTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGc < 1:2644031/100‑1 (MQ=255) tgCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTTGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCa > 1:1055498/1‑100 (MQ=255) gCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCaa > 1:1830060/1‑100 (MQ=255) cTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCaaa > 2:1828455/1‑100 (MQ=255) cTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCaa > 2:643919/1‑99 (MQ=255) tttttATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAaca < 1:2079133/100‑1 (MQ=255) tttATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAacaca > 1:2432338/1‑100 (MQ=255) tATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACAcc > 2:2475876/1‑100 (MQ=255) aTCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCa > 2:2055676/1‑100 (MQ=255) cGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCAtt > 1:1590273/1‑100 (MQ=255) cGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCAtt > 2:1008735/1‑100 (MQ=255) gCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTc > 2:343546/1‑100 (MQ=255) ccAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGCCGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCt > 1:1998094/1‑100 (MQ=255) ccAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCt < 2:3474666/100‑1 (MQ=255) ccAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCt < 2:3272946/100‑1 (MQ=255) ccAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAAGTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCt < 2:1489400/100‑1 (MQ=255) agagTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTgg < 1:808725/100‑1 (MQ=255) agagTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTgg < 2:1921478/100‑1 (MQ=255) gagTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGt > 1:2852008/1‑100 (MQ=255) gagTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGt > 1:2253917/1‑100 (MQ=255) attGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTc < 1:2978313/98‑1 (MQ=255) gATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGt > 1:2133215/1‑100 (MQ=255) gATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGt > 2:1378721/1‑100 (MQ=255) aTGGGCCGAGAAGTGGTGGAAAAATTAACCAGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCt < 1:2303824/92‑1 (MQ=255) tGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCg > 1:398920/1‑100 (MQ=255) gggCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCgg > 1:3512907/1‑100 (MQ=255) gggCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCgg > 1:3512846/1‑100 (MQ=255) gggCCGCGAAGTGGAGGAAAAATTACCCGGCAAACCCGTGCTTGACAGTATAGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCgg < 1:1519771/100‑1 (MQ=255) ggCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGt < 1:1450800/100‑1 (MQ=255) cgAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTg < 2:1109962/100‑1 (MQ=255) tggtggAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCttt < 1:190921/100‑1 (MQ=255) ggtggAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCtttt > 1:1967189/1‑100 (MQ=255) ggtggAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCGTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGGTATTGCCt > 1:3884507/1‑97 (MQ=255) ggtggAAAAATTAACCGGCAAAACCGAGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCtttt > 2:2593296/1‑100 (MQ=255) tggAAAAATTAACCGGCAAATCCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCCCTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGt < 1:626027/100‑1 (MQ=255) tggAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGt < 2:3702562/100‑1 (MQ=255) tggAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGt > 2:2461435/1‑100 (MQ=255) ggAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGTTTATTGCCTTTTGTc > 1:4147088/1‑100 (MQ=255) ggAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTc > 2:3106804/1‑100 (MQ=255) gtaaaaTTAACTGCCAAGTCCTTGCTTGACAGTATGCACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTcc < 1:3730155/98‑1 (MQ=255) gAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTcc > 2:1338172/1‑100 (MQ=255) gAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGAAGGCTTTTTCCCTCGCTACATCAAACACACCATTCTGGTCTGGCTGTTATTGCATGTTGTcc < 1:859635/100‑1 (MQ=255) aaaaaTTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTccc > 2:2864403/1‑100 (MQ=255) aaaaaTTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTccc < 1:1798582/100‑1 (MQ=255) aaaaTTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCt < 1:2837009/100‑1 (MQ=255) aTTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTc < 1:1721915/100‑1 (MQ=255) aTTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAACCACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTc > 2:593686/1‑100 (MQ=255) ttAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCg < 2:3367897/100‑1 (MQ=255) ttAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCg > 2:4276726/1‑100 (MQ=255) aaCCGGGAAAACCGTGCTTGACAGTGTGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCGTTTGTCCCTTTCGAt < 1:3429709/100‑1 (MQ=255) aaCCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGAt < 2:3134603/100‑1 (MQ=255) aaCCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGAt < 2:1705538/100‑1 (MQ=255) aaCCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGAt < 2:1542083/100‑1 (MQ=255) ccGGCATATCCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCTCTCGCTACGGCCAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATc < 1:1324116/99‑1 (MQ=255) ccGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATcc < 1:2154150/100‑1 (MQ=255) ccGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATcc < 2:4099377/100‑1 (MQ=255) aaaaCCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACTGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCa < 2:3191965/100‑1 (MQ=255) aaaaCCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCa < 1:700596/100‑1 (MQ=255) aCCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCt > 1:2505147/1‑100 (MQ=255) aCCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCt < 1:4169385/100‑1 (MQ=255) ccGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTTATTCGCTACGGCAAACACACCATGCTGTTCTGTCTGTTATGGCTTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTa > 1:1419978/1‑100 (MQ=255) ccGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTa > 2:2293522/1‑100 (MQ=255) gTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTAtg > 1:3251895/1‑100 (MQ=255) tGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTAtgc < 2:510267/100‑1 (MQ=255) tGCTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTAtgc > 2:1513107/1‑100 (MQ=255) gCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTAtgct > 2:4070108/1‑100 (MQ=255) cTTGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTAtgctg > 2:3902569/1‑100 (MQ=255) ttGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCCACGTCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTGATTGCCTTTTGACCCTTTAGATCCAATCCGCTAtgctg > 1:481868/1‑99 (MQ=255) tGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGcc > 2:1980954/1‑100 (MQ=255) tGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGcc < 1:1199948/100‑1 (MQ=255) tGACAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGcc < 2:1480041/100‑1 (MQ=255) aCAGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCgg < 1:2862060/100‑1 (MQ=255) aGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGtt > 2:3126125/1‑100 (MQ=255) aGTATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGtt < 1:765527/100‑1 (MQ=255) tATGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTg < 1:3239685/100‑1 (MQ=255) aTGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGa < 2:278079/100‑1 (MQ=255) aTGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGa < 2:355402/100‑1 (MQ=255) tGGACGGCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGAc > 1:1439261/1‑100 (MQ=255) ggACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACt > 2:3222030/1‑100 (MQ=255) gACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACtt > 2:2080555/1‑100 (MQ=255) gACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACtt > 1:898425/1‑100 (MQ=255) aCGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACTTc > 1:3170400/1‑100 (MQ=255) cGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACTTCa > 2:782854/1‑100 (MQ=255) gCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACTTCAAt > 2:4120536/1‑100 (MQ=255) gCTTCTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACTTCAAt > 2:1808551/1‑100 (MQ=255) cttcttCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACTTCAATa < 1:4200628/100‑1 (MQ=255) cTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACTTCAATa > 2:3314307/1‑100 (MQ=255) | GGCCGGCGCGGCGCTGTGCTTTTTTATCGCCAGAGTGATGGGCCGCGAAGTGGTGGAAAAATTAACCGGCAAAACCGTGCTTGACAGTATGGACGGCTTTTTCACTCGCTACGGCAAACACACCATTCTGGTCTGTCGGTTATTGCCTTTTGTCCCTTTCGATCCAATCAGCTATGCTGCCGGTTTGACTTCAATACG > NC_000913/1835128‑1835325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |