| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,971,690 | A→C | 100% | Q144P (CAG→CCG) | wecC → | UDP‑N‑acetyl‑D‑mannosaminuronic acid dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,971,690 | 0 | A | C | 98.9% | 615.5 / ‑4.1 | 177 | Q144P (CAG→CCG) | wecC | UDP‑N‑acetyl‑D‑mannosaminuronic acid dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (81/93); total (83/94) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
GGCGCGCTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCAGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATCGCGT > NC_000913/3971593‑3971786 | cgcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCTACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGAGTCTGGAGCTCACTTTCCGGCCGCAGGt > 1:2283175/1‑100 (MQ=255) cgcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTTCCGCCGCAGGt < 2:819110/100‑1 (MQ=255) gcTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTg > 1:2952488/1‑100 (MQ=255) tGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGa < 1:998976/100‑1 (MQ=255) aTCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTGGCAGGGGTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCGGCAGGTGGGCGAGc > 1:143590/1‑100 (MQ=255) aTCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAg < 1:2393376/99‑1 (MQ=255) tCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCa < 2:654651/100‑1 (MQ=255) cTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCCgg > 1:2072089/1‑100 (MQ=255) cTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAgg < 2:3182854/100‑1 (MQ=255) cTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGACGGCAGAATGGTTAGCAGAGATCCGTCCGCACCTCACTTTCCCGCCGCAgggggg > 1:1072872/1‑92 (MQ=255) ttGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGc < 2:2241600/100‑1 (MQ=255) ttGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCAGCAGGTGGGCGAGCAGGc < 1:3148843/100‑1 (MQ=255) taaaTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGc > 2:2035200/3‑99 (MQ=255) tGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCg < 1:259113/100‑1 (MQ=255) aaTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGACTGGTTAGCAGGGATGCGCCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGGGGGCg > 1:3584749/1‑90 (MQ=255) aaTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGa < 1:3396211/100‑1 (MQ=255) aaTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGa < 1:62697/100‑1 (MQ=255) aaTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGCCCGCATCTCACTTTCCCGCCGCAGGGGGGCGAGCAGGCGGa > 1:4057025/1‑100 (MQ=255) aTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGCATGGTTGGCAGAGATGCGGCCGGATCTCCCCTTACCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGACGGAc > 1:1071346/1‑100 (MQ=255) aTCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGAc < 2:2931295/100‑1 (MQ=255) tCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCGGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACg > 1:554425/1‑100 (MQ=255) tCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACg < 1:2572376/100‑1 (MQ=255) tCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACg < 1:3035766/100‑1 (MQ=255) ccACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACg < 2:1525078/99‑1 (MQ=255) ccACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGt < 2:2929857/100‑1 (MQ=255) ccACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGt < 2:2562451/100‑1 (MQ=255) cACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTc > 2:512298/1‑100 (MQ=255) cACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATAGCAGAAAGGTTAGCAGAGATGCGGCCGGGTCTCACTTACACGCCGCAGGTGGGCCACCAGGAGGAcat > 1:4214951/1‑97 (MQ=255) ncTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCCGGCGGACGTCaa > 1:2011702/2‑100 (MQ=255) ccTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGCATGGTTAGCAGAGATGCGACCGGATCACAATCTCGCACCGCAGCTGGGCGAACAGGCGGACGTCa > 1:4255002/1‑99 (MQ=255) ccTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCaa > 2:751463/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAAc > 2:1987331/1‑100 (MQ=255) cTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAAGGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGTCGTCAAc < 1:2240143/100‑1 (MQ=255) tCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACa < 2:213266/100‑1 (MQ=255) cGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGc < 2:3234179/100‑1 (MQ=255) cGGTGGGGTCAACCAAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGc < 2:120980/100‑1 (MQ=255) ggTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCt > 1:2701485/1‑100 (MQ=255) ggTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCt < 1:1636882/100‑1 (MQ=255) gTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCtt < 2:2706744/100‑1 (MQ=255) ggggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTAc < 2:2216704/100‑1 (MQ=255) ggTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTg > 2:3980898/1‑100 (MQ=255) cAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc < 1:4160000/100‑1 (MQ=255) cAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc > 2:3525798/1‑100 (MQ=255) cAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc < 2:1370382/100‑1 (MQ=255) cAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGccc > 2:3649966/1‑100 (MQ=255) cGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCATGTGGGCGAGGAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGaa > 1:3001767/1‑100 (MQ=255) cGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGaa > 2:928944/1‑100 (MQ=255) cGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGaa < 1:2200460/100‑1 (MQ=255) agaagaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAcg > 1:1710625/1‑100 (MQ=255) aagaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAcgcg < 1:394456/100‑1 (MQ=255) aagaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAcgcg < 1:470376/100‑1 (MQ=255) aagaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAAcgcg < 2:3291369/100‑1 (MQ=255) gaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtg < 1:744489/100‑1 (MQ=255) gaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtg < 2:3858841/100‑1 (MQ=255) gaTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtg < 1:3419122/100‑1 (MQ=255) aTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtgt < 2:3100781/100‑1 (MQ=255) aTGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCgtgt < 1:3196545/100‑1 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGtt < 2:1429762/100‑1 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGtt < 2:3218160/100‑1 (MQ=255) tGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGtt < 1:3705058/100‑1 (MQ=255) cAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTAcc > 2:206607/1‑100 (MQ=255) aGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGAACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGGACGCGTGTTACCa < 1:2631432/100‑1 (MQ=255) gAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAg < 2:342883/100‑1 (MQ=255) tGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGAc < 1:934784/100‑1 (MQ=255) gTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAg > 2:3157340/1‑100 (MQ=255) ttAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAgg < 1:1895276/100‑1 (MQ=255) tAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGTCGAGCAGGCGGACGTCAACAGTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGt > 2:3001906/1‑100 (MQ=255) tAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGt > 2:3072609/1‑100 (MQ=255) gCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTaa < 1:3964261/100‑1 (MQ=255) agagATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATg > 2:3175861/1‑100 (MQ=255) gaTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTc > 1:1102926/1‑100 (MQ=255) aTGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCg < 2:1877124/100‑1 (MQ=255) tGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGa > 1:4207739/1‑100 (MQ=255) gCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAg < 2:2249782/100‑1 (MQ=255) cGTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGc < 2:2006413/100‑1 (MQ=255) gTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCt > 2:3283313/1‑100 (MQ=255) gTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCt > 1:3340006/1‑100 (MQ=255) gTCCGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCt > 1:799811/1‑100 (MQ=255) cGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAt < 2:2613246/100‑1 (MQ=255) cGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAt < 1:3645755/100‑1 (MQ=255) cGGATCTCACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAt < 2:1954540/100‑1 (MQ=255) cGGATCTCACTTTCCCGCCGAAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAt < 1:2206973/100‑1 (MQ=255) ctcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaaaa < 1:1633317/100‑1 (MQ=255) ctcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaaaa > 2:448447/1‑100 (MQ=255) tcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACCTTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaaaaa > 1:954434/1‑100 (MQ=255) tcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTaaaaa > 2:4119348/1‑100 (MQ=255) tcACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCGGCTTaaaaa > 1:1535312/1‑100 (MQ=255) cACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAAc < 2:1096724/100‑1 (MQ=255) cACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAAc < 2:1096679/100‑1 (MQ=255) cACTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGAGTaaaaa > 1:4016259/1‑99 (MQ=255) aCTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGCGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAAc > 1:267479/1‑99 (MQ=255) aCTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACg < 1:738914/100‑1 (MQ=255) cTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGa > 2:1548312/1‑100 (MQ=255) cTTTCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGa > 2:3304789/1‑100 (MQ=255) tCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcg < 2:1659744/100‑1 (MQ=255) tCCCGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcg > 2:560214/1‑100 (MQ=255) cccGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcgc > 2:4178105/1‑100 (MQ=255) cccGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcgc > 2:2449708/1‑100 (MQ=255) cccGCCGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATcg > 2:3961451/1‑99 (MQ=255) cgccgcAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATCGCGt > 1:4123496/1‑100 (MQ=255) | GGCGCGCTGGTGATCCTTGAATCCACCTCGCCGGTGGGGTCAACCGAGAAGATGGCAGAATGGTTAGCAGAGATGCGTCCGGATCTCACTTTCCCGCAGCAGGTGGGCGAGCAGGCGGACGTCAACATTGCTTACTGCCCGGAACGCGTGTTACCAGGACAGGTAATGGTCGAGCTGATTAAAAACGATCGCGT > NC_000913/3971593‑3971786 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |