| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,310,728 | T→C | 53.6% | I85V (ATT→GTT) | alsA ← | D‑allose ABC transporter ATPase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,310,728 | 0 | T | C | 53.6% | 33.8 / 183.3 | 141 | I85V (ATT→GTT) | alsA | D‑allose ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/33); new base C (38/37); total (71/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.20e-01 | |||||||||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGA > NC_000913/4310632‑4310827 | taataTTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCATTCCGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAaacaat > 1:1067213/1‑100 (MQ=255) atatTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATcc < 1:684625/100‑1 (MQ=255) atTGACGCCACAGCTTTTTTTCGTCAGATTACGACCAATATATAAATTTACCAGTCCGGTTAATTCATCAATAACGCTGAATTCCTGATAAACAATcc > 1:3228803/1‑98 (MQ=255) atTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCg > 2:2014507/1‑100 (MQ=255) atTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCg < 2:3721921/100‑1 (MQ=255) ttGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGa > 2:1997566/1‑100 (MQ=255) tGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGAt < 1:3745280/100‑1 (MQ=255) gACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGAt > 1:3770959/1‑99 (MQ=255) gACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATa > 2:79109/1‑100 (MQ=255) gCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATAcc > 2:4237695/1‑99 (MQ=255) cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAg > 2:4102982/1‑100 (MQ=255) cacaGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAg > 1:552799/1‑100 (MQ=255) gATTTTTTTCGTCAGATGACGCCCAATATATCCATTTTCCAGTACGGTTACTTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCTATACCTAGTtg < 1:3998443/99‑1 (MQ=255) gATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATCCCGAGtt > 1:3692364/1‑98 (MQ=255) gATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTtgt < 1:1575772/100‑1 (MQ=255) ttttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGc > 1:784125/1‑100 (MQ=255) ttCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCgn < 1:3500428/98‑2 (MQ=255) gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATCCCGAGTTGTGCGGCTAAt > 2:3046319/1‑99 (MQ=255) gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAAtt > 2:67985/1‑100 (MQ=255) gTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAAtt > 1:3133475/1‑100 (MQ=255) tCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAAttt < 1:1766776/100‑1 (MQ=255) cAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTa > 2:3796855/1‑100 (MQ=255) cAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTa > 2:3982880/1‑100 (MQ=255) cAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGCTAATTCACCAATAACGCTTACTTCCTGATAAATAATCCACATACCAACTTGTAGCGCTAAttac > 1:4178131/1‑98 (MQ=255) aGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTa < 2:3352024/99‑1 (MQ=255) aGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTAt < 2:2536095/100‑1 (MQ=255) tGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGAt < 2:3376472/100‑1 (MQ=255) tGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGAt > 1:19789/1‑100 (MQ=255) tGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGAt < 2:3341792/100‑1 (MQ=255) acgacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATcc < 1:1685837/100‑1 (MQ=255) gacCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAg < 1:3987219/100‑1 (MQ=255) acCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAAGAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGc < 1:1923551/100‑1 (MQ=255) ccAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCt > 1:2201722/1‑100 (MQ=255) aaTATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTg > 1:3373986/1‑100 (MQ=255) aaTATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTg < 2:1589772/100‑1 (MQ=255) aaTATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTg < 1:79109/100‑1 (MQ=255) atatatAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGt < 1:2350550/100‑1 (MQ=255) tatataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGtt < 1:4218879/100‑1 (MQ=255) tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGCGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGCta > 1:1302797/1‑99 (MQ=255) tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtat > 2:1292366/1‑100 (MQ=255) tataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATCCCGAGTTGTGCCGCAAATTTATGATcc > 1:1115685/1‑90 (MQ=255) ataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtata < 2:3119517/100‑1 (MQ=255) ataAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTtata > 2:3031819/1‑100 (MQ=255) taAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAg > 2:1484427/1‑100 (MQ=255) taAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAg > 1:1464938/1‑100 (MQ=255) taAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAg > 2:272112/1‑100 (MQ=255) aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc > 2:942890/1‑100 (MQ=255) aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc < 2:583442/100‑1 (MQ=255) aaaTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGc < 1:14608/100‑1 (MQ=255) aTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTa > 1:2928986/1‑100 (MQ=255) aTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTa > 2:497934/1‑100 (MQ=255) aTTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTa < 1:1331485/100‑1 (MQ=255) tttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTTATAAACAATCCCGATACCGAGGTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAAt < 1:3005389/100‑1 (MQ=255) tttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAAt > 1:2667156/1‑100 (MQ=255) ttCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATg > 2:1711709/1‑100 (MQ=255) ccAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtt > 2:3820964/1‑100 (MQ=255) cAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGtta > 1:2203297/1‑100 (MQ=255) aGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttat < 1:1930587/100‑1 (MQ=255) aGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttat > 1:724810/1‑100 (MQ=255) gTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttatt > 2:215362/1‑100 (MQ=255) tACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGttatta > 2:2012571/1‑100 (MQ=255) cGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaat < 1:3308575/100‑1 (MQ=255) cGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaat > 2:461586/1‑100 (MQ=255) ggTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatg > 1:985280/1‑100 (MQ=255) aaTTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaa > 1:666744/1‑100 (MQ=255) ttCATCAATAACGCTGAGTTCCTTATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatg < 1:134669/100‑1 (MQ=255) tcatcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatgg < 2:4175862/100‑1 (MQ=255) tcatcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatgg > 1:3206327/1‑100 (MQ=255) tcatcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATtaatggtaatgg > 2:3480851/1‑100 (MQ=255) atcaATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTg > 2:703906/1‑100 (MQ=255) caATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGcc < 2:2859200/100‑1 (MQ=255) caATAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGcc < 2:1749578/100‑1 (MQ=255) aaTAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCt > 2:1074918/1‑100 (MQ=255) aaTAACGCTGAGTTCCTGATAAAAAATCCCGATACCGAGATGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTGATTaatggtaatggt > 1:4146473/1‑96 (MQ=255) aTAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCtt > 2:2209345/1‑100 (MQ=255) tAACGCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCttt < 1:648025/100‑1 (MQ=255) gCTGAGTTCCTGATATACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTc < 2:4214169/100‑1 (MQ=255) gCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTc < 2:814326/100‑1 (MQ=255) gCTGAGTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTc < 1:865386/100‑1 (MQ=255) tGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCgg > 2:2471925/1‑100 (MQ=255) gAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 2:4178153/100‑1 (MQ=255) gAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 2:2386552/100‑1 (MQ=255) gAGGTCCTGATAAATAATCCGGATACCGAGTTGTGCCGGTAATGTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGGTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc < 1:3015641/100‑1 (MQ=255) gTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGGTCCAGCTTGTTATAGCTGATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTc < 1:4070177/100‑1 (MQ=255) gTTCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGc > 1:2318567/1‑98 (MQ=255) tCCTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCAt > 2:3922552/1‑100 (MQ=255) ccTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:2729269/100‑1 (MQ=255) ccTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:2862295/100‑1 (MQ=255) ccTGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg > 1:3297325/1‑100 (MQ=255) ccTGATAAACAATCCCGATACAGAGGTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg > 1:3585396/1‑100 (MQ=255) cTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTTTGCCGCTAATTTATGTTCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:1845516/99‑1 (MQ=255) cTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt > 1:482620/1‑100 (MQ=255) cTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGt > 2:1339130/1‑100 (MQ=255) tGATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTa > 1:3872909/1‑100 (MQ=255) gATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAt > 2:2218918/1‑100 (MQ=255) gATAAACAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGATAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATg < 1:3869746/97‑1 (MQ=255) ataaacaaTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTAtt > 2:3989993/1‑100 (MQ=255) taaataaTCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTc > 2:2819408/1‑100 (MQ=255) ataatCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCgg > 2:2263478/1‑100 (MQ=255) taatCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGa < 1:448037/100‑1 (MQ=255) | TAATATTGACGCCACAGATTTTTTTCGTCAGATGACGACCAATATATAAATTTTCCAGTACGGTTAATTCATCAATAACGCTGAGTTCCTGATAAATAATCCCGATACCGAGTTGTGCCGCTAATTTATGATCCAGCTTGTTATAGCTAATGTTATTAATGGTAATGGTGCCTTTGGTCGGCTCATGTATTCCGGA > NC_000913/4310632‑4310827 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |