Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,117,238 | G→A | 44.2% | M144I (ATG→ATA) | yceA → | putative rhodanese‑related sulfurtransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,117,238 | 0 | G | A | 44.2% | 51.7 / 174.0 | 145 | M144I (ATG→ATA) | yceA | putative rhodanese‑related sulfurtransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/40); new base A (34/30); total (75/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.09e-01 |
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
GAAGGTACGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTC > NC_000913/1117139‑1117337 | aaGGTACGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGc < 1:1306898/100‑1 (MQ=255) ggTACGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCtt > 2:2022351/1‑100 (MQ=255) ggTACGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACtt > 2:1213376/1‑100 (MQ=255) gTACGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTg < 1:1497334/100‑1 (MQ=255) aCGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCCATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGa > 2:2330013/1‑99 (MQ=255) aCGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGAc < 1:2192985/100‑1 (MQ=255) aCGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGAc < 1:1829217/100‑1 (MQ=255) aCGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGAc < 2:1118683/100‑1 (MQ=255) aCGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGAc > 1:4069115/1‑100 (MQ=255) aCGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGAc < 1:3449807/100‑1 (MQ=255) cgcgATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACg < 2:3321479/100‑1 (MQ=255) gcgATCACATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGCAAGTGAACGCCATGCTTGACGa > 1:3860312/1‑100 (MQ=255) cgATCGCATTGTTGCCGACGGTGTTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGAt > 1:2483132/1‑100 (MQ=255) cgATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGAt > 1:2490740/1‑100 (MQ=255) cgATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGAt > 1:3128113/1‑100 (MQ=255) tCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATccc < 2:1572761/100‑1 (MQ=255) tCGCATTATCGCCGACGATATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCCATGTTGGTGAGTATCCGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATccc > 1:235759/1‑100 (MQ=255) cGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCg < 2:1449751/100‑1 (MQ=255) gCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGa > 2:526529/1‑100 (MQ=255) gCATTGTTGCAGACGGTATTGACGTTCCTCACTCTGACGTCAGCCACGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGa < 1:1050767/100‑1 (MQ=255) cATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGAt > 1:4018115/1‑100 (MQ=255) ttgttgCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGc < 2:93622/100‑1 (MQ=255) gttgCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCAc > 2:2484142/1‑100 (MQ=255) gttgCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCa > 2:935708/1‑99 (MQ=255) gttgCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCAc < 2:3428460/100‑1 (MQ=255) ttgCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACt < 2:1711023/100‑1 (MQ=255) cGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCACTGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTAttt > 2:1761130/1‑100 (MQ=255) gACGGTATTGACGATCCTCACATTGATGCCAGTAATTTTAGTGAGTAACTGCAAGCGGCGGATATGAACGCCATACTTGACGATACCGATGCACTAttt < 1:570057/99‑1 (MQ=255) cGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATTCACTCTTTATc > 1:2837830/1‑100 (MQ=255) cGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATc < 1:934051/100‑1 (MQ=255) cGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATc < 1:1025855/100‑1 (MQ=255) cGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATc < 2:4168841/100‑1 (MQ=255) cGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATc < 1:3981051/100‑1 (MQ=255) gTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGa > 2:1787391/1‑100 (MQ=255) gTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGa < 1:1837212/100‑1 (MQ=255) tATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGAc < 1:1163726/100‑1 (MQ=255) tGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATg > 1:3814071/1‑100 (MQ=255) gACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGc > 1:1779352/1‑100 (MQ=255) aCGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCg < 1:569193/100‑1 (MQ=255) aCGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCg < 2:1140167/100‑1 (MQ=255) gATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTa > 1:237674/1‑100 (MQ=255) ccTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGTCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAAcc > 1:335721/1‑100 (MQ=255) cTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCa > 1:3599069/1‑100 (MQ=255) cACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACt < 2:169355/100‑1 (MQ=255) cTTTGATGCCAGCAATGTTTGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTAt > 1:4196943/1‑100 (MQ=255) tttGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATg < 1:3285000/100‑1 (MQ=255) tttGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATg < 2:3249645/100‑1 (MQ=255) tGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAg < 1:2676799/100‑1 (MQ=255) atgtcagataTGTTGGTGAGTATCTGCAATCGTCGGATGTGAACGCCATGCTTTACCATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAg < 1:1585595/89‑1 (MQ=255) aTGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTa > 1:3357191/1‑100 (MQ=255) tGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTAt > 2:2938853/1‑100 (MQ=255) tGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTAt > 2:2939568/1‑100 (MQ=255) tGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAATCACTATGACTAt > 1:2551069/1‑100 (MQ=255) tGCCAGCAAAGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGACGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATTCGTCACCACTACGAGTAt > 1:1411910/1‑100 (MQ=255) ccAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGa < 2:3142585/100‑1 (MQ=255) ccAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGa > 1:4224422/1‑100 (MQ=255) ccAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGa > 1:1929355/1‑100 (MQ=255) cAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGaa > 2:314659/1‑100 (MQ=255) aGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCTCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAg < 1:2101908/100‑1 (MQ=255) aTGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg < 1:2972657/100‑1 (MQ=255) aTGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg > 2:3098770/1‑100 (MQ=255) aTGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg < 2:743028/100‑1 (MQ=255) aTGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTggg < 1:526527/100‑1 (MQ=255) tGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTgggg < 2:1162212/100‑1 (MQ=255) tGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTgggg < 2:3092096/100‑1 (MQ=255) tGTTGGTGAGTATCCGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTgggg > 2:3975702/1‑100 (MQ=255) gTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGc < 2:3493327/100‑1 (MQ=255) gTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGc > 2:1954957/1‑100 (MQ=255) gTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACtt > 2:1834888/1‑100 (MQ=255) tGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACttt > 2:3867092/1‑100 (MQ=255) gAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTg > 2:1638946/1‑100 (MQ=255) gAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTg > 2:1828768/1‑100 (MQ=255) aGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGa > 1:287679/1‑100 (MQ=255) gTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGaa < 1:662862/100‑1 (MQ=255) aTCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGaaaa < 2:394756/100‑1 (MQ=255) tCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTCTGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAc > 1:457098/1‑100 (MQ=255) ctacAAGCGGCGGAAGTGCACGCCATGCGTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACACGCGTAACCACTCTGCCTATGAAGTGAGGCACTTTGaaaa > 1:2969136/4‑98 (MQ=255) gCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAAcgcg > 2:2184878/1‑100 (MQ=255) aGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTc > 2:738140/1‑100 (MQ=255) ggcggAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaa < 1:1796485/100‑1 (MQ=255) gcggAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGaaa < 2:103348/100‑1 (MQ=255) cggAAGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAAt > 2:331401/1‑100 (MQ=255) aGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCg < 2:569308/100‑1 (MQ=255) aGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCg > 1:3400320/1‑100 (MQ=255) aGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCg > 1:141687/1‑100 (MQ=255) aGTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCg > 1:3714210/1‑100 (MQ=255) gTGAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCgg < 1:1055829/100‑1 (MQ=255) tGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGc < 2:1308803/100‑1 (MQ=255) tGAACCCCATGCTTGACGCTCCCGATGCAGTATTTATCGACATGCGTAACCCCTATGAGTATGAAGCGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGc < 1:2566946/100‑1 (MQ=255) gAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCa < 1:2143447/100‑1 (MQ=255) gAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCa > 2:2404949/1‑100 (MQ=255) gAACGCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCa < 2:1178399/100‑1 (MQ=255) aaCGCCATGCTTGACGATCCCGATGCATTGTTTATCGACGTGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTGGAAATTCCGGCAg < 1:3002885/100‑1 (MQ=255) gCCATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATa > 1:2759652/1‑100 (MQ=255) ccATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAc > 2:1601975/1‑100 (MQ=255) ccATGCTTGACGAGCCCGATGCACAATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAc < 2:4072674/100‑1 (MQ=255) ccATACTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATAc > 1:4167580/1‑100 (MQ=255) aTGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCt < 2:3998616/100‑1 (MQ=255) tGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCtt < 1:448857/100‑1 (MQ=255) gCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTc < 1:2022347/100‑1 (MQ=255) | GAAGGTACGCGATCGCATTGTTGCCGACGGTATTGACGATCCTCACTTTGATGCCAGCAATGTTGGTGAGTATCTGCAAGCGGCGGAAGTGAACGCCATGCTTGACGATCCCGATGCACTATTTATCGACATGCGTAACCACTATGAGTATGAAGTGGGGCACTTTGAAAACGCGCTCGAAATTCCGGCAGATACCTTC > NC_000913/1117139‑1117337 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |